Mikroskopie umožňuje efektivní a unikátní přístup při studiu fixovaných preparátů i živých buněk s vysokou specifitou a citlivostí. Předmět si klade za cíl seznámit doktorandy s moderními mikroskopickými technikami pro zobrazování biologických objektů. Součástí workshopu bude seznámení s automatizovanou wide-field, konfokální i vysokorozlišovací fluorescenční mikroskopií. Budou objasněny fyzikální mechanismy a následně teoretické a/nebo praktické základy jednotlivých moderních mikroskopických technik. Budou probrány rovněž základy analýzy obrazu.
Poslední úprava: Lipov Jan doc. Ing. Ph.D. (02.11.2018)
Microscopy techniques provide an efficient and unique approach to the study of fixed tissues and living cells with high specificity and sensitivity. Course aims to acquaint students with modern microscopy techniques for biology object imaging. Part of the workshop will be the introduction to automated wide-field, confocal and superresolution fluorescent microscopy. First, a brief introduction to the physical mechanisms underlying these imaging techniques will be given. Then we introduce the theoretical and/or practical basis of particular advanced imaging techniques. The basics of image analysis will be covered as well.
Výstupy studia předmětu -
Poslední úprava: Pátková Vlasta (08.06.2018)
Student se seznámí s moderními poznatky a metodikou v pokročilé mikroskopii biologických objektů, získá přehled o základech použitelných technik, což mu umožní kvalifikované rozhodnutí, kterou z nich zvolit při vědeckovýzkumné činnosti.
Poslední úprava: Pátková Vlasta (08.06.2018)
Student will be introduced to modern facts and methodology in advanced microscopy of biological objects, she/he will obtain an overview of possible techniques, which allows her/him more qualified decisions in scientific research activities.
Literatura -
Poslední úprava: Pátková Vlasta (08.06.2018)
Vědecké práce a online knihy z portfolia Nature Research, AAAS a dalších.
Poslední úprava: Pátková Vlasta (08.06.2018)
Scientific papers and online books from the portfolio of Nature Research, AAAS and others.
Aplikace fluorescenční mikrokopie - STED (Stimulated Emission Depletion microscopy), FLIM (Fluorescence-Lifetime Imaging Microscopy)
Analýza obrazu – úprava parametrů obrazu před snímáním, sofware pro zpracování a analýzu - dekonvoluce, 3D vizualizace, kolokalizace, tracking, korekce chromatických aberací.
Poslední úprava: Lipov Jan doc. Ing. Ph.D. (02.11.2018)
Fluorescence microscopy as a specific part of optical microscopy, quantification of fluorescence, fluorescent tags.
Confocal, multiphoton and correlation microscopy.
The application of fluorescence microscopy - FRAP (Fluorescence Recovery After Photobleaching), FRET (Förster Resonance Energy Transfer)
The application of fluorescence microscopy - TIRF (Total Internal Reflection Fluorescence), SIM (Structured Illumination Microscopy)
The application of fluorescence microscopy - PALM (PhotoActivated Localization Microscopy), STORM (Stochastic Optical Reconstruction Microscopy)
The application of fluorescence microscopy - STED (Stimulated Emission Depletion Microscopy), FLIM (Fluorescence-Lifetime Imaging Microscopy).
Image analysis – parameter ajdustment before acquisition, software for image processing and analysis – deconvolution, 3D visualization, colocalization, tracking, correction of chromatic abberations.
Vstupní požadavky -
Poslední úprava: Pátková Vlasta (08.06.2018)
Základní znalosti optiky a mikroskopických technik.
Poslední úprava: Pátková Vlasta (08.06.2018)
Basic knowledge in the field of optics and microscopic techniques.
