|
|
|
||
Poslední úprava: Pátková Vlasta (08.06.2018)
|
|
||
Poslední úprava: Pátková Vlasta (08.06.2018)
Studenti budou umět:
|
|
||
Poslední úprava: Pátková Vlasta (08.06.2018)
Literatura Z: Engel T. Gasteiget J. Applied Chemoinformatics: Achievements and Future Opportunities, Wiley-VCH, 2018, ISBN 352734201X Z: Bajorath J. Chemoinformatics for Drug Discovery, Wiley, 2013, ISBN 1118139100
|
|
||
Poslední úprava: Pátková Vlasta (08.06.2018)
Online materiály k přednášce |
|
||
Poslední úprava: Pátková Vlasta (08.06.2018)
Chemoinformatické metody pro optimalizaci kandidátních struktur – MMPA (matched molecular pairs) analýza, bioisostery, scaffold hopping, multiobjektivní optimalizační metody
Biologická informace v chemoinformatice – chemogenomický prostor, experimentální a výpočetní přístupy jeho charakterizace, afinitní fingerprinty a jejich aplikace, proteochemometrie, deskriptory popisující interakci ligand/protein, modelování interakčního prostoru
Teorie informace a „fingerprint engineering“ - analýza deskriptorů a metody redukce dat
QSAR modelování – záludnosti porovnávání a hodnocení QSAR modelů, doména aplikovatelnosti QSAR modelu, základní přístupy, jejich výhody a nevýhody, metody pro definici domény aplikovatelnosti klasifikačních a regresních modelů, metody hlubokého učení a jejich aplikace
Generování a explorace chemického prostoru, chemotypová diverzita a její hodnocení, farmakoforové modelování (topologické farmakofory a farmakoforové otisky prstů), molekulové dokování (generování konformerů, flexibilita proteinu, konsensuální skórování) |
|
||
Poslední úprava: Pátková Vlasta (08.06.2018)
Ústní zkouška |