Obligatory:

• Atkins, P. W., De Paula, Julio. Physical chemistry for the life sciences. Oxford: Oxford Univ. Press, 2006, https://vufind.techlib.cz/Record/000933790 s. ISBN 0199280959.
• Bergethon, P. R., Bergethon, Kristin E.. The physical basis of biochemistry, the foundations of molecular biophysics. New York: Springer, 2010, https://vufind.techlib.cz/Record/000965433 s. ISBN 978-1-4419-6323-9.

Recommended:

• Nelson, David L., Cox, Michael M., Lehninger, Albert L.. Lehninger principles of biochemistry. New York: W.H. Freeman and Company, 2013, https://vufind.techlib.cz/Record/000966229 s. ISBN 1-4292-3414-8.

Povinná:

• Kodíček, Milan, Karpenko, Vladimír. Biofysikální chemie. Praha: Academia, 2013, https://vufind.techlib.cz/Record/000952896 s. ISBN 978-80-200-2241-7.

Doporučená:

• Maršík, František, Dvořák, Ivan. Biotermodynamika. Praha: Academia, 1998, https://vufind.techlib.cz/Record/000908098 s. ISBN 80-200-0664-8.

Volitelná:

• Bergethon, P. R., Bergethon, Kristin E.. The physical basis of biochemistry, the foundations of molecular biophysics. New York: Springer, 2010, https://vufind.techlib.cz/Record/000965433 s. ISBN 978-1-4419-6323-9.
• Atkins, P. W., De Paula, Julio. Physical chemistry for the life sciences. Oxford: Oxford Univ. Press, 2006, https://vufind.techlib.cz/Record/000933790 s. ISBN 0199280959 .

Lectures are designed primarily as face‑to‑face interactive sessions. Students engage in the learning process through brief group discussions in which they actively identify, analyse, and contextualise the relationships between the phenomena under consideration and knowledge acquired in previous courses. Specialised methodologies are delivered by practitioners with relevant professional expertise.

During the practical sessions, model problems are collaboratively solved on the board. Students are encouraged to actively contribute to the development of solutions and to critically discuss potential alternative approaches.

Přednášky jsou koncipovány převážně jako frontální interaktivní výuka. Studenti se do výuky zapojují formou krátkých skupinových diskusí, ve kterých aktivně hledají a diskutují souvislosti probíraných jevů s poznatky z předchozího studia. Specializované metody přednáší odborníci z praxe.

Při cvičení jsou na tabuli řešeny modelové úlohy, studenti se aktivně podílejí na hledání způsobu řešení, diskutují možné alternativní způsoby řešení.

Předmět je zakončen zkouškou, která se skládá z písemné a ústní části. Písemná část testuje schopnost studenta řešit konkrétní příklady (včetně numerického řešení) i jeho teoretické znalosti.

1. Position of biophysical chemistry in the system of natural science

2. Bioenergetics I

3. Bioenergetics II (non-equilibrium thermodynamics)

4. The importance of noncovalent interactions for biological systems

5. The general characteristics of protein structure

6. Methods of kinetics measurement of biological processes

7. Pharmacokinetics

8. Structure and function of biological membranes

9. Biological processes associated with membranes: biochemistry of vision, electron transport chain and photosynthesis

10. Electrochemical processes in biological systems

11. The use of spectrophotometry in biochemical laboratory

12. The use of radiochemistry for the study of biological processes

13. Methods for the study of protein structure I: NMR and X-ray crystallography

14. Methods for the study of protein structure II: circular dichroism and fluorescence spectroscopy

1. Postavení biofyzikální chemie mezi ostatními biologickými vědami

2. Bioenergetika I

3. Bioenergetika II (nerovnovážná termodynamika)

4. Význam nekovalentních interakcí pro biologické systémy

5. Obecné znaky prostorového uspořádání biopolymerů

6. Metody měření kinetiky biologických dějů

7. Farmakokinetika

8. Struktura a základní funkce biologických membrán

9. Biologické funkce vázané na membránu: biochemie vidění, dýchací řetězec a fotosyntéza

10. Elektrochemické děje v biologických systémech

11. Využití spektrofotometrie v biochemických laboratořích

12. Použití radioizotopů při studiu biologických problémů

13. Metody studia prostorového uspořádání biopolymerů I: NMR a rentgenová krystalografie

14. Metody studia prostorového uspořádání biopolymerů II: cirkulární dichroismus a fluorimetrie

https://e-learning.vscht.cz/course/view.php?id=333

https://e-learning.vscht.cz/course/view.php?id=333

Students will be able to:

Describe basic biochemical processes by mathematical methods used in physical chemistry.

Apply the principles of physical chemistry in interpretation and solving problems occuring in biological systems. The problems solution includes numerical analysis of chosen physical chemistry parameters.

Independently propose a method and design a protocol for experimental determination of chosen physical chemistry parameters in biological systems and analyse obtained data.

Studenti budou umět:

Popsat základní biochemické děje pomocí matematického aparátu používaného ve fyzikální chemii.

Aplikovat principy fyzikální chemie při analýze a řešení problémů v biologických systémech včetně numerického řešení hodnot vybraných fyzikálně-chemických parametrů.

Samostatně navrhnout postupy pro experimentální stanovení vybraných fyzikálně-chemických veličin v biologických systémech a analyzovat získané výsledky.

Biochemistry

Physical chemistry

základní znalosti biochemie a fyzikální chemie v rozsahu vyučovaném v bakalářském SP na VŠCHT