Students will be able to:

Describe biochemical processes by mathematical methods used in physical chemistry.

Apply the principles of physical chemistry in interpretation and solving problems occuring in biological systems. The problems solution includes numerical analysis of chosen physical chemistry parameters.

Independently propose a method and design a protocol for experimental determination of chosen physical chemistry parameters in biological systems and analyse obtained data.

Studenti budou umět:

Popsat biochemické děje pomocí matematického aparátu používaného ve fyzikální chemii.

Aplikovat principy fyzikální chemie při analýze a řešení problémů v biologických systémech včetně numerického řešení hodnot vybraných fyzikálně-chemických parametrů.

Samostatně navrhnout postupy pro experimentální stanovení vybraných fyzikálně-chemických veličin v biologických systémech a analyzovat získané výsledky.

The course is finished by taking the exam (both oral and written).

Předmět je zakončen zkouškou, která se skládá z písemné a ústní části.

Obligatory:

• Physical chemistry for the life sciences, Atkins, P. W., De Paula, Julio
• The physical basis of biochemistry, the foundations of molecular biophysics, Bergethon, P. R., Bergethon, Kristin E., 2010

Povinná:

• Physical chemistry for the life sciences, Atkins, P. W., De Paula, Julio
• The Physical Basis of Biochemistry, Bergethon P.R., 1998
• Biofysikální chemie, Kodíček, Milan, Karpenko, Vladimír, 2013

The course is aimed at physico-chemical approach for the study of biological systems at different levels. The key topics including theoretical background as well as methods for experimental data mining will be discussed. The aspects of biomacromolecules´ structure and interactions, the biogenesis of biomacromolecules´ complexes including membranes are discussed from the thermodynamical point of view. Further discussed topics include kinetics of important bio-processes (e.g. membrane transport, pharmacokinetic description of human body). The integral part of the course is a discussion about selected methods suitable for analysis of biological systems and their applications in concrete situations.

Předmět se zaměřuje na aplikaci fyzikálně-chemických metod na různých úrovních biologických systémů. Postupně budou diskutována jak klíčová témata z teoretických základů této disciplíny, tak i metody vedoucí k experimentálnímu získání dat. Na základě termodynamického popisu systémů budou diskutovány jevy zahrnující změny struktury biomakromolekul, jejich vzájemné interakce a vznik nadmolekulových útvarů včetně biomembrán. Dále bude studována kinetika některých důležitých procesů, jako například transport přes membrány nebo farmakokinetický popis lidského organismu. Nedílnou součástí bude rozbor vybraných metod vhodných pro analýzu biologických systémů a jejich adaptace na konkrétní případy.

https://e-learning.vscht.cz/course/view.php?id=333