PředmětyPředměty(verze: 863)
Předmět, akademický rok 2019/2020
  
Moderní metody molekulového modelování - M403066
Anglický název: Modern methods of molecular modelling
Zajišťuje: Centrum počítačového vzdělávání VŠCHT Praha (599)
Platnost: od 2019
Semestr: zimní
Body: zimní s.:2
E-Kredity: zimní s.:2
Způsob provedení zkoušky: zimní s.:
Rozsah, examinace: zimní s.:0/15 Z [hodiny/semestr]
Počet míst: neurčen / 20 (neurčen)
Minimální obsazenost: neomezen
Jazyk výuky: čeština
Způsob výuky: prezenční
Úroveň:  
Pro druh: navazující magisterské
Poznámka: předmět je možno zapsat mimo plán
povolen pro zápis po webu
Garant: Slavíček Petr prof. RNDr. Ph.D.
Muchova Eva RNDr. Ph.D.
Sršeň Štěpán Ing.
Anotace
Poslední úprava: Slavíček Petr prof. RNDr. Ph.D. (05.09.2019)
Kurz bude zaměřen na moderní metody molekulového modelování, mezi jiným i na numericky nákladné molekulové modelování, pro které je výhodné použití masivní paralelizace umožněné grafickými jednotkami GPU. Kurz bude vyučován formou praktických cvičení.
Sylabus
Poslední úprava: Slavíček Petr prof. RNDr. Ph.D. (05.09.2019)

Úvod do molekulového modelování

Molekulové simulace v základním stavu

  • molekulová dynamika
  • ab initio molekulová dynamika pomocí dráhových integrálů
  • nukleární kvantové efekty
  • metody metadynamiky, analýza trajektorií)

Molekulové simulace v excitovaném stavu

  • kvantově chemické metody pro popis elektronově excitovaných stavů
  • semiempirické metody
  • neadiabatická dynamika pomocí
  • výpočty spin-orbitální vazby

Spektroskopie a molekulové vlastnosti

  • výpočty elektronových spekter
  • výpočty vibračních spekter a jejich analýza, výpočty molekulových vlastností ze spekter
  • výpočty ionizovaných stavů, metody pro popis solvatace
  • vlastnosti solvatovaných molekul
  • vizualizace molekulových vlastností

 
VŠCHT Praha