Studenti budou umět:

• samostatně používat klíčové nástroje pro práci s chemickými informacemi, Chemical Abstracts programem SciFinder a báze dat Beilstein a Gmelin v systému Reaxys vedle několika dalších důležitých informačních zdrojů

• využívat možností formulace molekulárních struktur strukturními editory

• využívat možnosti vyhledávání přeměn chemických sloučenin v reakčních modulech výše uvedených chemických bází dat

Students will be able to:

Independently use the key tools for searching chemistry information, Chemical Abstracts with program SciFinder and databases Beilstein and Gmelin in system Reaxys besides of some other important information sources.

To draw compounds and reactions graphical structure using structure editors

To exploit possibility to search structure transformation/reaction in reaction modules of the above chemistry databases

Z: Šilhánek J.: Chemická informatika, Vydavatelství VŠCHT Praha 2002. ISBN: 80-7080-465-3

Z: Panico, R. et al: Průvodce názvoslovím organických sloučenin podle IUPAC. Academia Praha 2000. ISBN:80-200-0724-5.

D: Šilhánek J., Zetková L.: Chemical Abstracts na CD-ROM. Vydavatelství VŠCHT Praha, 1997. ISBN: 80-7080-304-5

D: Ridley, Damon D.: Information Retrieval: SciFinder. Wiley 2009. ISBN: 978-0-470-71247-4.

R: Šilhánek J.: Chemická informatika, Vydavatelství VŠCHT Praha 2002. ISBN: 80-7080-465-3

R: Panico, R. et al: Průvodce názvoslovím organických sloučenin podle IUPAC. Academia Praha 2000. ISBN:80-200-0724-5.

A: Šilhánek J., Zetková L.: Chemical Abstracts na CD-ROM. Vydavatelství VŠCHT Praha, 1997. ISBN: 80-7080-304-5

A: Ridley, Damon D.: Information Retrieval: SciFinder. Wiley 2009. ISBN: 978-0-470-71247-4.

http://www.cas.org/support/scifi/tutorials.html

http://www.cas.org/support/scifi/tutorials.html

Zápočet je udělován na základě prokázané schopnosti samostatně pracovat s nejdůležitějšími chemickými bázemi dat, především Chemical Abstracts a systémem CrossFire na jednodušších příkladech modelujících praktickou situace chemika v reálných situacích. Podle situace mohou být během semestru zadány krátké testy potvrzující znalost klíčových pojmů a organizačního uspořádání chemických bází dat, poslední lekce je věnována samostatné a individuální realizaci konkrétního dotazu, který v každém případě bude zahrnovat typický úkol vyhledání informací týkající se chemické sloučeniny charakterizované různým způsobem včetně strukturního zadání.

1. Chemické databázové systémy, jejich historie, současný stav a budoucnost.

2. Zásadní koncepce zpracovávání chemických informací v klasické i elektronické formě.

3. Chemická látka a sloučenina jako klíčový předmět zpracování v chemických bázích dat.

4. Popisná identifikace chemických sloučenin vzorcem, možnosti takového popisu.

5. Elektronické formy chemických vzorců a jejich grafické representace.

6. Podrobný popis registračního systému chemických látek a sloučenin - báze dat REGISTRY.

7. Báze dat Chemical Abstracts - verze CAonCD, praktické procvičování věcného i strukturního hledání.

8. Obecná problematika strukturních bází dat a jejich přehled.

9. Systém CrossFire a báze dat Beilstein. Procvičování jejich použití.

10. Problematika anorganických sloučenin a báze dat Gmelin. Demonstrace vyhledávání anorganických sloučenin.

11. Báze dat Reaxys a další možnosti práce se strukturním zadáním chemické sloučeniny.

12. Demonstrace programu SciFinder Scholar a jeho webovské verze.

13. Chemické reakční báze dat, obecná problematika a současné možnosti.

14. Strukturní báze dat v oblasti patentových informací, Markushovy vzorce.

1. Chemistry Database Systems, history, present status and future.

2. Key aspects of chemistry information work-up in classical and electronic form.

3. Chemical compounds as key subject of chemistry information.

4. Principal possibilities of identification of chemical compounds.

5. Computer representation of chemical structures in mathematical and graphical form.

6. Detailed description of chemical compounds registration system - base REGISTRY.

7. Chemical Abstracts databases - version CAonCD, description and practical usage.

8. General aspects of structure databases in chemistry.

9. Beilstein structural database in system Reaxys - practical training.

10. Problem searching inorganic compounds using Gmelin database, practical tasks.

11. System Reaxys and illustration of combine searching structure and factual data.

12. Program SciFinder as the most powerful tool for chemistry information searching.

13. Chemistry reaction databases, general aspects and present possibilities.

14. Structure searching in patent information, Markush formulas.

Obecná a anorganická chemie I

Organická chemie I

General and inorganic chemistry I.

Organic chemistry I.