Předmět je zaměřen na rozšíření a prohloubení teoretických znalostí získaných v předmětu Bioinženýrství I a jejich aplikaci pro zpracovávání bioinženýrských dat. Na praktických příkladech je postupně budován znalostní a dovednostní aparát pro jednotlivé kroky směřující k dosažení průmyslové realizace bioprocesů – plánování, zpracování, interpretaci, scale-up/scale-down a modelování bioinženýrských dat z různých měřítek bioprocesu. Předmět je primárně zaměřen na získání znalostí a praktických dovedností pro inženýrskou implementaci jednotlivých fází bioprocesu i bioprocesu jako celku.
Poslední úprava: Halecký Martin (20.01.2026)
The course focuses on extending and deepening the theoretical knowledge acquired in Bioengineering I and its application to bioengineering data processing. Practical examples are used to gradually build the knowledge and skills apparatus for the individual steps towards achieving industrial implementation of bioprocesses - planning, processing, interpretation, scale-up/scale-down and modelling of bioengineering data from different scales of bioprocess. The course is primarily focused on acquiring knowledge and practical skills for the engineering implementation of individual phases of the bioprocess and the bioprocess as a whole.
Poslední úprava: Halecký Martin (20.01.2026)
Podmínky zakončení předmětu (Další požadavky na studenta) -
Účast na přednáškách a cvičeních je předpokladem pro získání zápočtu.
Nedílnou součástí výuky je e-learning výukový kurz rozdělený do bloků s komplexními podklady učiva včetně pomocných materiálů a psaných návodů a videonávodů pro používané softwarové nástroje.
Konzultace jsou poskytovány na vyžádání.
Poslední úprava: Halecký Martin (20.01.2026)
Attendance lectures and exercises is a prerequisite for obtaining credit.
An integral part of the teaching is an e-learning course divided into blocks with comprehensive course materials, including supporting materials and written and video tutorials for the software tools used.
Consultations are provided upon request.
Poslední úprava: Halecký Martin (20.01.2026)
Literatura -
Doporučená:
Moo-Young M.. Comprehensive Biotechnology. : Elsevier, 2019, s. ISBN 9780444640475 .
Doran P. M.. Bioprocess Engineering Principles. London: Academic, 1995, s. ISBN 9780122208553 .
Dunn I.J. et al. Biological Reaction Engineering. : Wiley-VCH, 2003, s. ISBN 9783527307593 .
Najafpour G.D.. Biochemical Engineering and Biotechnology. : Elsevier, 2007, s. ISBN 9780444528452.
Poslední úprava: Halecký Martin (20.01.2026)
Recommended:
Moo-Young M.. Comprehensive Biotechnology. : Elsevier, 2019, s. ISBN 9780444640475.
Doran P. M.. Bioprocess Engineering Principles. London: Academic, 1995, s. ISBN 9780122208553 .
Dunn I. J. et al.. Biological Reaction Engineering. : Wiley-VCH, 2003, s. ISBN 9783527307593 .
Najafpour G. D.. Biochemical Engineering and Biotechnology. : Elsevier, 2007, s. ISBN 9780444528452.
Poslední úprava: Halecký Martin (20.01.2026)
Metody výuky -
Přednášky s praktickými případy a odvozováním matematických vztahů a inženýrských řešení s důrazem na pochopení komplexnosti a nutnosti syntézy dříve a nově nabytých znalostí a dovedností.
Cvičení se společně řešenými příklady, na které navazují individuálně řešené příklady s pomocí softwarových nástrojů v PC učebně. Studenti aplikují teoretické znalosti z přednášek v rámci řešení postupně se rozvíjeních a na sebe navazujících příkladů ve finále komplexně pokrývajících celou strukturu bioprocesu od plánovaní experimentů po modelování a simulaci.
Poslední úprava: Halecký Martin (20.01.2026)
Lectures with practical cases and derivation of mathematical relationships and engineered solutions with an emphasis on understanding the complexity and the necessity of synthesizing previously and newly acquired knowledge and skills.
Exercises with jointly solved case studies, which are followed by individually solved case studies using software tools in the PC classroom. Students apply theoretical knowledge from lectures in the solution of gradually developing and interconnected partial case studies in the final covering the entire structure of the bioprocess from experiment planning to modeling and simulation.
Poslední úprava: Halecký Martin (20.01.2026)
Požadavky ke zkoušce (Forma způsobu ověření studijních výsledků) -
Zkouška je založena na ústní formě. Skupina studentů prezentuje vyřešené zadání komplexní bioinženýrské úlohy následované diskuzí.
Podmínkou udělení zápočtu je aktivní účast na přednáškách a cvičeních. Student může vynechat maximálně dvě přednášky a cvičení bez omluvy. S relevantní omluvou nad 60 % účasti lze zápočet získat za standardní protokol a obhajobu projektu v týmu. S relevantní omluvou pod 60 % účasti lze zápočet získat pouze za samostatný protokol a obhajobu.
Výsledná známka je dána váženým průměrem dvou hodnot získaných při ústní zkoušce: 1. skupinová prezentace vyřešeného individuálního projektu (váha 33 %) a 2. individuální diskuze se studentem (váha 64 %).
Poslední úprava: Halecký Martin (20.01.2026)
The exam is based on an oral form. A team of students presents a solved case study of a complex bioengineering task followed by a discussion.
The condition for granting credit is active participation in lectures and seminars. A student may miss a maximum of two lectures and exercises without an excuse. With a relevant excuse of over 60% participation, credit can be obtained for the standard protocol and defense of the project in a team. With a relevant excuse of under 60% participation, credit can only be obtained for an individual protocol and defense.
The final grade is given by the weighted average of two values obtained during the oral exam: 1. team presentation of the solved individual project (weight 33%) and 2. individual discussion with the student (weight 64%).
Poslední úprava: Halecký Martin (20.01.2026)
Sylabus -
01. Úvod a rozbor kroků k dosažení průmyslové realizace bioprocesů
02. Statistické zpracování bioinženýrských dat – program Statistica, popisná statistika
03. Statistické zpracování bioinženýrských dat – testování hypotéz
04. Plánování experimentů
05. Plánování a vyhodnocení experimentů v mikroměřítku
06. Plánování a vyhodnocení experimentů v Erlenmeyerových baňkách, scale-up
07. Plánování a vyhodnocení experimentů v bioreaktoru, scale-up
08. Plánování a vyhodnocení experimentů ve čtvrtprovozním reaktoru, scale-up a scale-down
09. Matlab a Simulink jako pokročilé nástroje pro modelování a simulaci bioinženýrských dat
10. Hmotový model bioprocesu a simulace
11. Hmotový model přestupu kyslíku a simulace
12. Model přestupu tepla a simulace
13. AI v biotechnologických a bioinženýrských aplikacích
14. Prezentace skupinových projektů
Poslední úprava: Halecký Martin (20.01.2026)
01. Introduction and analysis of steps to achieve industrial implementation
02. Statistical processing of bioengineering data – Statistica program, descriptive statistics
03. Statistical processing of bioengineering data – hypothesis testing
04. Desing of experiments
05. Desing and evaluation of microscale experiments
06. Desing and evaluation of experiments in Erlenmeyer flasks, scale-up
07. Desing and evaluation of experiments in bioreactor, scale-up
08. Desing and evaluation of experiments in pilot bioreactor, scale-up and scale-down
09. Matlab and Simulink as advanced tools for modelling and simulation of bioengineering data
10. Mass model of bioprocess and simulation
11. Mass model of oxygen transfer and simulation
12. Heat transfer model and simulation
13. AI in biotechnology and bioengineering applications
14. Presentation of group projects
Poslední úprava: Halecký Martin (20.01.2026)
Výsledky učení -
Po absolvování tohoto předmětu budou studenti schopni analyzovat a plánovat experimenty pro získání bioinženýrských dat, optimalizovat a statisticky vyhodnocovat bioinženýrská data pro různá měřítka bioprocesů pomocí programu Statistica, modelovat a simulovat bioprocesy (hmotová a entalpická bilance) za pomocí programu MATLAB a navrhnout vhodný výrobní proces k dosažení průmyslové realizace bioprocesů.
Poslední úprava: Halecký Martin (20.01.2026)
After completing this course, students will be able to analyze and design experiments to obtain bioengineering data, optimize and statistically evaluate bioengineering data for different scales of bioprocesses using Statistica software, model and simulate bioprocesses (mass and heat balance) using MATLAB, design a suitable production process to achieve industrial implementation of bioprocesses.
Poslední úprava: Halecký Martin (20.01.2026)
Studijní prerekvizity -
Vstupní požadavky v rozsahu učiva předmětu Chemické inženýrství A nebo Chemické inženýrství I a Biochemie A nebo Biochemie 1 a Bioinženýrství I.
Poslední úprava: Halecký Martin (20.01.2026)
Entrance requirements within the scope of the curriculum of the subjects Chemical Engineering A or Chemical Engineering I and Biochemistry A or Biochemistry I and Bioengineering I.
Poslední úprava: Halecký Martin (20.01.2026)
Zátěž studenta
Činnost
Kredity
Hodiny
Konzultace s vyučujícími
0.2
6
Obhajoba individuálního projektu
0.1
3
Účast na přednáškách
1.5
42
Příprava na přednášky, semináře, laboratoře, exkurzi nebo praxi