Attendance at lectures is recommended, but not controlled.

Účast na přednáškách je doporučená, není však kontrolována.

Recommended:

• Nielsen, S. Suzanne. Food analysis. New York: Kluwer, 2003, 557 s. s. ISBN 0-306-47495-6.
• Dickes, G. J., Nicholas, Peter Victor. Gas chromatography in food analysis. London: Butterworths, 1976, 393 s. s. ISBN 0-408-70781-X.
• Nollet, Leo M. L.. Food analysis by HPLC. New York: Marcel Dekker, 2000, 1049 s. s. ISBN 0-8247-8460-X.
• Smith, R. Martin. Understanding mass spectra, a basic approach. New York: Wiley-Interscience, 2004, xviii, 372 s. s. ISBN 0-471-42949-X.

Doporučená:

• Dickes, G. J., Nicholas, Peter Victor. Gas chromatography in food analysis. London: Butterworths, 1976, 393 s. s. ISBN 0-408-70781-X.
• Nielsen, S. Suzanne. Food analysis. New York: Kluwer, 2003, 557 s. s. ISBN 0-306-47495-6.
• Nollet, Leo M. L.. Food analysis by HPLC. New York: Marcel Dekker, 2000, 1049 s. s. ISBN 0-8247-8460-X.
• Smith, R. Martin. Understanding mass spectra, a basic approach. New York: Wiley-Interscience, 2004, xviii, 372 s. s. ISBN 0-471-42949-X.

The basis of the exam is a written test, consisting of five thematic areas. The student must obtain at least 50% in each area. If 50% is not met for only one thematic area, it is possible to repeat only this part in the form of an oral exam. If 50% is not met for more than one thematic area, the exam is graded F.

Základem zkoušky je písemný test, složený z pěti tematických okruhů. Z každého okruhu musí student získat minimálně 50%. Pokud 50% není splněno pouze pro jeden tematický okruh, je možné opakovat jen tuto část formou ústního dozkoušení. Pokud 50% není splněno z více tematických okruhů, je zkouška hodnocena stupněm F.

1. General requirements on quality of chromatographic and mass-spectrometric data, definition of basic concepts.

2. Connection of gas chromatography and mass spectrometry, ionization techniques, conventional detectors.

3. Connection of liquid chromatography and mass spectrometry, ionization techniques, conventional detectors.

4. Mass spectrometry (MS), different types of mass spectrometers, acquisition modes.

5. Interpretation of GC-MS spectra.

6. Interpretation of LC-MS spectra.

7. Mass spectrometry in food analysis.

8. Spectral libraries, retention indexes.

9. Spectral deconvolution, Software tools for an analyte identification/interpretation.

10. Application of targeted screening.

11. Quantification techniques.

12. Confirmation criteria in mass spectrometry.

13. Statistical methods for multivariate data analysis.

14. Software for automated data processing.

1. Obecné požadavky na kvalitu generových dat pomocí chromatografických a hmotnostně-spektrometrických technik; vymezení základních pojmů.

2. Spojení plynové chromatografie s hmotnostní spektrometrií, ionizační techniky v GC-MS, konvenční detektory.

3. Spojení kapalinové chromatografie s hmotnostní spektrometrií, ionizační techniky, konvenční detektory.

4. Hmotnostní spektrometrie (MS), typy hmotnostních spektrometrů, akviziční módy.

5. Interpretace GC-MS hmotnostních spekter.

6. Interpretace LC-MS hmotnostních spekter.

7. Hmotnostně-spektrometrická data v praxi - potraviny, životní prostředí a toxikologie.

8. Knihovny spekter, retenční indexy.

9. Spektrální dekonvoluce, software pro identifikaci analytů.

10. Aplikace cíleného screeningu screeningu.

11. Přehled a použití různých kvantifikačních postupů a technik.

12. Kriteria konfirmace výsledků při použití hmotnostní spektrometrie.

13. Významné multivariační statistické metody pro zpracování velkých objemů dat.

14. Využití software pro automatické procesování dat.

http://www.chem.arizona.edu/massspec/

http://www.ionsource.com/tutorial/spectut/spec1.htm

http://www.chemguide.co.uk/analysis/masspecmenu.html

http://webbook.nist.gov/chemistry/

http://www.chemspider.com/

http://www.massbank.jp/

http://metlin.scripps.edu/

http://fiehnlab.ucdavis.edu/

http://ec.europa.eu/food/plant/pesticides/eu-pesticides-database/public/?event=homepage&language=EN

http://www.chem.arizona.edu/massspec/

http://www.ionsource.com/tutorial/spectut/spec1.htm

http://www.chemguide.co.uk/analysis/masspecmenu.html

http://webbook.nist.gov/chemistry/

http://www.chemspider.com/

http://www.massbank.jp/

http://metlin.scripps.edu/

http://fiehnlab.ucdavis.edu/

http://ec.europa.eu/food/plant/pesticides/eu-pesticides-database/public/?event=homepage&language=EN

Students will be able to:

• Choose right separation technique (GC or LC) in combination with particular type of mass analyser for different analytical tasks. They will understand the basic characteristics of different ionization techniques and mass spectrometers.

• Analyse mass spectrum, find the molecular ion and analyse isotopic profile, calculate formula of simple moleule from an isotopic profile and calulate a number of double-bonds.

• Qualitatively analyse LC-MS and GC-MS data, apply correct smoothing algorithms, spectral deconvolution, to use mass spectra libraries and retention indexes for the identification of analytes.

• Quantify obtained data, confirm results, use different calibration approaches (external calibration cuve, method of standard addition, internal standards, isotopic dilution) in LC-MS and GC-MS.

• Apply different chemometric tools for the data structure and get the maximum of information from recorded data.

Studenti budou umět:

Pro konkrétní analytické úkoly zvolit vhodné separační techniky (GC nebo LC) ve spojení s různými typy hmotnostních analyzátorů. Rozumět základním charakteristikám jednotlivých ionizačních technik a hmotnostních analyzátorů, jejich možnostem a limitacím.

Vyhodnotit hmotnostní spektrum, určí molekulový ion a vyhodnotí izotopový profil, vypočítat sumární vzorec z izotopového profilu jednoduché organické molekuly, vypočítat počet dvojných vazeb).

Kvalitativně vyhodnotit LC–MS a GC–MS data, Vědět kdy a jak aplikovat vyhlazovací algoritmy, spektrální dekonvoluci, využít knihovny spekter, posoudit kvalitu a specifičnost nalezených spekter, využít retenční indexy pro identifikaci analytů.

Kvantifikovat naměřená data, konfirmovat výsledek analýzy podle aktuální legislativy, využít různé kalibrační postupy (kalibrační křivka, standardní přídavek, vnitřní standard, izotopové zřeďování apod.).

Pochopit princip a základní úskalí multivariační analýzy. Aplikovat různé chemometrické nástroje pro zjištění struktury dat a získání maxima užitečných informací z naměřených dat.

Basic knowledge of analytical and organic chemistry within the scope taught in the bachelor's degree program at the UCT Prague.

základní znalosti analytické a organické chemie v rozsahu vyučovaném v bakalářském SP na VŠCHT Praha