Students will understand the principles of modern separation and detection techniques based on high-resolution gas and liquid chromatography with different types of mass spectrometric detectors. They will get the knowledge of mass spectra interpretation, and learn about different softwares used for analytes identification and quantification. They will be able to implement target analyzes and non-target screening, taking into account available analytical instrumentation, and will have the knowledge necessary to properly evaluate and interpret the measured data.

Studenti po absolvování předmětu porozumí principům moderních separačně-detekčních technik na bázi vysokorozlišovací plynové a kapalinové chromatografie s různými typy hmotnostně-spektrometrických detektorů. Naučí se interpretovat hmotnostní spektra a seznámí se s řadou softwarů používaných pro identifikaci analytů a kvantifikaci analytů. Budou schopni realizace cílových analýz i necílového screeningu, s ohledem na dostupnou analytickou instrumentaci, a budou disponovat znalostmi nutnými k řádnému vyhodnocení a interpretaci naměřených dat.

oral exam, passing the test

ústní zkouška, absolvování testu

Pradip K. Ghosh: Introduction to Protein Mass Spectrometry, 2015, ISBN: 978-0-12-802102-6, Elsevier

Mike S. Lee: Mass Spectrometry Handbook, 2012, ISBN:9780470536735, Wiley

Vitha, MF: Chromatography - Principles and Instrumentation, 2016, ISBN: 9781119270881, Wiley

Z: Kind T., Tsugawa H., Cajka T., Ma Y., Lai Z., Mehta S.S., Wohlgemuth G., Barupal D.K., Showalter M.R., Arita M., Fiehn O.: Identification of small molecules using accurate mass MS/MS search. Mass Spec Rev. 2017;9999:1–20.

Pradip K. Ghosh: Introduction to Protein Mass Spectrometry, 2015, ISBN: 978-0-12-802102-6, Elsevier

Mike S. Lee: Mass Spectrometry Handbook, 2012, ISBN:9780470536735, Wiley

Vitha, MF: Chromatography - Principles and Instrumentation, 2016, ISBN: 9781119270881, Wiley

Z: Kind T., Tsugawa H., Cajka T., Ma Y., Lai Z., Mehta S.S., Wohlgemuth G., Barupal D.K., Showalter M.R., Arita M., Fiehn O.: Identification of small molecules using accurate mass MS/MS search. Mass Spec Rev. 2017;9999:1–20.

Lectures

Přednášky vyučujících

None.

Nejsou.

1. General requirements for the quality of data generated by chromatographic and mass spectrometric techniques; definition of basic concepts.

2. Gas chromatography coupled with mass spectrometry, ionization techniques in GC-MS, conventional detectors.

3. Liquid chromatography coupled with mass spectrometry, ionization techniques, conventional detectors.

4. Mass spectrometry (MS), types of mass spectrometers, acquisition modes.

5. Interpretation of GC-MS mass spectra.

6. Interpretation of LC-MS mass spectra.

7. Mass spectrometry data in food analysis.

8. Library spectra, retention indices.

9. Spectral deconvolution, software for identifying / interpreting analytes.

10. Application of non-target screening in food analysis.

11. Overview and application of different quantification techniques.

12. Criteria for confirmation in mass spectrometry.

13. Significant statistical methods for data processing.

14. Software for automatic data processing.

1. Obecné požadavky na kvalitu generových dat pomocí chromatografických a hmotnostně-spektrometrických technik; vymezení základních pojmů.

2. Spojení plynové chromatografie s hmotnostní spektrometrií, ionizační techniky v GC-MS, konvenční detektory.

3. Spojení kapalinové chromatografie s hmotnostní spektrometrií, ionizační techniky, konvenční detektory.

4. Hmotnostní spektrometrie (MS), typy hmotnostních spektrometrů, akviziční módy.

5. Interpretace GC-MS hmotnostních spekter.

6. Interpretace LC-MS hmotnostních spekter.

7. Hmotnostně-spektrometrická data v analýze potravin.

8. Knihovny spekter, retenční indexy.

9. Spektrální dekonvoluce, software pro identifikaci/interpretaci analytů.

10. Aplikace necílového screeningu v analýze potravin.

11. Přehled a použití různých kvantifikačních postupů a technik.

12. Kriteria konfirmace ve spojení s hmotnostní spektrometrií.

13. Významné statistické metody pro zpracování dat.

14. Využití software pro automatické procesování dat.

https://massbank.eu/MassBank/

https://www.mzcloud.org/

https://chemdata.nist.gov/

www.bio-rad.com/en-cn/product/mass-spectral-databases

https://massbank.eu/MassBank/

https://www.mzcloud.org/

https://chemdata.nist.gov/

www.bio-rad.com/en-cn/product/mass-spectral-databases

None.

Nejsou.

None

Nejsou.