The course is directed to the theoretical and practical knowledge dealing with microorganisms in their environment. Lectures will include information on characterisation of microorganisms, degradation of substrates. Special attention will be paid to the influence of environmental conditions on metabolical and physiological activity, microorganism detection and enumeration. Requirements on microbiological laboratory and general instructions for safe microbiological handling will be mentioned in the last part. Part of the subject will be directed to the laboratory experiments. Students will be introduced into application of basic cultivation techniques and rapid methods for detection and characterization of microorganisms in environmental samples.
Last update: Chumchalová Jana (26.01.2018)
Předmět je zaměřen na získání teoretických informací o mikroorganismech vyskytujících se v životním prostředí a na jejich ověření v laboratorních cvičeních. Student bude seznámen se základními vlastnostmi mikroorganismů, se způsoby degradace substrátů nezbytných pro jejich růst a dělení, s výskytem mikroorganismů v životním prostředí. Dále bude probrán vliv faktorů na metabolickou a fyziologickou aktivitu a způsoby ovlivnění metabolické a fyziologické aktivity. V poslední části budou popsány zásady práce v mikrobiologické laboratoři. Část předmětu bude zaměřena na praktickou výuku, kde se studenti seznámí se základními postupy pro stanovení a charakterizaci mikroorganismů klasickými kultivačními a rychlými metodami ve vzorcích z prostředí.
Last update: Chumchalová Jana (28.08.2024)
Course completion requirements -
Students must to undergo all laboratory tests, to write protocol under rules and to surrend it in term, to write a test and to obtain a minimum 50% of points and pass an oral examination.
Last update: Chumchalová Jana (26.01.2018)
Pro zakončení je nutná 100 % účast v laboratořích, odevzdání protokolu podle daných požadavků a v termínu, napsání testu minimálně na 50 % bodů a absolvování ústní zkoušky.
Last update: Chumchalová Jana (26.01.2018)
Literature -
Recommended:
Maier, Raina M., Pepper, Ian L., Gerba, Charles P.. Environmental microbiology. Amsterdam; Boston: Elsevier/Academic Press, 2009, https://vufind.techlib.cz/Record/000938857 s. ISBN 978-0-12-370519-8.
Last update: prepocet_literatura.php (19.12.2024)
Doporučená:
Maier, Raina M., Pepper, Ian L., Gerba, Charles P.. Environmental microbiology. Amsterdam; Boston: Elsevier/Academic Press, 2009, https://vufind.techlib.cz/Record/000938857 s. ISBN 978-0-12-370519-8.
Last update: prepocet_literatura.php (19.12.2024)
Requirements to the exam -
Rules to grant credit: student will attend laboratories and deliver report from laboratory praxis in term.
Rules to get exam: student will consist within syllabus of a written part and then listener will be interviewed orally.
Last update: Chumchalová Jana (26.01.2018)
Požadavky pro zápočet:
posluchač bude absolvovat laboratoře a odevzdá v termínu protokol z laboratorních cvičení.
Požadavky ke zkoušce:
posluchač bude skládat písemnou zkoušku a poté bude dotazován ústně v rozsahu sylabu.
Last update: Chumchalová Jana (28.08.2024)
Syllabus -
1. Specification of the subject Microbiology in environment, basic microbiological terms, microbiological taxonomy.
2. Basic structure of microbial cells and their chemical content.
3. Metabolical processes in microorganism.
4. Influence of internal and external factors on growth and characteristics of microorganisms.
5. Nutrition of microorganisms. Growth curve.
6. Principles of both detection and enumeration of microorganisms by cultivation techniques. Sampling and sample storage.
7. Occurence and significance of microorganisms in environment and their detection.
8. Requirements on microbiological laboratory. General instructions for microbiological handling.
9. Laboratory experiments. Safe handling in microbiological laboratory. Preparation of sterile materials.
10. Laboratory experiments. Control of hygiene and laboratory sanitation by both cultivation and rapid techniques.
11. Laboratory experiments. Enumeration of bacteria, yeasts and moulds in soil sample.
12. Laboratory experiments. Enumeration of both culturable and indicator microorganisms in water sample.
13. Laboratory experiments. Isolation techniques. Sample preparation for light microscopy.
14. Laboratory experiments. Testing the effect of external factors on the growth of microorganisms.
Last update: Chumchalová Jana (07.02.2018)
1. Vymezení předmětu mikrobiologie v ochraně životního prostředí. Mikrobiologické názvosloví a taxonomie, rozdělení mikroorganismů a jejich specifikace.
2. Základní struktura mikrobiálních buněk (bakterie, kvasinky, plísně, prvoci, řasy a viry) a jejich chemické složení.
3. Mikrobiální metabolismus - základní rysy (rozklad sacharidů, lipidů a dusíkatých látek). Katabolické a anabolické procesy.
4. Vliv vnitřních a vnějších faktorů na růst a vlastnosti mikroorganismů.
5. Výživa mikroorganismů. Růstová křivka (růst v baňkách a v prostředí, fáze růstu a růstové konstanty, kontinuální kultivace).
6. Principy kultivačního stanovení mikroorganismů. Způsob odběru, úchovy a přípravy vzorku k rozboru.
7. Výskyt a význam mikroorganismů v životním prostředí, a způsob stanovení (horninové prostředí, voda, ovzduší) a identifikace.
8. Požadavky na mikrobiologickou laboratoř. Zásady práce v mikrobiologické laboratoři.
9. Laboratorní práce - Bezpečnost práce v mikrobiologické laboratoři. Příprava sterilních pomůcek, příprava a sterilizace ředících roztoků, kultivačních a diagnostických medií.
10. Laboratorní práce - Kontrola sanitace prostředí laboratoře a hygienických opatření kultivačními a rychlými metodami.
11. Laboratorní práce - Stanovení celkového počtu bakterií, kvasinek a plísní ve vzorku horninového prostředí.
12. Laboratorní práce - Stanovení celkového počtu kultivovatelných a indikátorových mikroorganismů ve vzorku vody.
13. Laboratorní práce - Izolační techniky mikroorganismů. Světelná mikroskopie nativních a barvených preparátů mikroorganismů.
14. Laboratorní práce - Sledování vlivu vnějších faktorů na růst mikroorganismů.
Last update: Chumchalová Jana (07.02.2018)
Learning resources -
Chumchalová J., Kubal M., Šír M.: Practical exercies in environmental microbiology, VŠCHT Praha, updated learning text
Chumchalová J., Němec M., Kotoučková L., Páčová Z., Savická D., Kubátová A., Patáková P.: Miniatlas mikroorganismů (Miniatlas of microorganisms). http://old.vscht.cz/obsah/fakulty/fpbt/ostatni/miniatlas/index.htm
Last update: Chumchalová Jana (28.08.2024)
Chumchalová J., Kubal M., Šír M.: Praktická cvičení z environmentální mikrobiologie, VŠCHT Praha, aktualizovaný učební text
Chumchalová J., Němec M., Kotoučková L., Páčová Z., Savická D., Kubátová A., Patáková P.: Miniatlas mikroorganismů. http://old.vscht.cz/obsah/fakulty/fpbt/ostatni/miniatlas/index.htm
Last update: Chumchalová Jana (28.08.2024)
Learning outcomes -
Students will be able to practically apply the knowledge from the field of:
basic classification of microorganisms and their occurrence in the environment,
principles of metabolism,
both theoretical and practical basic laboratory techniques used for microbiological sampling from the environment, determination and characterization of microorganisms.
Last update: Chumchalová Jana (26.08.2025)
Studenti budou umět:
základní rozdělení mikroorganismů a jejich výskyt v životním prostředí,
principy stanovení a metabolické aktivity mikroorganismů,
základní laboratorní techniky používané pro mikrobiologický odběr vzorku z prostředí, stanovení a charakterizaci metabolické aktivity mikroorganismů.
Last update: Chumchalová Jana (26.08.2025)
Registration requirements -
Basic knowledge from biology.
Last update: Chumchalová Jana (26.08.2025)
Základní znalosti z biologie.
Last update: Chumchalová Jana (26.08.2025)
Teaching methods
Activity
Credits
Hours
Konzultace s vyučujícími
1
28
Účast v laboratořích (na exkurzi nebo praxi)
1
28
Příprava na přednášky, semináře, laboratoře, exkurzi nebo praxi