The aim of the course is to describe applications of bioinformatics in various scientific fields, and to defined their synergy. Bioinformatics projects in imunology, pharmacy, and in other life science disciplines will be discussed. Students will get acquainted with legal, ethical and commercial issues in bioinformatics, and will be informed about authorship and intellectual property rights. Important international bioinformatics integration proojects will also be introduced.
Last update: Hladíková Jana (04.01.2018)
Cílem předmětu je seznámit studenty s aplikacemi bioinformatiky napříč obory a definovat jejich synergii. Probírány budou koncepty bioinformatických projektů v imunologii, farmacii a ostatníci oborech Life Science. Studenti se též obeznámí s právními, etickými a komerčními důsledky využití bioinformatiky a budou poučeni o autorství a patentové ochraně při zveřejňování výsledků. Přestaveny též budou významné evropské a světové integrační bioinformatické projekty.
Aim of the course -
Last update: Hladíková Jana (04.01.2018)
Students will be able to:
Create and assess a bioinformatics project.
Evaluate legal and economical aspects of bioinformatics projects.
Search in patent databases.
Will know about principal international bioinformatics projects.
Judge economical demands of the bioinformatics research in a given area.
Last update: Hladíková Jana (04.01.2018)
Studenti budou umět:
Vytvořit a posoudit bioinformatický projekt.
Zhodnotit právní a ekonomické aspekty bioinformatických projektů.
Vyhledávat v databázi patentů.
Budou mít přehled o stěžejních bioinformatických projektech v Evropě i mimo Evropu.
Posoudit eknomickou náročnost bioinformatického výzkumu v dané oblasti.
Literature -
Last update: Svozil Daniel prof. Mgr. Ph.D. (04.11.2018)
R: Cvrčková F., Úvod do praktické bioinformatiky, Academia, 2006, ISBN:80-200-1360-1
R: Zvárová J., Biomedicínská informatika V.- Metody molekulární biologie a bioinformatiky, Karolinum, 2013, ISBN: 9788024621500
R: CS Clair, JE Visick, Exploring Bioinformatics: A Project-Based Approach, Jones and Bartlett Publishers 2013, ISBN: 978-1284034240
A: Edward H. Shortliffe, James J. Cimino, Biomedical Informatics: Computer Applications in Health Care and Biomedicine, Springer 2014, ISBN: 978-1447144731
Last update: Svozil Daniel prof. Mgr. Ph.D. (04.11.2018)
Z: Cvrčková F., Úvod do praktické bioinformatiky, Academia, 2006, ISBN:80-200-1360-1
Z: Zvárová J., Biomedicínská informatika V.- Metody molekulární biologie a bioinformatiky, Karolinum, 2013, ISBN: 9788024621500
Z: CS Clair, JE Visick, Exploring Bioinformatics: A Project-Based Approach, Jones and Bartlett Publishers 2013, ISBN: 978-1284034240
D: Edward H. Shortliffe, James J. Cimino, Biomedical Informatics: Computer Applications in Health Care and Biomedicine, Springer 2014, ISBN: 978-1447144731
Learning resources -
Last update: Hladíková Jana (04.01.2018)
none
Last update: Hladíková Jana (04.01.2018)
žádné
Syllabus -
Last update: Hladíková Jana (04.01.2018)
1. Bioinformatics in biology
2. Bioinformatics in Life Sciences - conventions, data resources, projects
3. Bioinformatics in pharmacology
4. Bioinformatics in imunology
5. Bioinformatics in agriculture
6. Bioinformatics in forestry and in environment protection
7. Geoinformatics
8. Legal, ethical, and commercial aspects of bioinformatics I
9. Legal, ethical, and commercial aspects of bioinformatics II
10. Biosensing
11. Bioinformatics applications in medicine
12. European integrative bioinformatics projects
13. Worldwide integrative bioinformatics projects
14. Bioinformatics in education
Last update: Hladíková Jana (04.01.2018)
1. Bioinformatika v biologii
2. Bioinformatika v Life Sciences - konvence, datové zdroje, projekty
3. Bioinformatika ve farmacii
4. Bioinformatika v imunologii
5. Bioinformatika v zemědělství
6. Bioinformatika v lesnictví a ochraně životního prostředí
7. Geoinformatika
8. Právní, etické a komerční otázky bioinformatiky I
9. Právní, etické a komerční otázky bioinformatiky II
10. Biosensing
11. Výhledy a využití bioinformatiky v lékařství a diagnostice
12. Evropské integrační bioinformatické projekty
13. Světové bioinformatické projekty a jejich souvislosti
14. Bioinformatika a její výuka
Registration requirements -
Last update: Hladíková Jana (04.01.2018)
Biochemistry, Molecular genetics, Introduction to bioinformatics
Last update: Hladíková Jana (04.01.2018)
Biochemie, Molekulární genetika, Základy bioinformatiky
Course completion requirements -
Last update: Svozil Daniel prof. Mgr. Ph.D. (26.01.2018)
The final exam is written.
Last update: Svozil Daniel prof. Mgr. Ph.D. (08.02.2018)
Závěrečná zkouška je písemná.
Teaching methods
Activity
Credits
Hours
Účast na přednáškách
1
28
Příprava na přednášky, semináře, laboratoře, exkurzi nebo praxi