During the previous master's study students met with theoretical foundations of biochemical methods. Within this subject, their knowledge about the latest approaches and modern methodologies used in laboratory practice will be extended. Students will acquire theoretical and directly practical knowledge and skills in modern biochemical methods. It will also benefit from the enhancement of presentation skills, in which students will prepare a brief briefing on the new techniques they use in the laboratories as part of their dissertation work.

The first block of lectures will focus on classical methods - work with biological material (storage, homogenization, extraction, sample preparation for mass spectrometry), electrophoretic methods, chromatographic methods, membrane processes, centrifugation, PCR methods, methods of protein interaction analysis - depending on the students' knowledge (lectures and discussions).

The second block will be devoted to the recent techniques, students will present a short presentation of a selected method published in a renowned magazines to other participants of the course.

Během předchozího magisterského studia se studenti setkali s teoretickými základy jednotlivých biochemických metod.V rámci tohoto předmětu dojde k rozšíření jejich dosavadních znalostí o nejnovějších přístupech a moderních metodikách používaných v laboratorní praxi. Studenti po absolvování předmětu si osvojí teoretické i přímo prakticky aplikovatelné znalosti a dovednosti v oblasti moderních biochemických metod. Přínosem bude i posílení prezentačních dovedností, kdy studenti v rámci předmětu připraví krátké sdělení týkající se nových technik, které používají v laboratořích v rámci své disertační práce.

První blok přednášek se bude věnovat klasickým metodám, jako je práce s biologickým materiálem (uskladnění, homogenizace, extrakce, příprava vzorku pro hmotnostní spektrometrii), elektroforetické metody, chromatografické metody, membránové procesy, centrifugace, PCR metody, sekvenace, metody analýzy proteinových interakcí, atd. - v závislosti na stavu znalostí přihlášených studentů (přednášky a diskuse).

Další blok bude věnován nejnovějším metodám, kde studenti zpracují do krátké prezentace vybranou metodu publikovanou v renomovaném časopise a přednesou ji ostatním účastníkům kursu.

Presentation of a review paper form the field of biochemical methods.

Oral examThe subject is finished by an oral exam.

Předmět bude vyučován od letního semestru 2020/2021.

Prezentace přehledného článku z oblasti biochemických metod.

Předmět je zakončen ústní zkouškou.

Boyer, Rodney F: Biochemistry laboratory: modern theory and techniques, Pearson, New Jersey, 2012 ISBN-13:978-0-13-604302-7

Janson JC: Protein Purification: Principles, High Resolution Methods, and Applications, Third Edition, John Wiley & Sons, Inc., New Jersey 2011 ISBN:9780471746614

Mikkelsen S.R.: Bioanalytical Chemistry, Wiley, New Jersey, 2016, ISBN 978-1-118-30254-5

Boyer, Rodney F: Biochemistry laboratory: modern theory and techniques, Pearson, New Jersey, 2012 ISBN-13:978-0-13-604302-7

Janson JC: Protein Purification: Principles, High Resolution Methods, and Applications, Third Edition, John Wiley & Sons, Inc., New Jersey 2011 ISBN:9780471746614

Mikkelsen S.R.: Bioanalytical Chemistry, Wiley, New Jersey, 2016, ISBN 978-1-118-30254-5

1. Source of proteins, dezintegration, membrane process

2. Precipitation, extraction, and centrifugation

3. Basic classification and instrumentation, materials for electrophoretic and chromatographic methods

4. Gel permeation chromatography, ion exchange chromatography, hydrophobic chromatography and reverse phase chromatography.

5. Affinity chromatography

6. Recombinant proteins, production and troubleshooting

7. Thin layer chromatography, monitoring of chromatography and determination of protein concentration

8. Introduction to electrophoretic methods

9. Types of electrophoretic methods

10. General principles and division of immunochemical methods

11. Immunoaffinity separation of molecules

12. Presentation of a selected method published in a scientific journal

13. Presentation of a selected method published in a scientific journal

14. Presentation of a selected method published in a scientific journal

1. Zdroje enzymů, dezintegrace, membránové procesy

2. Srážení, extrakce a centrifugace

3. Základní rozdělení a instrumentace, materiály pro elektroforetické a chromatografické metody

4. Gelová permeační chromatografie, ionexová chromatografie, hydrofobní chromatografie a chromatografie na reversní fázi.

5. Afinitní chromatografie

6. Rekombinantní proteiny, produkce a její úskalí

7. Tenkovrstvá chromatografie, sledování průběhu chromatografie a stanovení koncentrace bílkovin

8. Úvod do elektroforetických metod

9. Typy elektroforetických metod

10. Obecné principy a rozdělení imunochemických metod

11. Imunoafinitní separace molekul

12. Prezentace vybrané metody publikované v renomovaném časopise

13. Prezentace vybrané metody publikované v renomovaném časopise

14. Prezentace vybrané metody publikované v renomovaném časopise

non

Nejsou

Non.

Nejsou