Student se seznámí s moderními poznatky a metodikou v pokročilé mikroskopii biologických objektů, získá přehled o základech použitelných technik, což mu umožní kvalifikované rozhodnutí, kterou z nich zvolit při vědeckovýzkumné činnosti.

Student will be introduced to modern facts and methodology in advanced microscopy of biological objects, she/he will obtain an overview of possible techniques, which allows her/him more qualified decisions in scientific research activities.

Aktivní účast studenta na přednáškách.

Skóre v závěrečném testu nad 50%.

Active presence of the student on the lectures.

More then 50% from the final test.

Vědecké práce a online knihy z portfolia Nature Research, AAAS a dalších.

Scientific papers and online books from the portfolio of Nature Research, AAAS and others.

Přednášky, odborná rozprava, samostudium, exkurse.

Lectures, professional debate, selflearning, excursion.

Fluorescenční mikroskopie jako specifická část optické mikroskopie, kvantifikace fluorescence, používané fluorescenční značky.

Konfokální, multifotonová a korelační mikroskopie.

Aplikace fluorescenční mikrokopie - FRAP (Fluorescence Recovery After Photobleaching), FRET (Förster Resonance Energy Transfer)

Aplikace fluorescenční mikrokopie - TIRF (Total Internal Reflection Fluorescence), SIM (Structured Illumination Microscopy)

Aplikace fluorescenční mikrokopie - PALM (PhotoActivated Localization Microscopy), STORM (Stochastic Optical Reconstruction Microscopy)

Aplikace fluorescenční mikrokopie - STED (Stimulated Emission Depletion microscopy), FLIM (Fluorescence-Lifetime Imaging Microscopy)

Analýza obrazu – úprava parametrů obrazu před snímáním, sofware pro zpracování a analýzu - dekonvoluce, 3D vizualizace, kolokalizace, tracking, korekce chromatických aberací.

Fluorescence microscopy as a specific part of optical microscopy, quantification of fluorescence, fluorescent tags.

Confocal, multiphoton and correlation microscopy.

The application of fluorescence microscopy - FRAP (Fluorescence Recovery After Photobleaching), FRET (Förster Resonance Energy Transfer)

The application of fluorescence microscopy - TIRF (Total Internal Reflection Fluorescence), SIM (Structured Illumination Microscopy)

The application of fluorescence microscopy - PALM (PhotoActivated Localization Microscopy), STORM (Stochastic Optical Reconstruction Microscopy)

The application of fluorescence microscopy - STED (Stimulated Emission Depletion Microscopy), FLIM (Fluorescence-Lifetime Imaging Microscopy).

Image analysis – parameter ajdustment before acquisition, software for image processing and analysis – deconvolution, 3D visualization, colocalization, tracking, correction of chromatic abberations.

Základní znalosti optiky a mikroskopických technik.

Basic knowledge in the field of optics and microscopic techniques.