PředmětyPředměty(verze: 963)
Předmět, akademický rok 2013/2014
  
Chemoinformatika - N342004
Anglický název: Bioinformatics
Zajišťuje: Ústav chemie přírodních látek (342)
Fakulta: Fakulta potravinářské a biochemické technologie
Platnost: od 2013 do 2015
Semestr: zimní
Body: zimní s.:2
E-Kredity: zimní s.:2
Způsob provedení zkoušky: zimní s.:
Rozsah, examinace: zimní s.:1/1, Z [HT]
Počet míst: neurčen / neurčen (neurčen)
Minimální obsazenost: neomezen
Stav předmětu: vyučován
Jazyk výuky: čeština
Způsob výuky: prezenční
Způsob výuky: prezenční
Úroveň:  
Staré označení: BINF
Poznámka: předmět je možno zapsat mimo plán
povolen pro zápis po webu
Garant: Raich Ivan doc. Dr. Ing.
Je záměnnost pro: N342504
Termíny zkoušek   Rozvrh   
Anotace -
Předmět je zaměřen na vyhledávání chemických, biochemických, potravinářských a dalších souvisejících údajů a informací především v komerčně dostupných zdrojích a databázích, ale i v jejich volně dostupných alternativách na Internetu. Kromě ryze praktického aspektu se studenti seznámí s tím, jak si chemici vyměňují informace o nových poznatcích, s detailním členěním databáze Chemical Abstracts a zvláštnostmi vyplývajícími z použití chemických strukturních vzorců.
Poslední úprava: TAJ342 (18.11.2012)
Výstupy studia předmětu -

Studenti budou umět:

Vyhledávat chemické sloučeniny, struktury a reakce a jejich nejrůznější vlastnosti

Vyhledávat různé typy dokumentů - články, knihy patenty

Zvolit při rešerši optimální vyhledávací strategii

Efektivně pracovat s bibliografickými citacemi v chemii

Poslední úprava: TAJ342 (18.11.2012)
Literatura -

Z: Šilhánek J.: Chemická informatika, 1. vyd., VŠCHT Praha, Praha 2002 (http://vydavatelstvi.vscht.cz/knihy/uid_isbn-80-7080-465-3/pages-img/)

D: Gasteiger J., Engel T., Eds.:Chemoinformatics, Wiley-VCH, Weinheim 2004 (http://onlinelibrary.wiley.com/book/10.1002/3527601643;jsessionid=EFEE61689F5CD035A7CB9AE5291EDEB8.d02t01)

Poslední úprava: TAJ342 (18.11.2012)
Sylabus -

1. Základní pojmy, informatika, koloběh informací v chemii, psaní laboratorních poznámek

2. Proces publikování v chemii, primární dokumenty, elektronické a tištěné časopisy na VŠCHT, jejich typy

3. Bibliografické citace, identifikační kódy, sekundární informační zdroje, vypracovávání rešerší

4. Chemical Abstracts - historie , členění, elektronické databáze, SciFinder

5. SciFinder - vyhledávání alfanumerických údajů, vícekriteriální dotazy, export dat

6. SciFinder - vyhledávání struktur a reakcí, substrukturní vyhledávání, generické atomy a skupiny

7. Beilsteinovo kompendium - historie, dostupné údaje, elektronická verze Reaxys, Gmelin

8. Citační databáze, Web of Science, citované a citující reference, Scopus

9. FSTA, Biology Abstracts, FoodNetBase, bezpečnostní listy (MSDS)

10. Další strukturní a reakční databáze, další poskytovatelé dat, chemické informace na Internetu

11. Patenty - patentová ochrana a proces patentování

12. Správa bibliografických citací v programu EndNote, export a import dat, struktura dat

13. EndNote - organizace dat, slovníky, filtry a styly, použití a výstupy

14. Bioinformatika - databáze pro molekulární biologii a genetiku, molekulární modelování

Poslední úprava: SMIDOVAL (14.12.2012)
Studijní opory -

Raich I.: Podklady k přednáškám a cvičením (http://www.vscht.cz/lam/new/InformaceProStudenty)

Poslední úprava: TAJ342 (18.11.2012)
Studijní prerekvizity -

Angličtina, Aplikovaná výpočetní technika

Poslední úprava: TAJ342 (18.11.2012)
Zátěž studenta
Činnost Kredity Hodiny
Obhajoba individuálního projektu 0.5 14
Účast na přednáškách 0.5 14
Práce na individuálním projektu 0.5 14
Účast na seminářích 0.5 14
2 / 2 56 / 56
Hodnocení studenta
Forma Váha
Aktivní účast na výuce 20
Průběžné a zápočtové testy 80

 
VŠCHT Praha