The laboratories are conducted in a 14-day block during March. The exact dates will be announced in the 1st week of the LS.
The transfer of theoretical knowledge of the field of ecotoxicology into practice.
Students will learn the foundation of selected ecotoxicological tests on organisms of different trophic levels (decomposers, producers, consumers) terrestrial and aquatic environments, methods of evaluation and statistical analysis of the results and their subsequent interpretation.
Last update: Mocová Klára Anna (07.02.2025)
Laboratoře probíhají blokově, ve 14denním bloku v průběhu března. Přesný termín bude oznámen v 1. týdnu LS.
Účelem laboratoří je převedení teoretických znalostí z oboru Ekotoxikologie do praxe.
Studenti si osvojí založení vybraných ekotoxikologických testů na organismech různé trofické úrovně (destruenti, producenti, konzumenti) vodního i terestrického prostředí, metody vyhodnocení a statistické zpracování získaných výsledků a jejich následnou interpretaci.
Last update: Mocová Klára Anna (07.02.2025)
Course completion requirements -
Students have to graduate all laboratory works and consign protocols from these works and final protocol (comparison of results from all toxicity tests).
Last update: Mocová Klára Anna (07.02.2025)
Studenti musí absolvovat dané laboratorní úlohy a odevzdat protokoly z jednotlivých úloh a závěrečný protokol (porovnání výsledků ze všech testů toxicity).
Last update: Mocová Klára Anna (07.02.2025)
Literature -
Obligatory:
Actual instructions for each task available in e-learning
Last update: Mocová Klára Anna (07.02.2025)
Povinná:
Aktuální návody k jednotlivým úlohám dostupné v e-learningu
Last update: Mocová Klára Anna (07.02.2025)
Requirements to the exam -
Attendance is mandatory. After exercise students will work out protocols of individual laboratory works within the specified time.
Classification is based on the way the class works, the quality of the reports and their timely submission.
Last update: Mocová Klára Anna (07.02.2025)
Účast na cvičení je povinná. Student po ukončení cvičení vypracuje a odevzdá protokoly z jednotlivých laboratorních úloh v určeném termínu.
Klasifikace se opírá o způsob práce v hodinách, kvalitu zpracování protokolů a jejich včasné odevzdání.
Last update: Mocová Klára Anna (07.02.2025)
Syllabus -
1. Treatment of samples for toxicity tests.
2. Working with a microscope.
3. Working under sterile conditions.
4. Breeding and cultivation conditions of the test organisms (Daphnia magna, Folsomia candida).
5. Planning of experiments, designing concentration series,
6. Measurement by digital image analysis.
7. Test on brine shrimp (Artemia salina).
8. Growth inhibition test on chlorococcal algae (Desmodesmus subspicatus).
9. Growth inhibition test of aquatic macrophytes - duckweed (Lemna minor).
10.Test of germination and root growth inhibition of mustard (Sinapis alba).
11.Test of inhibition of dehydrogenase activity of soils.
12.Bioluminiscence inhibition test using Aliivibrio fischeri.
13.statistical evaluation of measured data (NOEC, LOEC, EC50).
14.Protocols processing and comparison of results.
Last update: Mocová Klára Anna (04.02.2025)
1. Úprava vzorků pro testy toxicity.
2. Práce s mikroskopem.
3. Práce ve sterilním prostředí.
4. Chovy a kultivační podmínky testovacích organismů (Daphnia magna, Folsomia candida).
Apply basic laboratory techniques in ecotoxicological practice according to provided standard operating procedures (organism handling, microscopy, sterile work).
Perform standard ecotoxicity tests across different trophic levels (producers, consumers, decomposers) using reference chemicals and real environmental samples.
Quantify biological responses of organisms (e.g., growth, mortality, pigmentation) using instrumental and optical methods (spectrophotometry, image analysis).
Calculate key ecotoxicological parameters (percentage of inhibition or stimulation, determine EC50 values) from individual, provided, or model datasets.
Identify experimental errors (e.g., invalid controls) while correctly interpreting specific biological phenomena in data (e.g., growth stimulation) and propose modifications to concentration ranges based on them.
Design as a team a basic conceptual strategy and a timeline (reflecting the logistics of media and organism preparation over time) for the ecotoxicological assessment of an unknown environmental sample.
Last update: Mocová Klára Anna (21.06.2026)
Studenti získají následující dovednosti:
Aplikovat základní laboratorní techniky v ekotoxikologické praxi podle zadaných pracovních návodů (manipulace s organismy, mikroskopování, práce ve sterilním prostředí).
Provést standardní testy ekotoxicity na různých trofických úrovních (producenti, konzumenti, destruenti) s využitím referenčních chemických látek i reálných vzorků životního prostředí.
Kvantifikovat biologické odpovědi organismů (např. růst, mortalita, pigmentace) pomocí instrumentálních a optických metod (spektrofotometrie, obrazová analýza).
Vypočítat klíčové ekotoxikologické parametry (procento inhibice či stimulace, určit hodnotu EC50 z vlastních, poskytnutých či modelových datových sad.
Rozpoznat experimentální chyby (např. neplatnost kontroly) a zároveň správně interpretovat specifické biologické jevy v datech (např. stimulaci růstu) a na jejich základě navrhnout úpravu koncentrační řady.
Navrhnout v týmu základní koncepční strategii a časový harmonogram (zohledňující logistiku přípravy médií a organismů v čase) pro ekotoxikologické hodnocení neznámého environmentálního vzorku.