Předmět je zaměřen na pochopení principu purifikačních technik používaných při izolaci biomakromolekul. Cílem je naučit posluchače navrhnout správný purifikační postup pro cílovou biomakromolekulu a charakterizovat ji. Tyto vědomosti naleznou uplatnění v mnoha oborech.
Poslední úprava: Lipovová Petra (24.01.2018)
The course focuses on understanding the principles of purification techniques for the isolation of biomolecules. The aim is to teach students how to design a proper procedure for the purification of biomolecules target and characterize it. This knowledge can be used in many fields.
Poslední úprava: Lipovová Petra (24.01.2018)
Podmínky zakončení předmětu (Další požadavky na studenta) -
Složení zkoušky, sestávající z písemné a ústní části a získání zápočtu.
Poslední úprava: Lipovová Petra (11.04.2025)
The examination consists of a written and an oral part, as well as obtaining the course credit.
Poslední úprava: Lipovová Petra (11.04.2025)
Literatura -
Doporučená:
Janson, Jan-Christer, Rydén, Lars. Protein purification, principles, high-resolution methods, and applications. Chichester, New York: Wiley, 1998, https://vufind.techlib.cz/Record/000963961 s. ISBN 0-471-18626-0 (váz.).
Bílková K., Králová B.. Izolace biomakromolekul. Praha: VŠCHT Praha, 1997, s. ISBN 80-7080-288.
Mikkelsen, Susan R., Cortón, Eduardo. Bioanalytical chemistry. : , , https://vufind.techlib.cz/Record/001877497 s. ISBN 978-1-118-30254-5.
Manz, Andreas, Dittrich, Petra S., Pamme, Nicole, Iossifidis, Dimitri. Bioanalytical chemistry. : , , https://vufind.techlib.cz/Record/000962340 s. ISBN 978-1-78326-671-5.
Poslední úprava: prepocet_literatura.php (19.12.2024)
R: Janson J.C.: Protein Purification, Wiley, New York, 1998, ISBN 0471186260
R: Mikkelsen S.R.: Bioanalytical Chemistry, Wiley, New York, 2004, ISBN 0471544477
D: Mikkelsen S.R.: Bioanalytical Chemistry, Wiley, New Jersey, 2016, ISBN 978-1-118-30254-5
D: Manz A., Dittrich P.S., Pamme N., Iossifidis D.: Bioanalytical Chemistry 2nd Edition, London, 2015, ISBN 978-1-78326-671-5
Poslední úprava: Lipovová Petra (09.08.2022)
Metody výuky -
Přednáška, reaguje na současný vývoj oboru a propojuje jej s teoretickou rovinou, studenti sami vyhledávají data a navrhují způsob jejich zpracování, učí se hodnotit i práce jiných studentů.
Poslední úprava: Lipovová Petra (11.04.2025)
The lecture responds to current developments in the field and connects them with theoretical concepts.
Students independently search for data and propose methods for their processing, while also learning to evaluate the work of other students.
Poslední úprava: Lipovová Petra (11.04.2025)
Požadavky ke zkoušce (Forma způsobu ověření studijních výsledků) -
Složení zkoušky, sestávající z písemné a ústní části. Písemná část je povinná, k ústní části lze přistoupit pouze po získání alespoň 50 bodů z písemné části – při dosažení méně než 50 bodů je zkouška hodnocena stupněm F. Podmínkou udělení zápočtu je odevzdání samostatné práce do e-learning a zkontrolování práce kolegy.
Poslední úprava: Lipovová Petra (11.04.2025)
The examination consists of a written and an oral part.
The written part is mandatory, and the oral part can only be taken after achieving at least 50 points in the written part. If fewer than 50 points are obtained, the exam is graded as "F".
The requirement for obtaining the course credit is the submission of an individual project via the e-learning platform and the peer review of a fellow student’s work.
Poslední úprava: Lipovová Petra (11.04.2025)
Sylabus -
1. Úvod - zdroje enzymů, dezintegrace, membránové procesy
2. Srážení, extrakce a centrifugace
3. Materiály pro elektroforetické a chromatografické metody
4. Základní rozdělení a instrumentace
5. Gelová permeační chromatografie
6. Ionexová chromatografie
7. Hydrofobní chromatografie a chromatografie na reversní fázi
8. Afinitní chromatografie
9.-11. Rekombinantní proteiny, produkce a její úskalí
12.Tenkovrstvá chromatografie, sledování průběhu chromatografie a stanovení koncentrace bílkovin
13. Úvod do elektroforetických metod
14. Typy elektroforetických metod
Poslední úprava: Lipovová Petra (11.04.2025)
1. Introduction - source of proteins, dezintegration, membrane process
2. Precipitation, extraction, and centrifugation
3. Materials for chromatographic and eletrophoretic methods
4. The basic division and instrumentation
5. Gel-permeation chromatography
6. Ionex chromatography
7. Hydrophobic chromatography and reversed phase chromatography
8. Affinity chromatography
9.-11. Recombinant proteins, production and troubleshooting
12. Thin layer chromatography, recovery and field of chromatography and determination of proteins concentration
13. Introduction to the electrophoretic methods
14. Types of elektrophoretic methods
Poslední úprava: Lipovová Petra (11.04.2025)
Studijní opory -
Přednášky v elektronické podobě zveřejněné na e-learning.vscht.cz
Poslední úprava: Lipovová Petra (15.01.2018)
e-learning.vscht.cz
Poslední úprava: Lipovová Petra (15.01.2018)
Výsledky učení -
Studenti budou umět:
Principy jednotlivých membránových, chromatografických a elektroforetických metod. Navrhnout primery potřebné pro přípravu rekombinantního proteinu.
Navrhnout a optimalizovat postup na purifikaci proteinu.
Poslední úprava: Lipovová Petra (15.06.2024)
Students will be able to:
Understand the principles of membrane, chromatographic, electrophoretic techniques, and immunoaffinity methods.
Propose a procedure to optimize protein purification.