|
|
|
||
Poslední úprava: Hladíková Jana (04.01.2018)
|
|
||
Poslední úprava: Hladíková Jana (04.01.2018)
Přínos pro studenty:
|
|
||
Poslední úprava: Svozil Daniel prof. Mgr. Ph.D. (29.10.2018)
Z: I. Nezbeda, J. Kolafa, M. Kotrla, Úvod do molekulárních simulací – Metody Monte Carlo a molekulární dynamiky, Univerzita Karlova, Praha 2002 Z: T. Schlick, Molecular Modeling and Simulation, Springer 2010 D: D. Frenkel, B. Smit, Understanding Molecular Simulation, Academic Press 2002 D: J. Šponer, F. Lankaš (eds.), Computational Studies of RNA and DNA, Springer 2006 |
|
||
Poslední úprava: Lankaš Filip doc. Ing. Ph.D. (16.02.2018)
Online materiály k přednášce. |
|
||
Poslední úprava: Lankaš Filip doc. Ing. Ph.D. (16.02.2018)
Vypracování domácích cvičení. |
|
||
Poslední úprava: Lankaš Filip doc. Ing. Ph.D. (26.10.2018)
1. Úvod. Délkové a časové škály v biomolekulárním modelování 2. Pravděpodobnost 3. Náhodné veličiny 4. Charakteristiky náhodných veličin 5. Rozdělení pravděpodobnosti 6. Normální rozdělení 7. Náhodné procesy 8. Langevinova rovnice 9. Brownův pohyb 10. Simulace brownovské dynamiky 11. Aplikace I: Difuzně řízená vazba ligandu na protein 12. Aplikace II: Dynamika nukleosomu a chromatinového vlákna 13. Aplikace III: Pohyb a interakce biomolekul v buňce 14. Aplikace IV: Brownovské simulace nanostruktur DNA a RNA |
|
||
Poslední úprava: Lankaš Filip doc. Ing. Ph.D. (16.02.2018)
Základní kursy matematiky, fysikální chemie, biochemie a molekulového modelování. |
|
||
Poslední úprava: Lankaš Filip doc. Ing. Ph.D. (16.02.2018)
Podmínkou zápočtu je aktivní účast na přednáškách a cvičeních. Zkouška je ústní. |
Zátěž studenta | ||||
Činnost | Kredity | Hodiny | ||
Účast na přednáškách | 1 | 28 | ||
Příprava na přednášky, semináře, laboratoře, exkurzi nebo praxi | 0.5 | 14 | ||
Příprava na zkoušku a její absolvování | 2 | 56 | ||
Účast na seminářích | 0.5 | 14 | ||
4 / 4 | 112 / 112 |