Participation in practical lessons

Elaboration of reports from individual tasks

Presentation of the final project

Účast na praktické výuce

Vypracování protokolů z jednotlivých úloh

Prezentace závěrečného projektu

Obligatory:

• e-learnig course [online]. Dostupné z: https://e-learning.vscht.cz/course/view.php?id=423

Povinná:

• Výukový materiál v e-learningu [online]. Dostupné z: https://e-learning.vscht.cz/course/view.php?id=423

Students work individually or in groups in the laboratory under the supervision of an expert instructor, carrying out assigned tasks. For specific assignments, they collect original data, which they then independently process and present in the form of reports. At the end of the course, students present their results.

Studenti pracují ve skupinách nebo jednotlivě v laboratoři a pod vedením odborného dozoru vykonávají zadané úlohy. Pro konkrétní úlohy získávají originální data, která dále samostatně zpracovávají do výstupů uvedených v protokolu/protokolech. V závěru kurzu studenti své výsledky prezentují.

Attendance at laboratory sessions is mandatory (each laboratory block begins with an entry quiz to assess students’ preparedness).

Successful course completion also requires submission of lab reports for the completed assignments and a personal presentation of the obtained results.

Účast na laboratorních úlohách je povinná (vstupní přezkoušení v každém laboratorním bloku ke kontrole připravenosti studentů).

Podmínkou plnění předmětu je dále zpracování protokolů k absolvovaným úlohám a osobní odprezentování získaných výsledků.

Upstream processes: Preparation of cultivation media, selection and propagation of microbial cultures, inoculum preparation, and storage of production strains

Cultivation: Growth in liquid media and on solid substrates; determination of growth parameters

Strain modification, expression, isolation, and purification of recombinant proteins

Metabolite analysis: HPLC, UHPLC, and GC techniques

DNA and protein analysis: Isolation, PCR, and electrophoretic methods

Culture analysis: Microscopy and flow cytometry

Bioreactor processes: Design of cultivation strategies, bioreactor setup, and cultivation in bioreactors

Biofilm studies: Monitoring bacterial biofilm formation and evaluating the effects of active substances on adhesion and eradication

Biostimulant application: Preparation and use of biostimulant formulations; evaluation of plant response using 3D scanning and multispectral imaging

Independent project work

Project presentation

1. Up-stream procesy: příprava kultivačního média, výběr a propagace kultury, příprava inokula, skladování produkčních kultur

2. Kultivace v kapalném médiu a na pevném substrátu, stanovení růstových parametrů

3. Úprava produkčních kmenů; exprese, izolace a purifikace rekombinantních proteinů

4. Analýza produktů metabolismu: HPLC, UHPLC, GC

5. Analýza DNA a proteinů: izolace, PCR, elektroforézní metody

6. Analýza produkční kultury: mikroskopie, cytometrie

7. Návrh kultivačního procesu v bioreaktorech, příprava bioreaktorů, kultivace v bioreaktoru.

8. Sledování tvorby bakteriálního biofilmu a vlivu aktivních látek na jeho adhezi a eradikaci

9. Příprava a aplikace biostimulačního preparátu, vyhodnocení účinku na rostliny za použití 3D scanneru a multispektrální kamery

10. Práce na samostatném projektu

11. Prezentace projektu

Students will be able to perform experiments according to the provided protocol,

master basic biochemical laboratory techniques,

follow laboratory safety procedures,

prepare a lab report, analyze the collected data,

and interpret their findings in a final presentation.

Studenti budou schopni řešit úlohy podle přeloženého protokolu,

ovládat základní biochemické laboratorní techniky,

dodržovat bezpečnost práce v laboratoři,

zpracovat protokol, vyhodnotit získaná data

a interpretovat zjištěné poznatky v závěrečné prezentaci.

Bioengineering, Microbiology

Bioinženýrství, Mikrobiologie

Basic knowledge of bioengineering and microbiology is assumed.

Bioinženýrství, Mikrobiologie