• Attendance at lectures is recommended but neither mandatory nor monitored.

• Attendance at seminars is mandatory and may be monitored.

• During the seminars, students are required to complete two credit tests.

• Oral checks of students’ preparedness may take place both during seminars and lectures.

• Consultations can be organized upon the student’s request and by mutual agreement.

• Course completion: The requirement for obtaining the course credit is to pass two interim tests with a score above 50%. The course is completed by an oral examination.

• Účast na přednáškách je doporučená, ale není povinná ani kontrolovaná.

• Účast na cvičeních je povinná a může být průběžně kontrolována.

• V rámci cvičení studenti píší dva zápočtové testy.

• Ústní přezkoušení připravenosti studentů může probíhat jak na cvičeních, tak na přednáškách.

• Konzultace mohou být organizovány po dohodě se studentem na jeho žádost.

• Zakončení předmětu: Podmínkou pro udělení zápočtu jsou dva průběžné testy s výsledkem nad 50 %. Předmět je ukončen ústní zkouškou.

R: McMurry J.: Organic chemistry, 8th Ed., Brooks/Cole, Cengage Learning, 2012, 9780840054449

Povinná:

• Prouza, Vít, Zýka, Jakub. Bioorganická chemie přírodních látek. Praha: Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, 2022, https://e-learning.vscht.cz/course/view.php?id=1076 s. ISBN 9788075921499.

Doporučená:

• McMurry, John, Budka, Jan, Cibulka, Radek, Dvořák, Dalimil, Kvíčala, Jaroslav, Lhoták, Pavel, Svoboda, Jiří. Organická chemie. Brno, Praha: Vysoké učení technické v Brně/nakladatelství VUTIUM; Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, 2015, 1178 s. ISBN 9788021447691.

• Lectures supported by presentations and practical examples.

• Frontal interactive teaching: the instructor presents the material while students are actively involved through short activities (questions, discussions).

• Discussions during lectures focused on critical thinking and exchange of ideas.

• Case studies – applying theory to real-world examples from natural product chemistry and bioorganic chemistry.

• Seminars focused on solving practical tasks based on the theoretical knowledge from lectures.

• Solving problems individually and in pairs, emphasizing consultation and discussion of solution strategies.

• Analysis of more complex tasks through discussion and independent work.

• Interactive discussions and problem-solving at the board to develop argumentation and analytical thinking.

• Formative assessment and continuous feedback during the seminars.

• Přednášky s využitím prezentací a praktických příkladů.

• Frontální interaktivní výuka: učitel prezentuje učivo a studenti jsou průběžně zapojováni krátkými aktivitami (otázky, diskuse).

• Diskuse během přednášek zaměřené na kritické myšlení a výměnu názorů.

• Práce s případovými studiemi – aplikace teorie na reálné příklady z oblasti přírodních látek a bioorganické chemie.

• Cvičení zaměřená na řešení praktických úloh vycházejících z teoretických poznatků z přednášek.

• Řešení příkladů individuálně i ve dvojicích, s důrazem na konzultaci a diskuzi postupů řešení.

• Analýza složitějších úloh prostřednictvím diskusí a samostatné práce.

• Interaktivní diskuse a řešení příkladů na tabuli, rozvoj argumentace a analytického myšlení.

• Formativní hodnocení a průběžná zpětná vazba během cvičení.

The examination consists of an oral part.

The oral examination can only be taken after obtaining at least 50% from both course credits.

The course credit is awarded based on the completion of two interim written tests. Credit is granted if the average score of these tests is at least 50% (each test is scored from 0 to 100 points). If the average score is below 50%, the student must pass a comprehensive make-up test with a minimum of 50 points out of 100 to obtain the credit.

The final grade is based solely on the result of the oral examination. Passing both course credits is a necessary condition for taking the oral exam.

If the course credit is not obtained, the course grade is automatically recorded as F.

Zkouška má ústní formu. K ústní zkoušce lze přistoupit pouze po získání zápočtu.

Pro získání zápočtu je nutné absolvovat dva průběžné písemné testy. Zápočet je udělen v případě dosažení průměrného hodnocení alespoň 50 % ze všech testů (každý test je hodnocen procentuálně, tj. 0–100 %). Pokud je průměr nižší než 50 %, je podmínkou zápočtu úspěšné absolvování souhrnného opravného testu s minimálním ziskem 50 % bodů.

Výsledná známka je stanovena na základě ústní zkoušky. Splnění zápočtových požadavků je nezbytnou podmínkou pro přístup ke zkoušce. Pokud student nezíská zápočet, nemůže konat ústní zkoušku a předmět je hodnocen stupněm F.

1. Bioorganic chemistry – definition of natural products, overview, occurrence, and nomenclature

2. Stereochemistry of natural products, chirality

3. Isolation of compounds, structure determination

4. Relationships between structure, biogenesis, and biological activity

5. Monosaccharides, nucleophilic addition to carbonyl groups

6. Oligosaccharides and polysaccharides

7. Amines – basicity and nucleophilicity

8. Alkaloids, nucleosides, drugs, and pharmaceuticals

9. Hydroxy acids – acidity

10. Amino acids, peptides, and proteins

11. Lipids and prostaglandins

12. Terpenoids – electrophilic addition, polyphenols

13. Antibiotics, drugs, pharmaceuticals, patent policy

14. Determination of metabolic pathways – precursor labeling, metabolite tracking, food adulteration

1. Bioorganická chemie – definice přírodních látek, přehled, výskyt a názvosloví

2. Stereochemie přírodních látek, chiralita

3. Izolace sloučenin, stanovení struktury

4. Vztahy mezi strukturou, biogenezí a biologickou aktivitou

5. Monosacharidy, nukleofilní adice na karbonylovou skupinu

6. Oligosacharidy a polysacharidy

7. Aminy – bazicita a nukleofilita

8. Alkaloidy, nukleosidy, drogy a léčiva

9. Hydroxykyseliny – kyselost

10. Aminokyseliny, peptidy a proteiny

11. Lipidy a prostaglandiny

12. Terpenoidy – elektrofilní adice, polyfenoly

13. Antibiotika, drogy, léčiva, patentová politika

14. Určování metabolických cest – značení prekurzorů, sledování metabolitů, falšování potravin

Lecture notes

PowerPoint presentations

Textbook: Prouza, Vít, Zýka, Jakub. Bioorganic Chemistry of Natural Products. Prague: University of Chemistry and Technology, Prague, 2022. ISBN 978-80-7592-149-9. Available online: UCT e-learning portal

Poznámky k přednáškám

PowerPointové prezentace

Kniha: Prouza, Vít, Zýka, Jakub. Bioorganická chemie přírodních látek. Praha: Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, 2022. ISBN 978-80-7592-149-9. Dostupné online: e-learning VŠCHT

Students will be able to:

1. Correctly apply the nomenclature of organic compounds in both written and oral communication.

2. Describe the structure, properties, reactions, and biogenesis of major groups of natural products, and understand the relationship between structure and biological activity.

3. Determine the configuration, chirality, and probable conformations of organic molecules based on structural formulas.

4. Illustrate and explain the reaction mechanisms of fundamental types of chemical and biochemical reactions.

5. Apply theoretical knowledge to solving practical problems related to natural products and bioorganic chemistry.

Competencies developed by the course:

• Professional knowledge and skills:

Understanding the structure, properties, reactivity, and biosynthesis of natural products. Ability to correctly apply organic nomenclature and explain reaction mechanisms and the relationships between structure and function.

• Analytical and critical thinking:

Ability to analyze structural formulas and molecular stereochemistry, and to apply knowledge in solving practical problems and case studies.

• Independent problem-solving:

Development of the ability to work independently when solving chemical and biochemical problems and to design strategies for addressing more complex tasks.

• Teamwork:

Development of skills in consulting and discussing solution approaches and collaborating on assignments during seminars.

• Communication skills:

Ability to present solutions using professional terminology, discuss results, and accurately communicate in the field of natural product chemistry.

• Capacity for further professional development:

Preparation of students for advanced studies in bioorganic chemistry, biochemistry, pharmaceutical chemistry, and natural product research.

Studenti budou schopni:

1. Správně používat názvosloví organických sloučenin v písemné i ústní komunikaci.

2. Popsat strukturu, vlastnosti, reakce a biogenezi hlavních skupin přírodních látek a porozumět vztahu mezi strukturou a biologickou aktivitou.

3. Určit konfiguraci, chiralitu a pravděpodobné konformace organických molekul na základě strukturních vzorců.

4. Znázornit a vysvětlit reakční mechanismy základních typů chemických a biochemických reakcí.

5. Aplikovat teoretické poznatky na řešení praktických úloh souvisejících s přírodními látkami a bioorganickou chemií.

Kompetence rozvíjené předmětem

• Odborné znalosti a dovednosti:

Pochopení struktury, vlastností, reaktivity a biogeneze přírodních látek. Schopnost správně aplikovat organické názvosloví a vysvětlit reakční mechanismy a souvislosti mezi strukturou a funkcí.

• Analytické a kritické myšlení:

Schopnost analyzovat strukturní vzorce a stereochemii molekul, aplikovat poznatky při řešení praktických úloh a případových studií.

• Samostatné řešení problémů:

Rozvoj schopnosti samostatně pracovat při řešení chemických a biochemických problémů a navrhovat strategie řešení složitějších úloh.

• Týmová spolupráce:

Podpora rozvoje dovedností konzultovat a diskutovat postupy řešení, spolupracovat na úkolech při cvičeních.

• Komunikační dovednosti:

Schopnost prezentovat odborným jazykem řešení úloh, diskutovat výsledky a přesně komunikovat v oblasti chemie přírodních látek.

• Schopnost dalšího odborného rozvoje:

Příprava studentů na navazující studium v oblasti bioorganické chemie, biochemie, farmaceutické chemie a výzkumu přírodních látek.

B110001 Organic Chemistry A, B110002 Organic Chemistry B

Znalosti v rozsahu předmětů Organická chemie (A+B) nebo Organická chemie (I+II)