Poslední úprava: Setnička Vladimír prof. Ing. Ph.D. (13.08.2018)
Jsou vysvětleny teoretické základy chiroptických metod, je podán přehled dostupné instrumentace a metodologie měření spekter cirkulárního dichroismu. Jsou popsány varianty chiroptických metod a diskutovány jejich výhody a omezení. Hlavní pozornost je věnována spektroskopii elektronového a vibračního dichroismu a aplikacím ve strukturní analýze chirálních látek, při studiu biologicky významných interakcí a chirálního rozpoznávání.
Poslední úprava: Urbanová Marie prof. RNDr. CSc. (01.09.2018)
The course covers the basics of chiroptical methods, up-to date instrumentation and methodology of circular dichroism measurements. Variants of chiroptical methods are described together with their advantages, disadvantages and limits. The course is focused on electronic and vibrational circular dichroism and Raman optical activity and their application in structural analysis of chiral molecular systems, in biologically important interactions and chiral recognition.
Výstupy studia předmětu -
Poslední úprava: Urbanová Marie prof. RNDr. CSc. (10.07.2018)
Studenti získají:
• teoretické základy chiroptických spektroskopií
• přehled o instrumentaci jednotlivých chiroptických metod
• znalosti o metodologii měření
• znalosti o aplikaci chiroptických metod zejména v konformační analýze malých molekul a biomolekul
• znalosti p využítí chiroptických metod při studiu biointerakcí a supramolekulárních systémů
• studenti se účastní demonstračního měření spekter vibračního a elektronového cirkulárního dichroismu
Poslední úprava: Urbanová Marie prof. RNDr. CSc. (01.09.2018)
Students obtain:
• theoretical basics of chiroptical spectroscopy
• knowledge of instrumentation of the variants of chiroptical methods
• knowledge of the measurement methodology
• application of chiroptical method in conformational analysis of small molecules and biomolecules
• application of chiroptical spectroscopies in biologically important interactions and chiral supramolecular systems
• participation in the demo measurements of electronic and vibrational dichroic spectra
Literatura -
Poslední úprava: Setnička Vladimír prof. Ing. Ph.D. (12.10.2018)
Z: Urbanová M., Maloň P. Circular Dichroism Spectroscopy v Analytical Methods in Supramolecular Chemistry (Schalley C. A., Ed.), Wiley VCH: Weinheim, Germany, Second, Completely Revised and Enlarged Edition, 2012, str. 337-369.ISBN: 978-3-527-32982-3. http://onlinelibrary.wiley.com/book/10.1002/9783527610273
D: Setnička V., Urbanová M. Spektroskopie cirkulárního dichroismu v Moderní přístupy k farmaceutické analýze (Dohnal J., Jampílek J., Král V., Řezáčová A., Eds.), Farmaceutická fakulta Veterinární a farmaceutické univerzity Brno: Brno, 2010, kapitola 4.6.
Poslední úprava: Setnička Vladimír prof. Ing. Ph.D. (12.10.2018)
R: Urbanová M., Maloň P. Circular Dichroism Spectroscopy v Analytical Methods in Supramolecular Chemistry (Schalley C. A., Ed.), Wiley VCH: Weinheim, Germany, Second, Completely Revised and Enlarged Edition, 2012, str. 337-369.ISBN: 978-3-527-32982-3. http://onlinelibrary.wiley.com/book/10.1002/9783527610273
A: Setnička V., Urbanová M. Spektroskopie cirkulárního dichroismu v Moderní přístupy k farmaceutické analýze (Dohnal J., Jampílek J., Král V., Řezáčová A., Eds.), Farmaceutická fakulta Veterinární a farmaceutické univerzity Brno: Brno, 2010, kapitola 4.6.
Studijní opory -
Poslední úprava: Urbanová Marie prof. RNDr. CSc. (10.07.2018)
Analýza chirálních sloučenin (Tesařová E., Ed.), Pražské analytické centrum inovací: Praha, 2007, ISBN: 978-80-86238-23-4.
Poslední úprava: Urbanová Marie prof. RNDr. CSc. (01.09.2018)
Analýza chirálních sloučenin (Tesařová E., Ed.), Pražské analytické centrum inovací: Praha, 2007, ISBN: 978-80-86238-23-4
Metody výuky -
Poslední úprava: Urbanová Marie prof. RNDr. CSc. (03.09.2018)
přednášky
účast na demonstračním měření, praktické ukázky
Poslední úprava: Urbanová Marie prof. RNDr. CSc. (03.09.2018)
lectures
participation in the laboratory demonstration of measurement, practicals
Požadavky ke zkoušce (Forma způsobu ověření studijních výsledků) -
Poslední úprava: Urbanová Marie prof. RNDr. CSc. (09.07.2018)
nejsou
Poslední úprava: Urbanová Marie prof. RNDr. CSc. (01.09.2018)
Sylabus -
Poslední úprava: Setnička Vladimír prof. Ing. Ph.D. (01.09.2018)
1. Molekulární chiralita, polarizace elektromagnetického záření využívaná v chiroptických metodách
3. Interakce cirkulárně polarizovaného záření s hmotou, rotační síla přechodu, vztah mezi pozorovatelnými veličinami a strukturou chirálních molekul
4. Metodika měření cirkulárního dichroismu, funkce fotoelastického modulátoru a dedikovaná zařízení pro měření cirkulárního dichroismu
5. Instrumentace pro elektronový cirkulární dichroismus, praktické poznámky
6. Vibrační cirkulární dichroismus, jeho specifika, instrumentace, správné postupy měření a získání dat
7. Další varianty chiroptických metod 1: optická rotace a optická rotační disperze, fluorescenčně detekovaný cirkulární dichroismus a jeho instrumentace
8. Další varianty chiroptických metod 2: cirkulárně polarizovaná luminiscence, magnetická optická aktivita a jejich instrumentace
9. Ramanova optická aktivita a její instrumentace
10. Zpracování spekter cirkulárního dichroismu, ab initio výpočty chiroptických vlastností
11. Využití cirkulárního dichroismu obecně a při konformační analýze biomolekul
12. Využití cirkulárního dichroismu při studiu biologicky významných interakcí a supramolekulárních systémů
13. Exkurze do laboratoře vibračního cirkulárního dichroismu, účast na demonstračním měření
14. Exkurze do laboratoře elektronového cirkulárního dichroismu, účast na demonstračním měření
Poslední úprava: Setnička Vladimír prof. Ing. Ph.D. (16.09.2018)
1. Molecular chirality, polarization of radiation utilized in chiroptical methods
3. Interaction of circularly polarized radiation with matter, rotational strength of transition, relation between observables and structure of chiral molecules
4. Methodology of circular dichroism measurements, photoelastic modulator and dedicated devices
5. Electronic circular dichroism, instrumentation, how to obtain reliable spectra
6. Vibrational circular dichroism, its particularity, instrumentation, how to obtain reliable spectra and structural data
7. Variants of chiroptical methods 1: optical rotation and optical rotatory dispersion, fluorescence detected circular dichroism and their instrumentation
8. Variants of chiroptical methods 2: varianty chiroptických metod 2: circularly polarized luminescence, magnetic optical activity and their instrumentation
9. Raman optical activity and its instrumentation
10. Processing chiroptical data, ab initio calculations of chiroptical properties
11. Application of circular dichroism generally and in conformational study of biomolecules
12. Application of circular dichroism in study of biologically important interactions and of chiral supramolecular systems
13. Demo experiments in vibrational circular dichroism laboratory
14. Demo experiments in electronic circular dichroism laboratory
Vstupní požadavky -
Poslední úprava: Urbanová Marie prof. RNDr. CSc. (16.08.2018)
Nejsou
Poslední úprava: Urbanová Marie prof. RNDr. CSc. (01.09.2018)
Podmínky zakončení předmětu -
Poslední úprava: Urbanová Marie prof. RNDr. CSc. (03.09.2018)
zkouškový test
účast na demonstračním měření
Poslední úprava: Urbanová Marie prof. RNDr. CSc. (03.09.2018)
written examination test
participation in the laboratory demonstration of measurement