Students will be able to:

Utilize the methodology of X-ray diffraction analysis in the form of their own experiments.

Interpret the results of X-ray diffraction analysis from databases and literature.

Propose appropriate analytical methods for the solution associated with the solid state phase's analysis.

Studenti budou umět:

Využívat metodiku RTG-strukturní analýzy jak formou vlastních experimentů

Interpretovat výsledky RTG-strukturní analýzy z databází a literatury.

Navrhovat vhodné analytické metody pro řešení spojené s analýzou pevné fáze.

Exam - 3 questions.

Zkouška - 3 otázky.

A: Kratochvíl B., Chemie a fyzika pevných látek I, VŠCHT Praha, 1994, 8070801964

A: Kratochvíl B., Jenšovský L., Úvod do krystalochemie, SNTL Praha, 1987, 0460887

A: Giacovazzo C., Fundamentals of Crystallography, Oxford Science Publications, 1992,

D:Kratochvíl B., Chemie a fyzika pevných látek I, VŠCHT Praha, 1994, 8070801964

D:Kratochvíl B., Jenšovský L., Úvod do krystalochemie, SNTL Praha, 1987, 0460887

D:Giacovazzo C., Fundamentals fo Crystallography, Oxford Science Publications, 1992

1. Crystal structure. Space groups, application, matrix representation.

2. Types of radiation used for crystallographic studies and their characteristics.

3. Sources of radiation for crystallographic studies.

4. Bragg equation, Evald construction. Geometrical model of diffraction experiment.

5. Different arrangement of diffraction experiments, in terms of radiation used and sample type.

6. Atomic scattering factor, structure factor, anomalous dispersion.

7. Measuring on the four-circle diffractometer.

8. Correction's of diffraction data.

9. Methods for solving the phase problem. Charge flipping methods.

10. Structure refinement from the diffraction data. Absolute structure determination, restrains, modulated structures.

11. Specific problems of biological macromolecules structures solution.

12. Solution of crystal structures from powder diffraction data. Rietveld method. Utilising CSD for solution. Building models of the molecules.

13. Methods for solving crystal structures based on electron microscopy.

14. Databases of crystallographic data. Structure prediction.

1. Krystalové soustavy. Prostorové grupy , použití, maticová reprezentace.

2. Typy záření používané pro krystalografické studie, jejich charakteristika.

3. Zdroje záření pro krystalografické studie.

4. Braggova rovnice, Evaldova konstrukce. Geometrický model difrakčního experiment.

5. Různá uspořádání difrakčních experimentů z hlediska použité radiace a typu vzorku.

6. Atomový rozptylový faktor, strukturní factor, anomální disperse.

7. Postup měření na čtyřkruhovém difraktometru.

8. Korekce difrakčních dat.

9. Metody řešení fázového problému. Metoda charge flipping.

10. Upřesňování struktury z difrakčních dat. Určení absolutní konfigurace, restrainy, modulované struktury.

11. Specifické problémy řešení struktur biologických makromolekul.

12. Řešení krystalové struktury z práškových dat. Rietveldova metoda. Využití dat z CSD pro řešení z prášku.

Tvorba modelů molekul.

13. Metody řešení krystalových struktur založené na elektronové mikroskopii.

14. Databáze krystalografických dat. Predikce struktury.