Účast na přednáškách je doporučená.

Written examination

Doporučená:

• Králová, Blanka. Bioanalytické metody. Praha: Vysoká škola chemicko-technologická, Fakulta potravinářské a biochemické technologie, 2001, 254 s. s. ISBN 80-7080-449-1.
• Káš, Jan, Kodíček, Milan, Valentová, Olga. Laboratorní techniky biochemie. Praha: VŠCHT, 2005, 258 s. s. ISBN 80-7080-586-2.
• Ruml, Tomáš, Rumlová, Michaela, Pačes, Václav. Genové inženýrství. Praha: Vysoká škola chemicko-technologická, 2007, s. ISBN 80-7080-499-8.
• Daussant J., Desvaux F.X.. Introduction to Immunochemical Techniques for Medical Diagnosis, Food Quality Control and Environmental Testing. Prague: ICT Prague, 2007, s. ISBN 978-80-7080-641-8.

R: Králová B., Rauch P., Bioanalytické metody, Vydavatelství VŠCHT Praha, 2. vydání 1995, ISBN 80-7080-449-1

R: Králová B., Rauch P., Fukal L., Bioanalytická chemie, Vydavatelství VŠCHT Praha, 2007, ISBN 80-7080-449-1

R: Káš J., Kodíček M., Valentová O., Laboratorní techniky biochemie, Praha 2005, ISBN 80-7080-586-2

R: Ruml T., Rumlová M., Pačes V., Genové inženýrství, Praha 2002, ISBN 80-7080-499-8

R: Daussant J., Desvaux F.-X., Introduction to immunochemical techniques for medical diagnosis, food quality control and environmental testing, 2007, ICT Press, 9788070806418

1. Úvod - definice bioanalytických metod, základy izolace a stabilita biologického materiálu.

2.-3. Enzymové metody - enzymy jako analytická činidla, stanovení substrátů a aktivátorů, enzymové metody v klinické a experimentální praxi.

4.-5. Imunochemické metody - princip, charakterizace interakce antigen-protilátka, příprava a použití protilátek, imunoprecipitační metody a jejich využití v praxi, citlivé techniky (ELISA), metody využívající radionuklidy.

6.-7. Elektroforetické metody - princip, SDS elektroforéza, isoelektrická fokusace, blotovací techniky, charakterizace analytů po dělení elektroforetickými metodami, barevná a chemiluminiscenční detekce.

8.-9. Genetické metody - princip, polymerasová řetězová reakce (PCR), detekce specifických sekvencí produktu in situ, stanovení primární sekvence nukleových kyselin.

10. In vitro techniky - Použití buněčných linií v bioanalytických metodách, biochemické a mikrobiologické metody v analytické chemii.

11.-12. Chromatografické techniky - kapalinová a plynová chromatografie, bioafinitní chromatografie.

13. OMICS metody - globální charakterizace a kvantifikace biomolekul.

14. Detekční limity a použití vybraných bioanalytických metod.

1. Definition of bioanalytical methods as methods based on biological recognition; Basics of molecules isolation from a biological material; Stability of biological materials.

2. Enzymes 1: Enzymes as analytical agents - introduction, kinetics of enzyme reactions; Methods for determination of substrates, activators and inhibitors of enzyme reactions.

3. Enzymes 2: Enzymes used in free and immobilized forms; Application of enzymatic methods in clinical and experimental practice.

4. Immunochemical methods 1: Principles of immunochemical methods - antigen, hapten, antibodies; Characterization of antigen-antibody interactions; Principles of the immune response; Antibodies - preparation, usage, polyclonal, monoclonal, recombinant.

5. Immunochemical methods 2: Classification of immunochemical methods; Immunoprecipitation methods and their use in practice - precipitation in solution, agglutination and passive agglutination; Sensitive immunochemical techniques (ELISA); Bioanalytical methods using radionuclides (suitable radionuclides, half-lives, detection methods, antibody labelling), RIA, radiometric methods, work with radionuclides.

6. Electrophoretic methods 1: Principles of electrophoretic methods - SDS electrophoresis, isoelectric focusing, capillary electrophoresis; immunoelectrophoretic methods.

7. Electrophoretic methods 2: Blotting techniques - western blot - detection, isolation and characterization of proteins after the electrophoretic separation, staining and chemiluminescence detection; Northern blot; Southern blot.

8. Genetic methods 1: Polymerase chain reaction (PCR), digital PCR, quantitative PCR, in situ detection of specific product sequences.

9: Genetic methods 2: DNA and RNA array; DNA sequencing; Application of genetic methods.

10. In vitro techniques: Use of cell lines in bioanalytical methods; Biochemical and microbiological methods in analytical chemistry.

11. Chromatographic techniques 1: LC, GC, bioaffinity chromatography, affinity precipitation, immunoaffinity biosensors.

12. Chromatographic techniques 2: Application of chromatographic techniques; Flow cytometry.

13. Mass spectrometry of biomolecules.

14. Detection limits and application of selected methods; Usage of modern analytical methods for biopolymers.

Přednášky v elektronické podobě jsou dostupné na: https://e-learning.vscht.cz

Další seznam doporučené literatury a odkazy na elektronické zdroje mohou být poskytnuty v rámci jednotlivých přednášek.

Additional list of suggested bibliography and electronic references will be provided within individual lectures.

Studenti budou umět:

Zvolit vhodnou bioanalytickou metodu pro konkrétní typ vzorku a cílovou molekulu s ohledem na požadovanou citlivost, specificitu a detekční limit.

Aplikovat a interpretovat výsledky běžných bioanalytických metod, včetně enzymových, imunochemických, elektroforetických, genetických, chromatografických a hmotnostně spektrometrických technik.

Orientovat se v odborné literatuře zaměřené na studium biomolekul a bioanalytické technologie, včetně schopnosti kriticky zhodnotit vhodnost použitých metod.

Prakticky rozpoznat možnosti a limity jednotlivých technik, včetně jejich využití v klinické, experimentální a výzkumné praxi.

Získat přehled o práci s biologickým materiálem, jeho stabilitě, izolaci a následné analýze pomocí in vitro technik a buněčných modelů.

Porovnat různé bioanalytické přístupy a zvolit vhodné metodické strategie podle typu biologické otázky nebo výzkumného cíle.

Students will be able to:

Choose suitable analytical method with appropriate detection limit.

Apply the chosen method for samples of different origin.

Orientate themselves in specialized literature concerning biomolecules issue.

Obtain wide knowledge of bioanalytical methods spectra including possibility and limits of their application.

Biochemie I

Biochemistry I