The subject widens the basic knowledge of biochemistry of microorganisms targeted on the organization of cell metabolism and their regulatory mechanisms. Cell cycle regulation of prokaryotes and eukaryotes is part of this. Biochemical principles of extremophilic microorganisms are included.Next topics are determinants of pathogens virulence, synthesis of antimicrobials peptides and antibiotics (secondary metabolites). The quorum-sensing regulation and the formation of bacterial biofilm are explained.
Last update: PAZLAROJ (14.11.2012)
Předmět rozšiřuje základní znalosti o biochemii mikroorganismů se zaměřením na organizaci buněčného metabolismu a regulační mechanismy.Součástí je poznání regulace buněčného cyklu jak prokaryotních tak eukaryotních mikroorganismů, biochemické principy života extremofilních mikroorganismů. Dále se studenti seznámí s determinanty virulence patogenů, syntézou antimikrobiálních peptidů a antibiotik(sekundární metabolity). Jsou vysvětleny principy regulace quorum-sensing a tvorba mikrobiálního biofilmu.
Aim of the course -
Last update: TAJ320 (11.12.2013)
Students will be able to orient theselves in metabolit types of different groups of microorganisms, they will know the regulation of processes as sporogenesis, cell cycle, secretion and transport of low and highmolecular matters from the cells. They will acquire knowledge about mechanisms of action of antimicrobials agents, and mechanisms effecting the microbial patogenity. Beside this they will learn the response of microorganisms to various types of stress (heat-shock, oxidative stress).
Last update: Fialová Jana (11.06.2013)
Studenti budou umět:
orientovat se v typech metabolismu různých skupin mikroorganismů, znají regulaci procesů jako je sporogeneze, buněčný cyklus, sekrece nízko a vysokomolekulárních látek z buněk a zpět. Mají znalosti o mechanismech působení antimikrobiálních látek a mechanismů podmiňujících patogenitu mikroorganismů. Seznámí se stypy odpovědí mikroorganismů na různé typy stresů (heat-shock, oxidativní stres).
Literature -
Last update: TAJ320 (25.09.2013)
R: Biochemie, Voet a Voetová, Victoria Publishing 1995
A: Microbial Physiology, 4th Edition, Albert G. Moat, John W. Foster, Michael P. Spector, Michael P. Sector, Wiley-Liss; 4 edition (July 8, 2002), ISBN-10: 0471394831
A: Bacterial Physiology and Metabolism, Byung Hong Kim, Geoffrey Michael Gadd, Cambridge University Press; 1 edition (March 3, 2008), ISBN-10: 0521712300
Last update: Fialová Jana (11.06.2013)
Z: Biochemie, Voet a Voetová, Victoria Publishing 1995
D: Microbial Physiology, 4th Edition, Albert G. Moat, John W. Foster, Michael P. Spector, Michael P. Sector, Wiley-Liss; 4 edition (July 8, 2002), ISBN-10: 0471394831
D: Bacterial Physiology and Metabolism, Byung Hong Kim, Geoffrey Michael Gadd, Cambridge University Press; 1 edition (March 3, 2008), ISBN-10: 0521712300
Learning resources -
Last update: TAJ320 (19.09.2013)
none
Last update: TAJ320 (19.09.2013)
žádné
Syllabus -
Last update: PAZLAROJ (19.08.2013)
1. Cell metabolism organization, experimental approaches for the study of key reaction, protein turn-over, ultracytochemistry of microorganisms.
2. RNA-polymerase, sigma factors, m-RNA stability, protein phosphorylation.
3. Life and cell cyclus of prokaryotic and eukaryotic microorganisms, cytoskeleton.
4. Biochemical principles of life in extreme environment, sporulation.
5. Biochemical pathways for the biosynthesis of essentials amino acids.
6. Inhibitory factors produced by microorganisms: antibiotics, colicines, killer factors.
7. Biochemical pathways for secondary metabolites synthesis, antibiotic`s mechanism of action.
8. Factors determining microorganisms patogenity
9. Protein secretion and transport of prokaryotic and eukaryotic microorganisms, signal peptides, Protein processing.
10. Anaerobic processes of microorganisms, anaerobic respiration.
11. Quorum sensing regulation.
12. Stress response of microorganisms
13. Biofilm formation
14. Microbial degradation of celulose.
Last update: Fialová Jana (11.06.2013)
1. Organisace buněčného metabolismu, experimentální přístupy ke studiu klíčových reakcí, turn-over proteinů, ultracytochemie mikroorganismů
7. Biochemické dráhy vedoucí k synthese sekundárních metabolitů, mechanismus účinků antibiotik
8. Faktory podmiňující patogenitu mikroorganismů
9. Sekrece bílkovin u prokaryontních a eukaryontních mikroorganismů, signální peptidy, "processing"
10. Anaerobní procesy u mikroorganismů, anaerobní respirace
11. Mechanismy transportu látek u mikroorganismů
12. Regulace "quorum sensing"
13. Oxidativní stres u mikroorganismů
14. Mikrobiální degradace celulosy
Registration requirements -
Last update: TAJ320 (25.09.2013)
Biochemistry, Mikrobiology
Last update: Fialová Jana (11.06.2013)
Biochemie, Mikrobiologie
Course completion requirements - Czech
Last update: Stiborová Hana doc. Ing. Ph.D. (29.01.2018)
K písemné a ústní zkoušce může přistoupit student/ka, který obhájil/a individuální projekt na předem vybrané téma formou ústní prezentace. Úspěšné zakončení předmětu spočívá v napsání zkouškové písemky minimálně na 50 bodů ze 100 a složení ústní zkoušky v hodnocení A-E.