Chemical biology is a modern scientific field at the borderline between chemistry and biology. It uses small organic compounds to affect various biological processes. A chemical biology course covers a territory where organic chemistry, molecular and cell biology, cheminformatics and bioinformatics meet. The course will introduce small molecules as tools for subsequent biology research or as a basis for novel drug development.
Last update: ROZ143 (10.06.2013)
Chemická biologie je moderní obor na pomezí chemie a biologie, který využívá chemické sloučeniny k ovlivnění biologických procesů. Kurs chemické biologie pokrývá oblast na pomezí organické chemie, biochemie, molekulární a buněčné biologie, cheminformatiky a bioinformatiky. Přednáškový kurs uvede studenty do problematiky vývoje malých molekul jako nástrojů pro další výzkum, popř. jako základu pro vývoj nových léčiv.
Aim of the course -
Last update: ROZ143 (09.07.2013)
Students will be able to:
Understand how small molecules bind to various molecular targets.
Understand how small molecules affect e.g. protein-protein interactions or signalling cell pathways.
Know basic methods for molecular target identification, experimental bioactivity high throughput testing, and basic principles of molecular tools or drugs development.
Last update: ROZ143 (10.06.2013)
Studenti budou umět:
Porozumí, jak se malé organické molekuly váží k různým molekulárním cílům.
Budou chápat, jak malé molekuly ovlivňují např. protein-protein interakce či fungování signálních drah v buňce.
Budou znát základní postupy pro identifikaci molekulárních cílů, pro experimentální testování biologické aktivity a pro vývoj molekulárních sond či léčiv.
Literature -
Last update: ROZ143 (09.07.2013)
R: Schreiber Stuart L., Kapoor Tarun M., Wess Günther, Chemical Biology: From Small Molecules to Systems Biology and Drug Design, Wiley-VCH 2007, ISBN: 3527311505
A: Alberts Bruce, Molecular Biology of the Cell, Taylor & Francis 2008, ISBN: 0815341113
Last update: ROZ143 (09.07.2013)
Z: Schreiber Stuart L., Kapoor Tarun M., Wess Günther, Chemical Biology: From Small Molecules to Systems Biology and Drug Design, Wiley-VCH 2007, ISBN: 3527311505
D: Alberts Bruce, Molecular Biology of the Cell, Taylor & Francis 2008, ISBN: 0815341113
Learning resources -
Last update: ROZ143 (09.07.2013)
Video course "Introduction to Chemical Biology", University of California Irvine, http://www.youtube.com/playlist?list=PLqOZ6FD_RQ7nT_YuhXKJVEDPjGvj5Lspa
Last update: ROZ143 (09.07.2013)
Video kurs "Introduction to Chemical Biology", University of California Irvine, http://www.youtube.com/playlist?list=PLqOZ6FD_RQ7nT_YuhXKJVEDPjGvj5Lspa
Syllabus -
Last update: ROZ143 (09.07.2013)
1. Introduction to chemical biology: history and modern approaches
2. Small molecules, natural products, peptides, DNA/RNA
3. Principles and methods in chemical biology
4. High-throughput screening
5. Molecular tools development
6. Protein-protein interactions
7. Cell signalling pathways
8. Phenotype tests
9. Model organisms and chemical genetics
10. Molecular targets identification
11. Drug development and pharmacology
12. Combinatorial approaches in chemical biology
13. Small molecules and system biology
14. Informatics in chemical biology
Last update: ROZ143 (09.07.2013)
1. Úvod do chemické biologie: historie a současné přístupy
2. Malé molekuly, přírodní látky, peptidy, DNA/RNA
3. Principy a metody v chemické biologii
4. High-throughput screening
5. Vývoj nástrojů a molekulárních sond
6. Protein-protein interakce
7. Signální dráhy v buňce
8. Fenotypové testy
9. Modelové organismy a chemická genetika
10. Identifikace molekulárních cílů
11. Vývoj léčiv a farmakologie
12. Kombinatoriální přístupy v chemické biologii
13. Malé molekuly a systémová biologie
14. Informatika v chemické biologii
Registration requirements -
Last update: ROZ143 (09.07.2013)
Organic chemistry, Biochemistry
Last update: ROZ143 (09.07.2013)
Organická chemie, Biochemie
Teaching methods
Activity
Credits
Hours
Účast na přednáškách
1
28
Příprava na přednášky, semináře, laboratoře, exkurzi nebo praxi