The aim of the course is to introduce students to the principles of production of products of the biotechnology industry, some of which are used in the food industry, others in the chemical industry and other industries. In many cases, these are products that are commonly produced from petroleum, but alternatively, biotechnological processes can be used for their production. The course is structured from raw materials, through the microorganisms used, their metabolic pathways to the isolation and purification of the desired products. Emphasis is placed on the use of by-products and wastes from agriculture, food and other industrial production as raw materials for biotechnological applications. Each technology is assembled in unit operations and emphasis is placed on basic microbiological, biochemical, chemical, physical and engineering principles. The student is also introduced to the apparatus required for the technology. The course includes the solution of a group assignment - technology design.
Last update: Cibulková Jana (20.10.2025)
Cílem předmětu je seznámit studenty s principy výroby produktů biotechnologického průmyslu, z nichž některé nacházejí využití v potravinářské sféře, jiné v chemickém průmyslu a dalších odvětvích. V řadě případů jde o produkty, které se běžně vyrábějí z ropy, avšak alternativně lze pro jejich produkci využít biotechnologické postupy. Předmět je koncipován strukturovaně od surovin, přes používané mikroorganismy, jejich metabolické dráhy až k izolaci a purifikaci žádaných produktů. Akcentováno je využití vedlejších produktů a odpadů ze zemědělství, potravinářství a jiných průmyslových výrob jako surovin pro biotechnologické využití. Každá technologie je sestavena po jednotkových operacích a důraz je kladen na základní mikrobiologické, biochemické, chemické, fyzikální a inženýrské principy. Student je seznamován i s aparaturou potřebnou pro danou technologii. Součástí předmětu je řešení skupinového úkolu - návrh technologie.
Last update: Cibulková Jana (20.10.2025)
Course completion requirements -
Účast na přednáškách je doporučená, není však kontrolována.
Cvičení je organizováno formou řešení skupinového úkolu pod vedením pedagoga. Konzultace skupinového úkolu probíhají pravidelně během semestru a jsou organizovány vedoucím úkolu (pedagogem) nebo mohou být vyžádány studenty.
Nedílnou součástí výuky je e-learningový výukový kurz rozdělený do bloků, v rámci kterých jsou studentům k dispozici materiály pro podporu učení, včetně elektronických učebnic, prezentací, přednášek a dalších doplňkových materiálů. Součástí e-learningu je vzorové řešení skupinového příkladu.
Last update: Cibulková Jana (20.10.2025)
Účast na přednáškách je doporučená, není však kontrolována.
Cvičení je organizováno formou řešení skupinového úkolu pod vedením pedagoga. Konzultace skupinového úkolu probíhají pravidelně během semestru a jsou organizovány vedoucím úkolu (pedagogem) nebo mohou být vyžádány studenty.
Nedílnou součástí výuky je e-learningový výukový kurz rozdělený do bloků, v rámci kterých jsou studentům k dispozici materiály pro podporu učení, včetně elektronických učebnic, prezentací, přednášek a dalších doplňkových materiálů. Součástí e-learningu je vzorové řešení skupinového příkladu.
Last update: Cibulková Jana (20.10.2025)
Literature -
Obligatory:
Moo-Young, M. Comprehensive Biotechnology (2nd ed.). Amsterdam: Elsevier, 2011, s. ISBN 9780080885049.
Mousdale, David M.. Biofuels, biotechnology, chemistry, and sustainable development. Boca Raton: CRC Press, 2008, https://vufind.techlib.cz/Record/000654223 s. ISBN 978-1-4200-5124-7.
Recommended:
Scragg, A. H.. Environmental biotechnology. Oxford: Oxford University, 2005, https://vufind.techlib.cz/Record/000962794 s. ISBN 0-19-926867-3.
Last update: Cibulková Jana (20.10.2025)
Povinná:
Moo-Young, M. Comprehensive Biotechnology (2nd ed.). Amsterdam: Elsevier, 2011, s. ISBN 9780080885049.
Mousdale, David M.. Biofuels, biotechnology, chemistry, and sustainable development. Boca Raton: CRC Press, 2008, https://vufind.techlib.cz/Record/000654223 s. ISBN 978-1-4200-5124-7.
Doporučená:
Scragg, A. H.. Environmental biotechnology. Oxford: Oxford University, 2005, https://vufind.techlib.cz/Record/000962794 s. ISBN 0-19-926867-3.
Volitelná:
W.J. Thieman, M.A. Palladino. Introduction to Biotechnology. dostupné z:
https://archive.org/details/introduction-of-biotechnology-william-j.-thieman...-3rd-ed./page/11/mode/2up: Pearson, 2023, s. ISBN 1-292-02761.
Last update: Cibulková Jana (20.10.2025)
Teaching methods -
S novou látkou jsou studenti seznamováni prostřednictvím přednášek. Studenti jsou zároveň podněcováni k diskusi o tématech a k aktivnímu pokládání otázek.
Studenti jsou vedeni k tomu, aby pochopili návaznost jednotlivých jednotkových operací a dokázali popsat celé výrobní schema jednotlivých procesů. K tomu slouží zejména skupinový úkol, který zároveň vede studenty ke spolupráci.
Výuka je zpestřena prostřednictvím zvaných přednášek odborníků z praxe.
Last update: Cibulková Jana (20.10.2025)
S novou látkou jsou studenti seznamováni prostřednictvím přednášek. Studenti jsou zároveň podněcováni k diskusi o tématech a k aktivnímu pokládání otázek.
Studenti jsou vedeni k tomu, aby pochopili návaznost jednotlivých jednotkových operací a dokázali popsat celé výrobní schema jednotlivých procesů. K tomu slouží zejména skupinový úkol, který zároveň vede studenty ke spolupráci.
Výuka je zpestřena prostřednictvím zvaných přednášek odborníků z praxe.
Last update: Cibulková Jana (20.10.2025)
Requirements to the exam -
The exam can only be taken after credit has been obtained. Credit is obtained for active participation in solving a group task, handing in a report to the task leader and presenting the whole task.
The examination is oral and covers all topics discussed in lectures.
Last update: Cibulková Jana (20.10.2025)
Ke zkoušce se lze přihlásit až po získání zápočtu. Zápočet je získán za aktivní podíl na řešení skupinového úkolu, odevzdáním protokolu vedoucímu úkolu a prezentací celého úkolu.
Zkoušení probíhá ústní formou a zahrnuje všechna témata probíraná na přednáškách.
Last update: Cibulková Jana (20.10.2025)
Syllabus -
1. Substrates for biotechnology
Traditional substrates - food crops, second- and third-generation substrates - lignocellulosic materials, food waste, algal biomass, industrial wastes, processing of gases as substrates, ensiling as a method of storing rapidly decomposing wastes
2. The concept of biorefinery in biotechnology, "next generation industrial biotechnology" (NGIB)
Mimicking oil processing in biomass processing, NGIB concept, development of a microbial strain for NGIB, cyclical arrangement of technology, water recycling, heat recovery, circular economy
3. Genetically modified organisms and their use in biotechnology (and agriculture)
GM microorganisms and plants, legislative rules, production of recombinant proteins and small molecules by GMMs
4. Production of industrial enzymes by microorganisms
Microbial enzyme producers, cultivation systems (solid substrate cultivation, submerged cultivation)
Edible mushrooms, in vitro cultivation of animal muscle cells for human nutrition
7. Cultivation of algae for various applications
Combining algae cultivation with CO2 production, photobioreactors, microalgae, cultivation of macroalgae (seaweed) in marine aquaculture
8. Biofuel production using microorganisms
Ethanol production - traditional versus next generation, ethanol production using acetogens, obtaining anhydrous ethanol; biobutanol and other microbial fuels
9. Food ethanol production
Wholesale ethanol and its production, true distillates and liqueurs, different raw materials, different products
10. Fermented dairy products and cheese using microorganisms
Dairy products, cheese
11. Microbial acid production from renewable raw materials
For the food industry - acetic, lactic, citric
For industrial use - lactic (polymers), itaconic, gluconic
12. Microbial production of degradable plastics
Polyhydroxyalkanoates, use of fungal mycelium in packaging materials, others
13. Microbial production of amino acids
Amino acids for the food, feed and pharmaceutical industries, traditional and "next generation" methods of producer development, examples of production
14. Aerobic and anaerobic waste treatment as an integral part of the biotechnology process Aerobic systems, biogas production, biohydrogen, composting
Last update: Cibulková Jana (20.10.2025)
1. Substráty pro biotechnologii
Tradiční substráty – potravinářské plodiny, substráty druhé a třetí generace – lignocelulózové materiály, potravinářské odpady, řasová biomasa, průmyslové odpady, zpracování plynů jako substrátů, silážování jako metoda skladování odpadů, které podléhají rychlému rozkladu
2. Koncept biorafinérie v biotechnologii, „next generation industrial biotechnology“ (NGIB)
Napodobení zpracování ropy při zpracování biomasy, NGIB koncept, vývoj mikrobiálního kmene pro NGIB, cyklické uspořádání technologie, recyklace vody, rekuperace tepla, oběhové hospodářství
3. Geneticky modifikované organismy a jejich využití v biotechnologiích (a zemědělství)
GM mikroorganismy a rostliny, legislativní pravidla, produkce rekombinantních proteinů a malých molekul pomocí GMM
4. Produkce průmyslových enzymů pomocí mikroorganismů
Mikrobní producenti enzymů, kultivační systémy (kultivace na pevném substrátu, submerzní kultivace)
Jedlé houby, kultivace živočišných svalových buněk in vitro pro lidskou výživu
7. Pěstování řas pro různé využití
Spojení kultivace řas s produkcí CO2, fotobioreaktory, mikrořasy, pěstování makrořas (chaluh) v mořské akvakultuře
8. Produkce biopaliv pomocí mikroorganismů
Produkce ethanolu – tradiční versus dalších generací, produkce etanolu pomocí acetogenů, získání bezvodého etanolu; biobutanol a další mikrobiální paliva
9. Potravinářská produkce etanolu
Velejemný etanol a jeho produkce, pravé destiláty a likéry, různé suroviny, různé produkty
10. Kysané mléčné výrobky a sýry s využitím mikroorganismů
Mléčné výrobky, sýry
11. Mikrobiální produkce kyselin z obnovitelných surovin
Pro potravinářství – octová, mléčná, citronová
Pro průmyslové využití – mléčná (polymery), itakonová, glukonová
12. Mikrobiální produkce rozložitelných plastů
Polyhydroxyalkanoáty, využití houbového mycelia v obalových materiálech, další
13. Mikrobiální produkce aminokyselin
Aminokyseliny pro potravinářství, krmivářství a farmacii, tradiční a „next generation“ metody vývoje producentů, příklady produkce
14. Aerobní a anaerobní zpracování odpadů jako integrální část biotechnologického procesu Aerobní systémy, produkce bioplynu, biovodík, kompostování
Last update: Cibulková Jana (20.10.2025)
Learning outcomes -
Students will be able to:
Design a simple technological variant of the production process for microbial products covered in the course or related products.
Select a suitable microorganism and, based on its properties, design a culture medium, culture conditions, including the process management method and the design of product isolation and purification methods.
calculate basic bioengineering parameters of processes.
design the necessary equipment, perform a basic operational balance, and design waste treatment.
work in a group on a project task and present the resulting solution
discuss the selected process for which they will prepare a technological design
Last update: Patáková Petra (09.03.2026)
Studenti budou umět:
navrhnout jednoduchou technologickou variantu postupu výroby pro mikrobní produkty probírané v předmětu nebo produkty příbuzné.
vybrat vhodný mikroorganismus a podle jeho vlastností navrhnout kultivační médium, kultivační podmínky včetně způsobu vedení procesu a návrhu metod izolace a purifikace produktu.
vypočítat základní bioinženýrské parametry procesů.
navrhnout potřebné aparáty, provést základní provozní bilanci a navrhnout zpracování odpadů.
pracovat ve skupině na projektovém úkolu a prezentovat výsledné řešení
diskutovat o vybraném procesu, pro který zpracují technologický návrh
Last update: Patáková Petra (09.03.2026)
Entry requirements -
Entry requirements in the scope of the subject Microbiology, Chemical Engineering I, Biochemistry of the UCT Prague bachelor study program
Last update: Cibulková Jana (20.10.2025)
Vstupní požadavky v rozsahu učiva předmětu Mikrobiologie, Chemické inženýrství I, Biochemie vyučované v bakalářském SP na VŠCHT Praha
Last update: Cibulková Jana (20.10.2025)
Registration requirements -
Entry-level knowledge in microbiology, biochemistry, and chemical engineering at the bachelor's degree level
Last update: Cibulková Jana (20.10.2025)
Vstupní znalosti v oborech mikrobiologie, biochemie a chemické inženýrství v rozsahu bakalářského studia