Z: Brenda A. Wilson,‎ Abigail A. Salyers,‎ Dixie D. Whitt,‎ Malcolm E. Winkler: Bacterial Pathogenesis: A Molecular Approach, 3rd edition 2010 ASM Press, ISBN-13: 978-0632037759

Z:Kenneth Murphy, Casey Weaver: Janeway's Immunobiology, Ninth Edition (Immunobiology: The Immune System (Janeway), 2017, Garland Science, ISBN-13: 978-0815345053

D:Goering R., Dockrell H., Roitt I., et al.: Mims' Medical Microbiology, 2012, ELSEVIER, ISBN 9780808924401, 9780702056635.

Doporučená:

• Brenda A. Wilson, Malcolm Winkler, Brian T. Ho. Bacterial Pathogenesis: A Molecular Approach, 4th Edition. : ASM Press, 2019, s. ISBN 978-1-683-67288-3.
• Richard Goering, Hazel M. Dockrell, Mark Zuckerman, Peter L. Chiodini. Mims' Medical Microbiology and Immunology, 7th Edition. : Elsevier, 2023, s. ISBN .

Volitelná:

• Indira T. Kudva, Nancy A. Cornick, Paul J. Plummer, Qijing Zhang, Tracy L. Nicholson, John P. Bannantine, Bryan H. Bellaire. Virulence Mechanisms of Bacterial Pathogens, 5th Edition. : ASM Press, 2016, s. ISBN 978-1-555-81927-9.

Předmět je zakončen písemnou zkouškou a prezentací projektu.

1. Introduction

pathogens and infectious diseases; definition of virulence; Koch's postulates and molecular Koch’s postulates; virulence factors – categories and principles of action; types of pathogens; types of hosts

2. Evolution of bacterial pathogens

evolutionary pressures; horizontal genetic transfer; evolution of virulence factors

3. Ecology of bacterial pathogens within the host organism

regulation of gene expression of bacterial pathogens; detection of host clues; quorum sensing; metabolites and their roles in virulence and host interaction

interaction with the local microflora; bacteriocins and T6SS; acquisition of nutrients and essential metals

4. Routes of entry, modes of transmission and innate (non-specific) immunity

routes of entry and modes of transmission; barrier immune processes

complement system; pathogen-associated molecular patterns (PAMPs) and damage-associated molecular patterns (DAMPs); phagocyte response

5. Pathogenicity and virulence from the perspective of the pathogen

steps in successful infection and molecular mechanisms enabling bacterial pathogens to overcome innate immunity; secretion systems and cell biology of bacterial effector proteins and toxins

6. Methods of treatment

antibiotics and methods of increasing sensitivity to antibiotics; phage therapy; new therapeutic targets

7. Control and prevention

adaptive (specific) immunity; vaccines as tool for modulation of host response and protection from infection, mechanisms of escape; antigenic and phase variation; escape mutations

8. Research systems

experimental systems for host-pathogen interaction studies; state-of-art methodology

1. Úvod

patogeny a infekční onemocnění; definice virulence; Kochovy postuláty a molekulární Kochovy postuláty; faktory virulence – jejich kategorie a mechanismy působení, typy patogenů; typy hostitelů

2. Evoluce bakteriálních patogenů

evoluční tlaky; horizontální přenos genetické informace; evoluce faktorů virulence

3. Ekologie bakteriálních patogenů v organismu hostitele

regulace genové exprese bakteriálních patogenů; detekce signálů hostitele; quorum sensing; metabolity a jejich role ve virulenci a interakci s hostitelem

interakce s lokální mikroflórou; bakteriociny a T6SS; získávání živin a esenciálních kovů

4. Vstupní cesty, způsoby přenosu a vrozená (nespecifická) imunita

vstupní cesty a způsoby přenosu; bariérové imunitní procesy

komplementový systém; molekulární vzory asociované s patogeny (PAMPs) a s poškozením (DAMPs); odpověď fagocytů

5. Patogenita a virulence z pohledu patogenu

kroky úspěšné infekce a molekulární mechanismy umožňujícím bakteriálních patogenům překonávat vrozenou imunitu; sekreční systémy a buněčná biologie bakteriálních efektorových proteinů a toxinů

6. Metody léčby

antibiotika a metody zvyšování citlivosti k antibiotikům; fágová terapie; nové terapeutické cíle

7. Kontrola a prevence

adaptivní (specifická) imunita; vakcíny jako nástroj modulace odpovědi hostitele a ochrany před infekcí; mechanismy úniku; antigenní a fázová variabilita; únikové mutace

8. Výzkumné systémy

experimentální systémy pro studium interakcí hostitel–patogen; současné metodologické přístupy

Shared lecture slides

Sdílené prezentace k přednáškám

After completing this course, students will be able to:

1. characterize important human and veterinary pathogens, including foodborne bacteria

2. interpret experimental data and methodologies used in host–pathogen interaction studies

3. apply acquired knowledge to develop detection methods for infectious bacterial agents in food, and for the clinical diagnosis of infectious diseases

4. design and evaluate prevention strategies

Po absolvování předmětu budou studenti schopni:

1. charakterizovat významné lidské a veterinární patogeny, včetně bakterií přenášených potravou

2. interpretovat experimentální data a metodické postupy používané ve výzkumu interakcí mezi patogenem a hostitelem

3. aplikovat získané znalosti při vývoji metod detekce infekčních bakteriálních agens v potravinách a při klinické diagnostice infekčních onemocnění

4. navrhovat a hodnotit strategie prevence

Basic knowledge of biochemistry, microbiology, and molecular biology at the level taught in the bachelor’s degree program at UCT Prague.

základní znalosti biochemie, mikrobiologie a molekulární biologie v rozsahu vyučovaném v bakalářském studijním programu na VŠCHT