The students will be familiar with pathogenic and hazardous organisms occurring in the Czech environment and the most common worldwide. They will know how to classify them taxonomically and what risk they can cause to the humans. They will acquire the theoretical and partly practical knowledge of detection methods of these organisms. The students will be able to describe the principle of bacterial resistance to antibiotics and the cycle of resistant genes in the environment.

Po absolvování předmětu bude student znát patogenní a rizikové organismy vyskytující se v životním prostředí ČR a ty nejběžnější mimo ČR. Bude je umět taxonomicky zařadit a vědět, jaká rizika přináší lidem. Osvojí si teoretické a částečně praktické znalosti o metodách detekce těchto organismů. Bude umět popsat princip rezistence bakterií na antibiotika a koloběh rezistentních genů v životním prostředí.

Z:Říhová Ambrožová J., Vejmelková D., Čiháková P., 2017. Technická mikrobiologie a hydrobiologie. 1st ed. Praha: Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, 2017. ISBN 978-80-7080-986-0

D:Mishra S.K., & Agrawal D. 2012. Concise Manual of Pathogenic Microbiology, Wiley, Somerset. Available from: ProQuest Ebook Central. [22 January 2018].

D:Percival S.L., Yates M.V., Williams D.W., Chalmers R.M., Gray N.F. 2013. Microbiology of waterborne diseases: microbiological aspects and risks. London: Elsevier.

D:Wilson B.A., Salyers A.A., Whitt D.D., Winkler M.E. 2011. Bacterial Pathogenesis: A Molecular Approach. ASM Press, 3rd Ed.

D:Popp J., Bauer M. 2015. Modern Techniques for Pathogen Detection. John Wiley & Sons.

Z:Říhová Ambrožová J., Vejmelková D., Čiháková P., 2017. Technická mikrobiologie a hydrobiologie. 1st ed. Praha: Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, 2017. ISBN 978-80-7080-986-0

D:Mishra S.K., & Agrawal D. 2012. Concise Manual of Pathogenic Microbiology, Wiley, Somerset. Available from: ProQuest Ebook Central. [22 January 2018].

D:Percival S.L., Yates M.V., Williams D.W., Chalmers R.M., Gray N.F. 2013. Microbiology of waterborne diseases: microbiological aspects and risks. London: Elsevier.

D:Wilson B.A., Salyers A.A., Whitt D.D., Winkler M.E. 2011. Bacterial Pathogenesis: A Molecular Approach. ASM Press, 3rd Ed.

D:Popp J., Bauer M. 2015. Modern Techniques for Pathogen Detection. John Wiley & Sons.

http://www.szu.cz/

http://www.who.int/en/

https://www.frontiersin.org/journals/microbiology

Posluchač je seznámen na teoretické úrovni s oborem mikrobiologie se zaměřením na rizikové organismy pro člověka vyskytující se v životním prostředí ČR, a okrajově i celosvětově.

Součástí výuky jsou cvičení, kde se probírají případové studie, legislativní opatření týkající se rizikových mikroorganismů v životním prostředí a metody identifikace organismů. Dostupné metody identifikace jsou studentům prakticky ukázány v laboratořích.

Active participitation in seminars 10 %

Presentation of student project 30 %

Oral examination 60 %

Aktivní účast na přednáškách/cvičeních 10 %

Absolvování studentského projektu 30 %

Ústní zkouška 60 %

1. Úvod do problematiky, definice rizik (epidemie), metody hodnocení prevalence, rozdělení rizikových oblastí, člověk a prostředí, zdravotnictví a bezpečnost

2. Klasifikace patogenních a rizikových organismů v životním prostředí (voda, vzduch, půda, hostitel), sérotypizace, imunologie

3. Bakteriální patogeny a rizikové organismy v životním prostředí (interakce s hostitelem, způsobená onemocnění, prevalence) I.

4. Bakteriální patogeny a rizikové organismy v životním prostředí (interakce s hostitelem, způsobená onemocnění, prevalence) II.

5. Bakterie rezistentní na antibiotika (princip působení/rezistence, koloběh v životním prostředí, důsledky rezistence)

6. Jednobuněčná eukaryota riziková pro člověka v prostředí (Giardia, Cryptosporidium, améby, jiní prvoci a nebezpečí i mimo ČR)

7. Mnohobuněčná eukaryota riziková pro člověka v prostředí (houby – plísně a kvasinky, hlísti, tasemnice, motolice i mimo ČR)

8. Životní cykly virů, jejich klasifikace

9. DNA a RNA viry způsobující onemocnění člověka

10. Organismy produkující algogenní a toxigenní látky, riziko pro člověka, monitoring, organoleptické závady vod (konzumace vody, koupání, aerosol)

11. Metody detekce a identifikace rizikových organismů (kultivace, biochemické metody, metody molekulární biologie)

12. Příklady epidemií způsobených mikrobiální kontaminací pitných vod, legislativa, direktivy WHO, případové studie

13. Exkurze

14. Studentský projekt (skupinová prezentace studentů na vybrané téma rizik a patogenů)

Nejsou.

90% účast na přednáškách, aktivní účast na cvičeních, zpracování případové studie a její prezentace. Po udělení zápočtu, možnost zápisu na termín zkoušky. Zkouška ústní formou přezkoušení znalostí z celého předmětu, teoretické i praktické zkušenosti.