Evaluation is based on a presentation on a current topic in the field of bioorganic chemistry of natural compounds. Passing the written examination with a minimum score of 60% is required.

Hodnocená prezentace aktuálního tématu z oblasti bioorganické chemie přírodních látek. Úspěšné absolvování písemné zkoušky s výsledkem nejméně 60 %.

Recommended:

• Sidney M. Hecht. Bioorganic Chemistry: Carbohydrates. : Oxford University Press, 1999, s. ISBN 9780195084696.
• Sidney M. Hecht. Bioorganic Chemistry: Nucleic Acids. : Oxford University Press, 1996, s. ISBN 9780195084672.
• Gabius, Hans-Joachim. The sugar code, fundamentals of glycosciences. Chichester, Weinheim: Wiley , 2009, s. ISBN 978-3-527-32089-9.
• B. Ernst, G. W. Hart, P. Sinay. Carbohydrates in Chemistry and Biology. Verlag, Weinheim.: Wiley, 2000, s. ISBN 9783527295111.

Doporučená:

• Sidney M. Hecht. Bioorganic Chemistry: Carbohydrates. : Oxford University Press, 1999, s. ISBN 9780195084696.
• Sidney M. Hecht. Bioorganic Chemistry: Nucleic Acids. : Oxford University Press, 1996, s. ISBN 9780195084672.
• Gabius, Hans-Joachim. The sugar code, fundamentals of glycosciences. Chichester, Weinheim: Wiley ;, Wiley [distributor], 2009, s. ISBN 978-3-527-32089-9.
• B. Ernst, G. W. Hart, P. Sinay. Carbohydrates in Chemistry and Biology. Weinheim: Wiley -VCH Verlag, 2000, s. ISBN 9783527295111.

Přednášky vyučujících, prezentace studentů na jimi zvolené a zpracované téma zahrnující samostudium.

Block I: Fundamentals and Principles

The introductory part of the course presents bioorganic chemistry of natural compounds as a modern discipline at the intersection of organic chemistry, biochemistry, and biology. Students will become familiar with the major classes of biomolecules, their structure and function, as well as with the chemical and enzymatic principles of their synthesis and biosynthesis.

Block II: Isolation and Analysis

The second part focuses on how natural compounds can be obtained from various sources and how they can be further purified and characterized. Students will learn the basic approaches to isolation and modern analytical methods that enable the determination of the structure and properties of natural compounds and their interactions with biological macromolecules.

Block III: Applications and Contexts

The final part demonstrates how knowledge from bioorganic chemistry is applied in practice. Topics include the use of enzymes in synthesis (biocatalysis), chemical biology and synthetic biology, as well as the importance of natural compounds and their derivatives as drugs and bioactive molecules. Current trends and future perspectives of the field are also discussed.

Blok I: Základy a principy

Úvodní část kurzu představí bioorganickou chemii přírodních látek jako moderní obor na pomezí organické chemie, biochemie a biologie. Studenti se seznámí se základními třídami biomolekul, jejich strukturou a funkcí a také s chemickými i enzymatickými principy jejich syntézy a biosyntézy.

Blok II: Izolace a analýza

Druhá část se zaměří na to, jak lze přírodní látky získávat z různých zdrojů a jak je možné je dále čistit a charakterizovat. Studenti poznají základní postupy izolace a moderní analytické metody, které umožňují určit strukturu a vlastnosti přírodních látek i jejich interakce s biologickými makromolekulami.

Blok III: Aplikace a souvislosti

Závěrečná část ukazuje, jak se poznatky z bioorganické chemie uplatňují v praxi. Probírá se využití enzymů v syntéze (biokatalýza), chemická biologie a syntetická biologie, stejně jako význam přírodních látek a jejich derivátů jako léčiv a bioaktivních molekul. Diskutovány jsou i současné trendy a výhledy oboru.

Copies of all presentation available from the lecturer.

Studijní materiály k přednáškám u vyučujícího. (kopie všech prezentací)

Students will be able to:

understand the structure and function of saccharides and nucleic acid

chemical and enzymatic synthesis of oligosaccharides, oligonucleosides and their analogs

understand molecular principles and reaction mechanism of biological and biochemical processes

Studenti budou umět:

rozumět struktuře a funkci sacharidů a nukleových kyselin

chemické a enzymatické syntézy oligosacharidů, oligonukleotidů a jejich analogů

molekulární principy a reakční mechanismy biologických a biochemických procesů