Poslední úprava: Lipovová Petra doc. Ing. Ph.D. (02.11.2018)
Cílem tohoto předmětu je prohloubení znalostí principů jednotlivých biochemických technik, ať už klasických či nových. Část výuky bude věnována procvičení, ucelení a rozšíření znalostí metod získaných v rámci dosavadního studia. V další části výuky se studenti navzájem seznámí se speciálními technikami, které používají v laboratořích v rámci své disertační práce a také vypracují referát o nejnovějších technikách, kdy budou čerpat z renomovaných časopisů jako je Nature Protocols, Analytical Biochemistry: Methods in the Biological Sciences atd. Obecně je předmět koncipován tak, aby studenti jeho absolvováním získali jak klíčové teoretické znalosti oboru, tak přehled o současných metodikách používaných v biochemickém a molekulárně-biologickém výzkumu.
Poslední úprava: Lipovová Petra doc. Ing. Ph.D. (06.11.2018)
The aim of this course is to deepen the knowledge of the principles of particular biochemical techniques, whether classical or new. Part of this course will be devoted to the extension of knowledge gained in previous studies. In the second part of the course the students will present the latest techniques published in a renowned magazines. In general, the course is designed so that the graduates acquire both the key theoretical knowledge in the field and an overview of the current methodologies used in the biochemical and molecular-biological research.
Výstupy studia předmětu -
Poslední úprava: Lipovová Petra doc. Ing. Ph.D. (04.05.2022)
Během předchozího magisterského studia se studenti setkali s teoretickými základy jednotlivých biochemických metod.V rámci tohoto předmětu dojde k rozšíření jejich dosavadních znalostí o nejnovějších přístupech a moderních metodikách používaných v laboratorní praxi. Studenti po absolvování předmětu si osvojí teoretické i přímo prakticky aplikovatelné znalosti a dovednosti v oblasti moderních biochemických metod. Přínosem bude i posílení prezentačních dovedností, kdy studenti v rámci předmětu připraví krátké sdělení týkající se nových technik, které používají v laboratořích v rámci své disertační práce.
První blok přednášek se bude věnovat klasickým metodám, jako je práce s biologickým materiálem (uskladnění, homogenizace, extrakce, příprava vzorku pro hmotnostní spektrometrii), elektroforetické metody, chromatografické metody, membránové procesy, centrifugace, PCR metody, sekvenace, metody analýzy proteinových interakcí, atd. - v závislosti na stavu znalostí přihlášených studentů (přednášky a diskuse).
Další blok bude věnován nejnovějším metodám, kde studenti zpracují do krátké prezentace vybranou metodu publikovanou v renomovaném časopise a přednesou ji ostatním účastníkům kursu.
Poslední úprava: Lipovová Petra doc. Ing. Ph.D. (04.05.2022)
During the previous master's study students met with theoretical foundations of biochemical methods. Within this subject, their knowledge about the latest approaches and modern methodologies used in laboratory practice will be extended. Students will acquire theoretical and directly practical knowledge and skills in modern biochemical methods. It will also benefit from the enhancement of presentation skills, in which students will prepare a brief briefing on the new techniques they use in the laboratories as part of their dissertation work.
The first block of lectures will focus on classical methods - work with biological material (storage, homogenization, extraction, sample preparation for mass spectrometry), electrophoretic methods, chromatographic methods, membrane processes, centrifugation, PCR methods, methods of protein interaction analysis - depending on the students' knowledge (lectures and discussions).
The second block will be devoted to the recent techniques, students will present a short presentation of a selected method published in a renowned magazines to other participants of the course.
Literatura -
Poslední úprava: Lipovová Petra doc. Ing. Ph.D. (09.07.2018)
Boyer, Rodney F: Biochemistry laboratory: modern theory and techniques, Pearson, New Jersey, 2012 ISBN-13:978-0-13-604302-7
Janson JC: Protein Purification: Principles, High Resolution Methods, and Applications, Third Edition, John Wiley & Sons, Inc., New Jersey 2011 ISBN:9780471746614
Mikkelsen S.R.: Bioanalytical Chemistry, Wiley, New Jersey, 2016, ISBN 978-1-118-30254-5
Poslední úprava: Lipovová Petra doc. Ing. Ph.D. (09.07.2018)
Boyer, Rodney F: Biochemistry laboratory: modern theory and techniques, Pearson, New Jersey, 2012 ISBN-13:978-0-13-604302-7
Janson JC: Protein Purification: Principles, High Resolution Methods, and Applications, Third Edition, John Wiley & Sons, Inc., New Jersey 2011 ISBN:9780471746614
Mikkelsen S.R.: Bioanalytical Chemistry, Wiley, New Jersey, 2016, ISBN 978-1-118-30254-5
Sylabus -
Poslední úprava: Lipovová Petra doc. Ing. Ph.D. (04.05.2022)
První blok přednášek se bude věnovat klasickým metodám, jako je práce s biologickým materiálem (uskladnění, homogenizace, extrakce, příprava vzorku pro hmotnostní spektrometrii), elektroforetické metody, chromatografické metody, membránové procesy, centrifugace, PCR metody, sekvenace, metody analýzy proteinových interakcí, atd. - v závislosti na stavu znalostí přihlášených studentů (přednášky a diskuse).
Další blok bude věnován nejnovějším metodám, kde studenti zpracují do krátké prezentace vybranou metodu publikovanou v renomovaném časopise a přednesou ji ostatním účastníkům kursu.
Poslední úprava: Lipovová Petra doc. Ing. Ph.D. (04.05.2022)
1. Source of proteins, dezintegration, membrane process
2. Precipitation, extraction, and centrifugation
3. Basic classification and instrumentation, materials for electrophoretic and chromatographic methods
4. Gel permeation chromatography, ion exchange chromatography, hydrophobic chromatography and reverse phase chromatography.
5. Affinity chromatography
6. Recombinant proteins, production and troubleshooting
7. Thin layer chromatography, monitoring of chromatography and determination of protein concentration
8. Introduction to electrophoretic methods
9. Types of electrophoretic methods
10. General principles and division of immunochemical methods
11. Immunoaffinity separation of molecules
12. Presentation of a selected method published in a scientific journal
13. Presentation of a selected method published in a scientific journal
14. Presentation of a selected method published in a scientific journal
Vstupní požadavky -
Poslední úprava: Lipovová Petra doc. Ing. Ph.D. (22.06.2018)
Nejsou
Poslední úprava: Lipovová Petra doc. Ing. Ph.D. (09.07.2018)
non
Studijní prerekvizity -
Poslední úprava: Lipovová Petra doc. Ing. Ph.D. (22.06.2018)
Nejsou
Poslední úprava: Lipovová Petra doc. Ing. Ph.D. (09.07.2018)
Non.
Podmínky zakončení předmětu -
Poslední úprava: Lipovová Petra doc. Ing. Ph.D. (09.09.2020)
Předmět bude vyučován od letního semestru 2020/2021.
Prezentace přehledného článku z oblasti biochemických metod.
Předmět je zakončen ústní zkouškou.
Poslední úprava: Lipovová Petra doc. Ing. Ph.D. (09.07.2018)
Presentation of a review paper form the field of biochemical methods.