|
|
|
||
Poslední úprava: Kubová Petra Ing. (03.11.2016)
|
|
||
Poslední úprava: Kubová Petra Ing. (03.11.2016)
Výstupy studia předmětu Studenti budou umět: Porozumí základům ukládání chemických dat v počítači Osvojí si principy a algoritmy pro podstrukturní a podobnostní vyhledávání v chemických databázích Porozumí principům budování chemických knihoven s požadovanými strukturními a chemicko-fyzikálními vlastnostmi Aplikovat metody virtuálního screeningu pro prioritizaci chemických látek pro testování biologické aktivity |
|
||
Poslední úprava: Kubová Petra Ing. (03.11.2016)
Literatura Z: Leach A. R., An Introduction to Chemoinformatics, Springer, 2007, ISBN 1402062907
|
|
||
Poslední úprava: Kubová Petra Ing. (03.11.2016)
1) Úvod do chemoinformatiky 2) Reprezentace 2D struktur v počítači, charakterizace 2D struktur pomocí deskriptorů a fingerprintů 3) Algoritmy pro 2D prohledávání chemických databází, reprezentace chemických reakcí 4) Chemické souborové formáty a SMARTS 5) Reprezentace a vizualizace 3D struktur, zarovnávní 6) Shluková a diversitní analýza 7) Kvantitativní vztah mezi biologickou aktivitou a strukturou látky (QSAR) 8) Virtuální screening 9) Prediktivní modelování 10) Dokování a skórování 11) Faramakoforové modelování 12) Vytěžování znalostí z biologických a chemických informací 13) Analýza HTS dat 14) Počítačový návrh léčiv založený na struktuře a na ligandech |