Přednesení příspěvku na vybrané téma, složení ústaní zkoušky

Presentation on a selected topic, oral exam

Z: Michael T. Madigan,‎ Kelly S. Bender,‎ Daniel H. Buckley,‎ W. Matthew Sattley,‎ David A. Stahl: Brock Biology of Microorganisms; Pearson 2017. ISBN-13: 978-0134261928, ISBN-10: 0134261925

Z: Eugene L. Madsen: Environmental Microbiology: From Genomes to Biogeochemistry; John Wiley & Sons 2011. ISBN 1444357980, 9781444357981

Z: Terry Gentry, Raina M. Maier, Ian L. Pepper, Charles P. Gerba: Environmental Microbiology; Academic Press 2008. ISBN 0123705193, 9780123705198.

D: Wen-Tso Liu, Janet K. Jansson: Environmental Molecular Microbiology; Horizon Scientific Press 2010. ISBN 1904455522, 9781904455523.

Z: Michael T. Madigan,‎ Kelly S. Bender,‎ Daniel H. Buckley,‎ W. Matthew Sattley,‎ David A. Stahl: Brock Biology of Microorganisms; Pearson 2017. ISBN-13: 978-0134261928, ISBN-10: 0134261925

Z: Eugene L. Madsen: Environmental Microbiology: From Genomes to Biogeochemistry; John Wiley & Sons 2011. ISBN 1444357980, 9781444357981

Z: Terry Gentry, Raina M. Maier, Ian L. Pepper, Charles P. Gerba: Environmental Microbiology; Academic Press 2008. ISBN 0123705193, 9780123705198.

D: Wen-Tso Liu, Janet K. Jansson: Environmental Molecular Microbiology; Horizon Scientific Press 2010. ISBN 1904455522, 9781904455523.

Vznik biosféry: klíčové události a podmínky v historii Země; model biochemické a biologické evoluce; původ organických molekul; svět RNA; evoluce buněčného života.

Mikrobiální diverzita a její složky: fyziologická, ekologická a morfologická diverzita mikroorganismů; energetické strategie mikroorganismů.

Fylogenetická diverzita mikroorganismů: mikrobiální taxonomie; mikrobiální evoluce; doména Bacteria; doména Archaea; doména Eukarya.

Biogeochemické cykly: uhlíkový cyklus; dusíkový cyklus; sírový cyklus; cyklus železa; cyklus halogenů; biogeochemické cykly vymknuté kontrole.

Biologický rozklad, biotransformace, bioremediace; strategie biologického rozkladu/bioremediace; případové studie bioremediace; evoluce katabolických enzymů a drah.

Mikrobiální společenstva a mikrobiální prostředí: struktura a organizace mikrobiálních společenstev; interakce; mikrobiální prostředí a stanoviště.

Laboratorní metody v mikrobiální ekologii; kultivační a omické techniky.

Fylogenetika a fylogenomika.

Formation of the biosphere: key events and conditions in the history of Earth; model of biochemical and biological evolution; origin of organic molecules; RNA world; cellular life evolution.

Microbial diversity and its components: physiological, ecological and morphological diversity of microorganisms; microbial fueling.

Phylogenetic diversity of microorganisms: microbial taxonomy; microbial evolution; domain Bacteria; domain Archaea; domain Eukarya.

Biogeochemical cycling: carbon cycle; nitrogen cycle; sulfur cycle; iron cycle; halogen cycle; biogeochemical cycles gone wild.

Biodegradation, biotransformation, bioremediation; biodegradation/bioremediation strategies; bioremediation case studies; evolution of catabolic enzymes and pathways.

Microbial communities and microbial environments: Structure and organization of microbial communities; interactions; microbial environments and habitats.

Laboratory methods in microbial ecology; cultivation and omics techniques.

Phylogenetics and phylogenomics.

https://isme-microbes.org/

http://aem.asm.org/

https://fems-microbiology.org/

https://isme-microbes.org/

http://aem.asm.org/

https://fems-microbiology.org/

Student po absolvování předmětu bude rozumět mikrobiální podstatě důležitých procesů probíhajících v životním prostředí a jejich významu pro udržení rovnováhy v biosféře. Zároveň si osvojí teoretické i praktické znalosti a dovednosti v oblasti analýzy mikrobiální diverzity.

Student will understand the basics of microbial processes proceeding in the environment and their implications for maintaining equilibrium in the biosphere. In addition, students will acquire both theoretical and practical knowledge in the field of microbial diversity analyses.

základní znalosti biochemie a mikrobiologie v rozsahu vyučovaném v bakalářských SP na VŠCHT Praha

Biochemistry

Microbiology