Předmět rozšiřuje základní znalosti o biochemii mikroorganismů se zaměřením na organizaci buněčného metabolismu a regulační mechanismy.Součástí je poznání regulace buněčného cyklu jak prokaryotních tak eukaryotních mikroorganismů, biochemické principy života extremofilních mikroorganismů. Dále se studenti seznámí s determinanty virulence patogenů, syntézou antimikrobiálních peptidů a antibiotik(sekundární metabolity). Jsou vysvětleny principy regulace quorum-sensing a tvorba mikrobiálního biofilmu.
Poslední úprava: Hladíková Jana (13.12.2017)
The subject widens the basic knowledge of biochemistry of microorganisms targeted on the organization of cell metabolism and their regulatory mechanisms. Cell cycle regulation of prokaryotes and eukaryotes is part of this. Biochemical principles of extremophilic microorganisms are included.Next topics are determinants of pathogens virulence, synthesis of antimicrobials peptides and antibiotics (secondary metabolites). The quorum-sensing regulation and the formation of bacterial biofilm are explained.
Výstupy studia předmětu -
Poslední úprava: Stiborová Hana doc. Ing. Ph.D. (06.02.2018)
Student/ka se po absolvování předmětu bude orientovat v těchto oblastech:
typy metabolismu různých skupin mikroorganismů
regulace procesů jako je sporogeneze, buněčný cyklus, sekrece nízko a vysokomolekulárních látek
působení antimikrobiálních látek
mechanismy ovlivňující patogenitu mikroorganismů
quorum sensing a tvorba biofilmů
odpovědi mikroorganismů na různé typy stresů (heat-shock, oxidativní stres), VBNC stav buňky
adaptace mikroorganismů na extrémní podmínky.
Poslední úprava: Stiborová Hana doc. Ing. Ph.D. (06.02.2018)
Student will gain the knowledge in these fields:
metabolism of different groups of microorganisms
regulation of processes as sporogenesis, cell cycle, secretion and transport of low and high molecular matters from the cells
mechanisms of action of antimicrobials agents
mechanisms effecting the microbial pathogenicity
responses of microorganisms to various types of stress (heat-shock, oxidative stress), VBNC cells
adaptation of microorganisms to extreme conditions.
Literatura -
Poslední úprava: Stiborová Hana doc. Ing. Ph.D. (09.02.2018)
Brock Biology of Microorganisms (15th Edition), Michael T. Madigan, Kelly S. Bender , Daniel H. Buckley, W. Matthew Sattley, David A. Stahl, (2018), ISBN-13: 978-0321649638
Microbial Biochemistry (4th Edition), Georges N. Cohen, (ed. 2016), ISBN-10: 940177577X
Bacterial Physiology and Metabolism, Byung Hong Kim, Geoffrey Michael Gadd, Cambridge University Press; 1 edition (March 3, 2008), ISBN-10: 0521712300
Poslední úprava: Stiborová Hana doc. Ing. Ph.D. (09.02.2018)
Brock Biology of Microorganisms (15th Edition), Michael T. Madigan, Kelly S. Bender , Daniel H. Buckley, W. Matthew Sattley, David A. Stahl, (2018), ISBN-13: 978-0321649638
Microbial Biochemistry (4th Edition), Georges N. Cohen, (ed. 2016), ISBN-10: 940177577X
Bacterial Physiology and Metabolism, Byung Hong Kim, Geoffrey Michael Gadd, Cambridge University Press; 1 edition (2008), ISBN-10: 0521712300
Studijní opory -
Poslední úprava: Hladíková Jana (13.12.2017)
žádné
Poslední úprava: Hladíková Jana (13.12.2017)
none
Sylabus -
Poslední úprava: Kubová Petra Ing. (14.12.2018)
1. Úvod. Organizace buněčného metabolismu.
2. Replikace DNA, opravy, regulace transkripce a translace.
3. Životní a buněčný cyklus prokaryontních a eukaryontních mikroorganismů, cytoskeleton.
10. Sekreční systémy prokaryotních a eukaryotních mikroorganismů.
11. Mechanismy transportu látek u mikroorganismů.
12. Životní cykly mikroorganismů: biochemie, regulace a komunikace "quorum sensing".
13. Oxidativní stres u mikroorganismů.
14. Využití mikrobiálních enzymů v biotechnologiích.
Poslední úprava: Kubová Petra Ing. (14.12.2018)
1. Introduction. Cell metabolism organization.
2. DNA replication and repair, transcription and regulation, translation
3. Life and cell cyclus of prokaryotic and eukaryotic microorganisms, cytoskeleton.
4. Bioenergetics of microorganisms.
5. Biochemistry and adaptation mechanisms of extremophiles.
6. Synthesis of essentials amino acids.
7. Synthesis of secondary metabolites, antibiotic`s mechanism of action.
8. Inhibitory factors produced by microorganisms - antibiotics, colicines, killer factors.
9. Factors determining microorganisms patogenity.
10. Secretion system of prokaryotic and eukaryotic microorganisms.
11. Transport mechanisms in microorganisms.
12. Life cycles of microorganisms: biochemistry, regulation, and communication „Quorum sensing“.
13. Oxidative stress of microorganisms.
14. Microbial enzymes in biotechnology.
Studijní prerekvizity -
Poslední úprava: Hladíková Jana (13.12.2017)
Biochemie, Mikrobiologie
Poslední úprava: Hladíková Jana (13.12.2017)
Biochemistry, Mikrobiology
Podmínky zakončení předmětu -
Poslední úprava: Stiborová Hana doc. Ing. Ph.D. (06.02.2018)
K písemné a ústní zkoušce může přistoupit student/ka, který obhájil/a individuální projekt na předem vybrané téma formou ústní prezentace. Úspěšné zakončení předmětu spočívá v napsání zkouškové písemky minimálně na 50 bodů ze 100 a složení ústní zkoušky v hodnocení A-E.
Poslední úprava: Stiborová Hana doc. Ing. Ph.D. (29.01.2018)
gggg
Poslední úprava: Stiborová Hana doc. Ing. Ph.D. (06.02.2018)
Only the student, who previously presented and defended the individual project on selected topic, can write final exam test and pass the oral exam. The successful completion of the course consists of the written test (min. 50 points out of 100) and oral examination in A-E grade.