Studenti budou umět:

rozdělení mikroorganismů, základy taxonomie mikroorganismů, metabolismu a genetiky,

principy stanovení a metabolické aktivity mikroorganismů,

základní laboratorní techniky používané pro stanovení a charakterizaci metabolické aktivity mikroorganismů.

Students will be able to practically apply the knowledge from the field of:

• microorganism taxonomy,

• metabolism and genetic,

• both theoretical and practical basic laboratory techniques used for determination and characterization of microorganisms.

Z: MAIER, Raina M., Ian L. PEPPER a Charles P. GERBA. Environmental Microbiology. 2. vyd. China: Academic Press, 2009, ISBN 978-0-12-370519-8.

D: Schaechter M.: Encyclopedia of Microbiology, 3. vyd. Academic Press, 2009, ISBN: 978-0-12-373944-5.

R: MAIER, Raina M., Ian L. PEPPER a Charles P. GERBA. Environmental Microbiology. 2. vyd. China: Academic Press, 2009, ISBN 978-0-12-370519-8.

A: Schaechter M.: Encyclopedia of Microbiology, 3. vyd. Academic Press, 2009, ISBN: 978-0-12-373944-5.

http://onlinelibrary.wiley.com/journal/10.1111/(ISSN)1462-2920/issues

http://onlinelibrary.wiley.com/journal/10.1111/(ISSN)1462-2920/issues

Požadavky ke zkoušce:

odevzdání protokolu z laboratorních cvičení,

v rozsahu sylabu (dále doporučená literatura) bude posluchač skládat písemnou zkoušku a poté bude dotazován ústně.

Report from laboratory praxis delivered before exam.

Student will consist within syllabus of a written part and then listener will be interviewed orally.

1. Vymezení předmětu mikrobiologie v ochraně životního prostředí. Mikrobiologické názvosloví a taxonomie, rozdělení mikroorganismů a jejich specifikace.

2. Základní struktura mikrobiálních buněk (bakterie, kvasinky, plísně, prvoci, řasy a viry) a jejich chemické složení.

3. Mikrobiální metabolismus - základní rysy (rozklad sacharidů, lipidů a dusíkatých látek). Katabolické a anabolické procesy.

4. Vliv vnitřních a vnějších faktorů na růst a vlastnosti mikroorganismů.

5. Výživa mikroorganismů. Růstová křivka (růst v baňkách a v prostředí, fáze růstu a růstové konstanty, kontinuální kultivace).

6. Principy kultivačního stanovení mikroorganismů. Způsob odběru, úchovy a přípravy vzorku k rozboru.

7. Výskyt a význam mikroorganismů v životním prostředí a způsob stanovení (horninové prostředí, voda, ovzduší).

8. Požadavky na mikrobiologickou laboratoř. Zásady práce v mikrobiologické laboratoři.

9. Laboratorní práce - Bezpečnost práce v mikrobiologické laboratoři. Příprava sterilních pomůcek, příprava a sterilizace ředících roztoků, kultivačních a diagnostických medií.

10. Laboratorní práce - Kontrola sanitace prostředí laboratoře a hygienických opatření.

11. Laboratorní práce - Stanovení celkového počtu bakterií, kvasinek a plísní ve vzorku horninového prostředí.

12. Laboratorní práce - Stanovení celkového počtu kultivovatelných a indikátorových mikroorganismů ve vzorku vody.

13. Laboratorní práce - Izolační techniky mikroorganismů. Světelná mikroskopie nativních a barvených preparátů bakterií.

14. Laboratorní práce - Sledování vlivu vnějších faktorů na růst mikroorganismů.

1. Specification of the subject Microbiology in environment, basic microbiological terms, microbiological taxonomy.

2. Basic structure of microbial cells and their chemical content.

3. Metabolical processes in microorganism.

4. Influence of internal and external factors on growth and characteristics of microorganisms.

5. Nutrition of microorganisms. Growth curve.

6. Principles of both detection and enumeration of microorganisms by cultivation techniques. Sampling and sample storage.

7. Occurence and significance of microorganisms in environment and their detection.

8. Requirements on microbiological laboratory. General instructions for microbiological handling.

9. Laboratory experiments. Safe handling in microbiological laboratory. Preparation of sterile materials.

10. Laboratory experiments. Control of hygiene and laboratory sanitation.

11. Laboratory experiments. Enumeration of bacteria, yeasts and moulds in soil.

12. Laboratory experiments. Enumeration of both culturable and indicator microorganisms in water sample.

13. Laboratory experiments. Isolation techniques. Sample preparation for light microscopy.

14. Laboratory experiments. Testing the effect of external factors on the growth of microorganisms.

Základy biologie

Introduction to biology.