Students will be able to:

isolate the proteins from various sources

characterize the enzyme activity

determine the degree of cooperativity of the enzyme during its denaturation

identify the protein by mass spectrometry

isolate plasmid DNA and characterize it by restriction cleavage

analyze and process the results to protocols

Studenti budou umět:

• izolovat proteiny z různých zdrojů

• charakterizovat enzymovou aktivitu

• určit míru kooperativity enzymu v průběhu denaturace

• identifikovat protein pomocí hmotnostní spektrometrie

• izolovat a charakterizovat plasmidovou DNA pomocí restrikční analýzy

• analyzovat a zpracovávat výsledky formou protokolu

Credit will be obtained based on a written solution of an individual task in given deadline. The exam comprises a written part.

Je nutné písemně vypracovat protokoly z jednotlivých úloh a odevzdat v termínu. Zkouška se skládá z písemné části.

R: Káš J., Kodíček M., Valentová O.: Laboratorní techniky biochemie. 1. vyd. Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, Praha 2006. ISBN 80-7080-586-2

Z: Káš J., Kodíček M., Valentová O.: Laboratorní techniky biochemie. 1. vyd. Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, Praha 2006. ISBN 80-7080-586-2

Elaboration of protocols from all laboratory tasks.

Classification at least E from every protocol.

At least 50% from the final written test.

Vypracování a odevzdání protokolů ze všech laboratorních úloh.

Klasifikace alespoň E z každého z odevzdaných protokolů.

Alespoň 50% bodů ze závěrečného testu.

1. Good laboratory practice, safety

2. Theoretical introduction to the laboratory tasks

3. Chromatography of biomacromolecules, evaluation of purification steps

4. Electrophoretic analysis of erythrocyte membrane proteins

5. Basic characterization of purified preparates of proteins

6. Enzyme kinetics (allosteric enzymes)

7. Modern methods of protein identification

8. Physical & chemical properties of proteins

9. Immunotechniques

10.Basic techniques of molecular biology

11.Isolation of subcellular particles

12.Study of basic metabolic events

13.Methods of determination of catalytical activity of enzymes

14.Evaluation, test and free discussion

1. Správná laboratorní praxe, bezpečnost práce

2. Teoretický úvod k laboratorním úlohám

3. Chromatografie biomakromolekul a vyhodnocení purifikačních procesů

4. Elektroforetická analýza proteinů erytrocytové membrány

5. Základní charakterizace purifikovaných preparátů bílkovin

6. Enzymová kinetika (allosterické enzymy)

7. Moderní metody identifikace bílkovin

8. Fyzikálně-chemické vlastnosti proteinů

9. Imunochemické techniky

10.Základní techniky molekulární biologie

11.Izolace subcelulárních částic

12.Studium základních metabolických dějů

13.Metody stanovení katalytických aktivit enzymů

14.Závěrečné zhodnocení a volná diskuze

Kodíček Milan: Biochemické pojmy : výkladový slovník (http://vydavatelstvi.vscht.cz/knihy/uid_es-002/)

Kodíček Milan: Biochemické pojmy : výkladový slovník (http://vydavatelstvi.vscht.cz/knihy/uid_es-002/)

Biochemistry

Laboratory of biochemistry

Biochemie

Laboratoř biochemie