Bioorganic chemistry has expanded rapidly over the past two decades, enriching the disciplines of biology and chemistry and providing important insights into molecular level of the processes in biological systems. The course of Bioorganic chemistry of saccharides and nucleic acids covers the area at the interface between organic chemistry and biochemistry or biology. It comprises chemical and enzymatic synthesis of simple and complex carbohydrates and nucleotides and modern analytical methods of their structure and reviews the ways in which carbohydrates mediate binding to cell and subcellular targets such as DNA, proteins, and antibody binding sites. It also provides the biosynthesis of carbohydrates and nucleotides. Importance of their analogs as molecular tools for biological studies and existing or potential drugs will be covered as well as their synthesis.
Last update: Parkan Kamil (08.11.2018)
Bioorganická chemie se během posledních dvou desetiletí rychle rozšířila, poskytla důležité informace o fungování biologických systémů na molekulární úrovni.
Kurz Bioorganická chemie sacharidů a nukleových kyselin pokrývá oblast na pomezí organické chemie, biochemie a biologie. Zahrnuje chemickou a enzymatickou syntézu jednoduchých a komplexních sacharidů (nukleosidů) a moderní metody pro analýzu struktury sacharidů (nukleosidů) a prozkoumává způsoby, jakými sacharidy zprostředkovávají vazbu na buňky a na cílové makromolekuly, jako jsou DNA, proteiny a vazebná místa protilátek.
Dále bude probírána důležitost jejich analogů jako molekulárních nástrojů pro biologická studia a jako základů existujících či potenciálních léčiv včetně jejich přípravy.
Last update: Parkan Kamil (08.11.2018)
Aim of the course -
Students will be able to:
understand the structure and function of saccharides and nucleic acid
chemical and enzymatic synthesis of oligosaccharides, oligonucleosides and their analogs
understand molecular principles and reaction mechanism of biological and biochemical processes
Last update: Parkan Kamil (21.06.2018)
Studenti budou umět:
rozumět struktuře a funkci sacharidů a nukleových kyselin
chemické a enzymatické syntézy oligosacharidů, oligonukleotidů a jejich analogů
molekulární principy a reakční mechanismy biologických a biochemických procesů
Last update: Parkan Kamil (21.06.2018)
Course completion requirements -
Evaluation of presentation on current topic from the field of bioorganic chemistry of saccharides or nucleic acids. It is compulsory to pass written examination test with the result at least 60 %.
Last update: Parkan Kamil (21.06.2018)
Hodnocená prezentace aktuálního tématu z oblasti bioorganické chemie sacharidů nebo nukleových kyselin. Úspěšné absolvování písemné zkoušky s výsledkem nejméně 60 %.
Last update: Parkan Kamil (21.06.2018)
Literature -
Recommended:
Sidney M. Hecht. Bioorganic Chemistry: Carbohydrates. : Oxford University Press, 1999, s. ISBN 9780195084696.
Sidney M. Hecht. Bioorganic Chemistry: Nucleic Acids. : Oxford University Press, 1996, s. ISBN 9780195084672.
Gabius, Hans-Joachim. The sugar code, fundamentals of glycosciences. Chichester, Weinheim: Wiley , 2009, s. ISBN 978-3-527-32089-9.
B. Ernst, G. W. Hart, P. Sinay. Carbohydrates in Chemistry and Biology. Verlag, Weinheim.: Wiley, 2000, s. ISBN 9783527295111.
Last update: Parkan Kamil (02.09.2024)
Doporučená:
Sidney M. Hecht. Bioorganic Chemistry: Carbohydrates. : Oxford University Press, 1999, s. ISBN 9780195084696.
Sidney M. Hecht. Bioorganic Chemistry: Nucleic Acids. : Oxford University Press, 1996, s. ISBN 9780195084672.
Gabius, Hans-Joachim. The sugar code, fundamentals of glycosciences. Chichester, Weinheim: Wiley ;, Wiley [distributor], 2009, s. ISBN 978-3-527-32089-9.
B. Ernst, G. W. Hart, P. Sinay. Carbohydrates in Chemistry and Biology. Weinheim: Wiley -VCH Verlag, 2000, s. ISBN 9783527295111.
Last update: Parkan Kamil (02.09.2024)
Teaching methods - Czech
Přednášky vyučujících, prezentace studentů na jimi zvolené a zpracované téma zahrnující samostudium.
Last update: Parkan Kamil (21.06.2018)
Syllabus -
The first part will be focused to understanding basic physical, chemical, and biological properties of saccharides and nucleic acids. a) stereochemistry, biological functions, b) chemical and enzymatic synthesis of glycosides and nucleic acid components.
The second part will be devoted to understanding biochemical processes a) models of cellular saccharide epitops, b) recognition of saccharide antigens by antibodies, c) interaction between proteins and saccharides.
The third part will deal with a) drug design, b) synthesis of analogs of saccharides and nucleosides.
Last update: Parkan Kamil (21.06.2018)
První blok předmětu je zaměřen na pochopení základních fyzikálních, chemických a biologických vlastností sacharidů a nukleových kyselin. a) stereochemii, názvosloví, základní biologické funkce, b) chemickou a enzymatickou syntézu glykosidů a nukleových kyselin
Druhy blok přednášek cílí na pochopení biochemických procesů a) modely buněčných sacharidových epitopů, b) rozpoznávání sacharidových antigenů protilátkami, c) interakci mezi proteinem/enzymem a sacharidy
Třetí blok klade důraz na a) potenciální návrh nových léčiv, b) syntézu analogů glykosidů a nukleosidů.
Last update: Parkan Kamil (08.11.2018)
Learning resources -
Copies of all presentation available from the lecturer.
Last update: Parkan Kamil (21.06.2018)
Studijní materiály k přednáškám u vyučujícího. (kopie všech prezentací)
