Students will be able to:

• distinguish between the members of normal and pathogenic human microbiome,

• characterize the most important pathogens causing bacterial, fungal, viral and parasitic diseases,

• evaluate the importance of selected microorganisms from the clinical microbiology point of view, together with their pathogenicity and pathogenesis of caused diseases

• discuss the mechanisms of antimicrobial agents actions and microbial-caused diseases prevention.

Studenti budou umět:

• rozlišovat mezi zástupci přirozené mikroflóry člověka (mikrobiomu) a podmíněně patogenními či patogenními mikroorganismy,

• charakterizovat všechny nejvýznamnější původce bakteriálních, kvasinkových, virových i parazitických onemocnění,

• posoudit význam jednotlivých mikroorganismů z hlediska klinické mikrobiologie, spolu s jejich patogenitou a patogenezí některých vybraných onemocnění,

• mechanismy působení antimikrobiálních látek, ale i mechanismy uplatňující se v prevenci mikrobiálních onemocnění.

R: M. Votava a kol., Lékařská mikrobiologie speciální, Neptun, Brno, 2003, 80-902896-6-5

R: Z: L. Hamplová a kol., Mikrobiologie, imunologie, epidemiologie, hygiena, Triton, Praha 2015, 978-80-7387-934-1

A: M. Votava, Lékařská mikrobiologie obecná, Neptun, Brno, 2005, 80-86850-00-5

A: M. Votava a kol., Lékařská mikrobiologie vyšetřovací metody, Neptun, Brno, 2010, 978-80-86850-04-8

http://textbookofbacteriology.net/

Z: M. Votava a kol., Lékařská mikrobiologie speciální, Neptun, Brno, 2003, 80-902896-6-5

Z: L. Hamplová a kol., Mikrobiologie, imunologie, epidemiologie, hygiena, Triton, Praha 2015, 978-80-7387-934-1

D: M. Votava, Lékařská mikrobiologie obecná, Neptun, Brno, 2005, 80-86850-00-5

D: M. Votava a kol., Lékařská mikrobiologie vyšetřovací metody, Neptun, Brno, 2010, 978-80-86850-04-8

http://textbookofbacteriology.net/

http://www.szu.cz/

http://microbewiki.kenyon.edu/index.php/MicrobeWiki

http://biomikro.vscht.cz/cz/

http://textbookofbacteriology.net/

http://www.szu.cz/

http://microbewiki.kenyon.edu/index.php/MicrobeWiki

http://biomikro.vscht.cz/cz/

http://textbookofbacteriology.net/

1.History and importance of medical microbiology. Basic concepts associated with clinical microbiology. Cultivation media. Physiological flora (microbiome), pathogenic and facultatively pathogenic microorganisms - a general overview.

2. Pathogenicity and virulence of bacteria. Routes of infection in the body, the adhesion of bacteria, tropism. Types of infections and their spread, the incubation period. Toxins, their distribution and function.

3. Antibiotics, classification, mechanisms of action, the emergence of resistance. Multiresistance. Spirochetes (Treponema, Leptospira, Borrelia).

4. Clinically significant Gram-positive cocci (Micrococcus, Staphylococcus, Streptococcus, Enterococcus), Gram-negative cocci and coccobacilli - Neisseria, etc. Gram-positive non-spore forming and sporulating aerobic rods (Listeria, Bacillus).

5. Anaerobic bacteria (important representatives of G+ and G- bacilli and cocci). Non Gram-staining bacteria (Mycobacterium, Nocardia). Mollicutes - representatives and diseases. Chlamydia - representatives and diseases.

6. Non spore-forming aerobic bacteria (Corynebacterium, Arcanobacter, Rhodococcus, Rothia). Gram-positive aerobic spore-forming rods - Clostridium. Aerobic gram-negative rods (Pseudomonas, Legionella, Chryseobacterium, Alcaligenes, Brucella, Francisella, Bordetella).

7. Facultative anaerobic gram-negative rods (Enterobacteriaceae). Gram-negative aerobic to microaerophilic rods (Helicobacter, Campylobacter). Rickettsia (Rickettsia, Coxiella, Ehrlichia, Rochalimaea, Bartonella).

8. Fungi - classification, epidemiology and diseases caused by fungi. Surface, subcutaneous and systemic mycoses.

9. General parasitology, protozoa. Parasitic annelids and arthropods.

10. Viruses - definition, history. Main groups of viruses, classification of viruses. Viral infection. Bacteriophages.

11. Selected representatives of animal DNA viruses (Poxviridae, Herpesviridae, Adenoviridae, Papillomaviridae, Polyomaviridae, Hepadnaviridae, Parvoviridae).

12. The most important representatives of RNA viruses (Orthomyxoviridae, Paramyxoviridae, Picornaviridae, Caliciviridae and Astroviridae, Reoviridae, Coronaviridae, Bunyaviridae, Togaviridae, Arenaviridae, Rhabdoviridae, Filoviridae, Retroviridae).

13. Causative agents of viral hepatitis. Prions and prion diseases.

14. Vaccination, vaccines, principles. Mandatory and recommended vaccinations.

1. Historický vývoj a význam lékařské mikrobiologie. Základní pojmy spojené s klinickou mikrobiologií. Kultivační půdy. Fysiologická flora (mikrobiom), patogenní a podmíněně patogenní mikroorganismy člověka - obecný přehled.

2. Patogenita a virulence bakterií. Cesty infekce do těla, adhese bakterií, tropismus. Typy infekcí a jejich šíření, inkubační doba. Toxiny, jejich rozdělení a funkce.

3. Antibiotika, dělení, mechanismy působení, vznik resistence. Multiresistence. Spirochety (Treponema, Leptospira, Borrelia).

4. Klinicky významné grampozitivní koky (Micrococcus, Staphylococcus, Streptococcus, Enterococcus), gramnegativní koky a kokobacily - Neisseria a další. Grampozitivní nesporulující a sporulující aerobní tyčky (Listeria, Bacillus).

5. Nesporulující anaerobní bakterie (významní zástupci G+ i G- tyček a koků). Tyčinky špatně barvitelné podle Grama (Mycobacterium, Nocardia). Mollicutes - zástupci, onemocnění. Chlamydie - zástupci, onemocnění.

6. Nepravidelné nesporulující aerobní bakterie (Corynebacterium, Arcanobacter, Rhodococcus, Rothia). Grampozitivní sporulující aerobní tyčky - Clostridium. Gramnegativní aerobní tyčky (Pseudomonas, Legionella, Chryseobacterium, Alcaligenes, Brucella, Francisella, Bordetella).

7. Gramnegativní fakultativně anaerobní tyčky (čeleď Enterobacteriaceae). Gramnegativní aerobní až mikroaerofilní tyčky (Helicobacter, Campylobacter). Rickettsie (Rickettsia, Coxiella, Ehrlichia, Rochalimaea, Bartonella).

8. Fungi - dělení, epidemiologie, chorobné stavy vyvolané houbami. Povrchové, subkutánní a systémové mykózy.

9. Obecná parazitologie, protozoa. Parazitičtí kroužkovci a členovci.

10. Viry - definice, historie. Hlavní skupiny virů, klasifikace virů. Virové infekce. Bakteriofágy.

11. Zástupci živočišných DNA virů (Poxviridae, Herpesviridae, Adenoviridae, Papillomaviridae, Polyomaviridae, Hepadnaviridae, Parvoviridae).

12. Nejdůležitější zástupci RNA virů (Orthomyxoviridae, Paramyxoviridae, Picornaviridae, Caliciviridae a Astroviridae, Reoviridae, Coronaviridae, Bunyaviridae, Togaviridae, Arenaviridae, Rhabdoviridae, Filoviridae, Retroviridae).

13. Vyvolavatelé virových hepatitid. Priony a prionová onemocnění.

14. Očkování, očkovací látky. Povinná a doporučená očkování.

Microbiology, Biochemistry, Biology

Mikrobiologie, Biochemie, Biologie

written and oral part of exam

písemná i ústní část zkoušky