The examination is oral. Attending lectures is recommended.

Zkoušení probíhá ústní formou. Účast na přednáškách je doporučená.

Recommended:

• Králová, Blanka. Bioanalytické metody. Praha: Vysoká škola chemicko-technologická, Fakulta potravinářské a biochemické technologie, 2001, 254 s. s. ISBN 80-7080-449-1.
• Káš, Jan, Kodíček, Milan, Valentová, Olga. Laboratorní techniky biochemie. Praha: VŠCHT, 2005, 258 s. s. ISBN 80-7080-586-2.
• Ruml, Tomáš, Rumlová, Michaela, Pačes, Václav. Genové inženýrství. Praha: Vysoká škola chemicko-technologická, 2002, 270 s. s. ISBN 80-7080-499-8.
• Daussant J., Desvaux F.X.. Introduction to Immunochemical Techniques for Medical Diagnosis, Food Quality Control and Environmental Testing. Prague: ICT Prague, 2007, s. ISBN 978-80-7080-641-8.

Doporučená:

• Králová, Blanka. Bioanalytické metody. Praha: Vysoká škola chemicko-technologická, Fakulta potravinářské a biochemické technologie, 2001, 254 s. s. ISBN 80-7080-449-1.
• Káš, Jan, Kodíček, Milan, Valentová, Olga. Laboratorní techniky biochemie. Praha: VŠCHT, 2005, 258 s. s. ISBN 80-7080-586-2.
• Ruml, Tomáš, Rumlová, Michaela, Pačes, Václav. Genové inženýrství. Praha: Vysoká škola chemicko-technologická, 2002, 270 s. s. ISBN 80-7080-499-8.
• Daussant J., Desvaux F.X.. Introduction to Immunochemical Techniques for Medical Diagnosis, Food Quality Control and Environmental Testing. Prague: ICT Prague, 2007, s. ISBN 978-80-7080-641-8.

Lectures with student participation in discussion.

Přednášky se zapojením studentů do diskuze.

The course concludes with an oral examination.

Předmět je zakončen ústní zkouškou.

1. Introduction: definition of bioanalytical methods and the basics of the isolation and stability of biological material.

2–3. Enzyme methods: enzymes as analytical reagents; determination of substrates and activators; and enzyme methods in clinical and experimental practice.

4.-5. Immunochemical methods: principles; characterisation of antigen-antibody interactions; preparation and use of antibodies; immunoprecipitation methods and their use in practice; sensitive techniques (e.g. ELISA); methods using radionuclides.

6.-7. Electrophoretic methods: principles; SDS electrophoresis; isoelectric focusing; blotting techniques; characterisation of analytes after separation by electrophoretic methods; colour and chemiluminescent detection.

8.-9. Genetic methods: principles, polymerase chain reaction (PCR), detection of specific product sequences in situ and determination of the primary sequence of nucleic acids.

10. In vitro techniques: use of cell lines in bioanalytical methods; biochemical and microbiological methods in analytical chemistry.

11.-12. Chromatographic techniques: liquid and gas chromatography; bioaffinity chromatography.

13. OMICS methods: global characterisation and quantification of biomolecules.

14. Detection limits and the use of selected bioanalytical methods.

1. Úvod - definice bioanalytických metod, základy izolace a stabilita biologického materiálu.

2.-3. Enzymové metody - enzymy jako analytická činidla, stanovení substrátů a aktivátorů, enzymové metody v klinické a experimentální praxi.

4.-5. Imunochemické metody - princip, charakterizace interakce antigen-protilátka, příprava a použití protilátek, imunoprecipitační metody a jejich využití v praxi, citlivé techniky (ELISA), metody využívající radionuklidy.

6.-7. Elektroforetické metody - princip, SDS elektroforéza, isoelektrická fokusace, blotovací techniky, charakterizace analytů po dělení elektroforetickými metodami, barevná a chemiluminiscenční detekce.

8.-9. Genetické metody - princip, polymerasová řetězová reakce (PCR), detekce specifických sekvencí produktu in situ, stanovení primární sekvence nukleových kyselin.

10. In vitro techniky - Použití buněčných linií v bioanalytických metodách, biochemické a mikrobiologické metody v analytické chemii.

11.-12. Chromatografické techniky - kapalinová a plynová chromatografie, bioafinitní chromatografie.

13. OMICS metody - globální charakterizace a kvantifikace biomolekul.

14. Detekční limity a použití vybraných bioanalytických metod.

Electronic versions of the lectures are available at: https://e-learning.vscht.cz.

Further recommended literature and links to electronic resources may be provided during the lectures.

Přednášky v elektronické podobě jsou dostupné na: https://e-learning.vscht.cz

Další seznam doporučené literatury a odkazy na elektronické zdroje mohou být poskytnuty v rámci jednotlivých přednášek.

Students will be able to:

• Select an appropriate bioanalytical method for a specific sample type and target molecule, taking into account the required sensitivity, specificity, and detection limit.

• Apply and interpret the results of common bioanalytical methods, including enzymatic, immunochemical, electrophoretic, genetic, chromatographic, and mass spectrometric techniques.

• Navigate professional literature focused on the study of biomolecules and bioanalytical technologies, including the ability to critically evaluate the suitability of the methods used.

• Practically recognize the possibilities and limitations of individual techniques, including their use in clinical, experimental, and research practice.

• Gain an overview of working with biological material, its stability, isolation, and subsequent analysis using in vitro techniques and cell models.

• Compare different bioanalytical approaches and select appropriate methodological strategies according to the type of biological question or research objective.

Studenti budou umět:

• Zvolit vhodnou bioanalytickou metodu pro konkrétní typ vzorku a cílovou molekulu s ohledem na požadovanou citlivost, specificitu a detekční limit.

• Aplikovat a interpretovat výsledky běžných bioanalytických metod, včetně enzymových, imunochemických, elektroforetických, genetických, chromatografických a hmotnostně spektrometrických technik.

• Orientovat se v odborné literatuře zaměřené na studium biomolekul a bioanalytické technologie, včetně schopnosti kriticky zhodnotit vhodnost použitých metod.

• Prakticky rozpoznat možnosti a limity jednotlivých technik, včetně jejich využití v klinické, experimentální a výzkumné praxi.

• Získat přehled o práci s biologickým materiálem, jeho stabilitě, izolaci a následné analýze pomocí in vitro technik a buněčných modelů.

• Porovnat různé bioanalytické přístupy a zvolit vhodné metodické strategie podle typu biologické otázky nebo výzkumného cíle.

Biochemistry I

Biochemie I