Students will be able to:

determine various types of environmental contamination by harmful substances,

know the possible microbiological decomposition of harmful substances,

limitations of microbiological degradation of contaminants.

Studenti budou umět:

jednotlivé typy kontaminací prostředí škodlivými látkami,

jak probíhá rozklad z hlediska mikrobiologického charakteru škodlivých látek v prostředí,

jaké jsou limity rozkladu škodlivých látek.

Maier R.M., Pepper I.L., Gerba G.P. Environmental Microbiology. 2. vyd. China: Academic Press, 2009.

Palmisano A.C., Barlaz A.M. Microbiology of solid waste. CRC Press,1996.

Horáková D. Bioremediace. 2006. http://is.muni.cz/do/1499/el/estud/prif/ps06/3062932/bioremediace_FRVS_2006-2.pdf

Maier R.M., Pepper I.L., Gerba G.P. Environmental Microbiology. 2. vyd. China: Academic Press, 2009.

Palmisano A.C., Barlaz A.M. Microbiology of solid waste. CRC Press,1996.

Horáková D. Bioremediace. 2006. http://is.muni.cz/do/1499/el/estud/prif/ps06/3062932/bioremediace_FRVS_2006-2.pdf

Examination requirements:

student will consist within syllabus of a written part and then listener will be interviewed orally.

Požadavky ke zkoušce:

v rozsahu sylabu (dále doporučená literatura) bude posluchač skládat písemnou část a poté bude dotazován ústně.

1. Characterization of microorganism environment, microbial profile of environment, interactions between microorganisms, microorganisms and plants.

2. General principles of biodegradation processes.

3. The effect of environment on biodegradation (e.g. redox potential and pH environment).

4. Bioavailability and bioaccessibility of pollutants.

5. Petroleum products and petroleum-degrading microorganisms (principles and limits of microbial degradation, detection of microbial degradation).

6. Chlorinated hydrocarbons and microorganisms degrading chlorinated hydrocarbons (principles and limits of microbial degradation, detection of microbial degradation).

7. Persistent organic pollutants and microorganisms degrading persistent organic pollutants (principles and limits of microbial degradation, detection of microbial degradation).

8. Inorganic pollutants, radionuclides, heavy metals.

9. Landfill, microorganisms in landfill sites and microbiological processes during waste decomposition.

10. Composting, microorganisms in compost and microbiological processes during composting.

11. Laboratory exercises – Preparation of sterile aids, dilution solutions, cultivation and diagnostic media.

12. Laboratory exercises – Determination of total degraders.

13. Laboratory exercises – Determination of degradation process.

14. Laboratory exercises – Identification of total degraders by Biolog system.

1. Prostředí výskytu mikroorganismů, mikrobiální profil prostředí, vzájemné vztahy mikroorganismů, mikroorganismů a rostlin.

2. Obecné rysy biodegradačních procesů.

3. Vliv prostředí na průběh biodegradace (např. redox potenciál, pH).

4. Biologická dostupnost a dosažitelnost kontaminantu.

5. Ropné látky a mikroorganismy degradující ropu (podstata a limity mikrobiální degradace, detekce mikrobiální degradace).

6. Chlorované uhlovodíky a mikroorganismy degradující chlorované uhlovodíky (podstata a limity mikrobiální degradace, detekce mikrobiální degradace).

7. Perzistentní organické látky a mikroorganismy degradující perzistentní organické látky (podstata a limity mikrobiální degradace, detekce mikrobiální degradace).

8. Anorganické polutanty, radionuklidy, těžké kovy.

9. Skládka, mikroorganismy ve skládkách a mikrobiologické procesy probíhající v průběhu skládkování.

10. Kompostování, mikroorganismy v kompostu a mikrobiologické procesy probíhající v průběhu kompostování.

11. Laboratorní cvičení - Příprava sterilních pomůcek, příprava a sterilizace ředících roztoků, kultivačních a diagnostických médií.

12. Laboratorní cvičení - Stanovení celkového počtu degradujících mikroorganismů.

13. Laboratorní cvičení – Stanovení průběhu degradace kontaminantu.

14. Laboratorní cvičení - Identifikace degradujících mikroorganismů systémem Biolog.

Horáková D.: Bioremediace. 2006, skriptum Masarykova univerzita, http://is.muni.cz/do/1499/el/estud/prif/ps06/3062932/bioremediace_FRVS_2006-2.pdf

Horáková D.: Bioremediace. 2006, skriptum Masarykova univerzita, http://is.muni.cz/do/1499/el/estud/prif/ps06/3062932/bioremediace_FRVS_2006-2.pdf

Basics of Biology, Biochemistry, Microbiology in Environment Protection

Základy biologie, Biochemie, Mikrobiologie pro ochranu životního prostředí