Students will be able to:

understand the basics of DNA and RNA work

isolate DNA from common sources

understand the basics of nucleic acid analysis by restriction cleavage (RFLP)

understand the basics of quantification of DNA using real-time PCR

understand the basics of human identification using VNTR and STR polymorphism

understand the basics of DNA sequencing and fragment analysis

Studenti budou umět:

základy práce s DNA a RNA

izolace DNA z běžných zdrojů

základy analýzy nukleových kyselin restrikčním štěpením (RFLP)

základy kvantifikace DNA pomocí real-time PCR

základy technik identifikace osob s využitím polymorfismů VNTR a STR

základy sekvenování DNA a fragmentační analýzy

A: Butler J.M., Fundamentals of Forensic DNA Typing, Elsevier Publishing 2009, 978-0123749994

D: Butler J.M., Fundamentals of Forensic DNA Typing, Elsevier Publishing 2009, 978-0123749994

1. Introduction, safety in molecular biology laboratory

2. Basics of work with biological material, namely DNA

3. Isolation of DNA from buccal swab, quality and quantity assessment

4. Polymerase chain reaction (PCR) - amplification of tandem repeats (locus D1S80)

5. Electrophoretic separation of amplicons

6. Determination of number of repeats (locus D1S80) and random match probability (RMP)

7. Amplification of mitochondrial DNA (mtDNA) using PCR

8. RFLP analysis of mtDNA - cleavage of DNA by restriction endonucleases

9. Electrophoretic separation and analysis of rectriction fragments

10. Nucleic acid quantification using quantitative PCR (qPCR)

11. Multiplex PCR of short tandem repeats (STR)

12. Fragment analysis of amplicons using capillary electrophoresis

13. Evaluation of STR profiles, determination of RMP, analysis of mixed profiles

14. Basics of paternity evaluation based on STR

1. Úvod, bezpečnost práce v molekulárně biologické laboratoři

2. Zásady práce s biologickým materiálem, zejména s DNA

3. Izolace vlastní DNA z bukálního stěru, posouzení kvality a kvantity

4. Polymerasová řetězová reakce (PCR) - amplifikace tandemových repetic (lokus D1S80)

5. Elektroforetická separace amplikonů

6. Určení počtu repetic (lokus D1S80) a pravděpodobnosti náhodné shody (RMP)

7. Amplifikace mitochondriální DNA (mtDNA) pomocí PCR

8. RFLP analýza mtDNA - štěpení DNA restrikčními endonukleasami

9. Elektroforetická separace a analýza restrikčních fragmentů

10. Kvantifikace nukleových kyselin pomocí kvantitativní PCR (qPCR)

11. Multiplexní amplifikace (multiplex PCR) krátkých tandemových repetic (STR)

12. Fragmentační analýza amplikonů pomocí kapilární elektroforesy

13. Vyhodnocení STR profilů, určení RMP, analýza směsných profilů

14. Základy určování paternity na základě STR

none

Lipov Jan, Knejzlík Zdeněk, Jablonská Eva. Laboratoř analýzy biologických materiálů. VŠCHT Praha, 2017.

ISBN 978-80-7080-992-1

https://vydavatelstvi.vscht.cz/katalog/publikace?isid=978-80-7080-992-1

none

nejsou