V rámci tohoto kurzu se účastníci seznámí s teoretickými základy těchto metod, naučí se navrhnout vhodné primery a prakticky si metody vyzkouší. Účastníci během kurzu využijí PCR všech tří generací ke stanovení přítomnosti a množství bakteriální kontaminace ve vzorku (modelová úloha).

1. den: Teoretické základy PCR, qPCR a dPCR, in silico analýza primerů, praktické aspekty PCR (volba teplotních programů, výpočty reakčních směsí), práce s PC programy pro qPCR a dPCR.

2. den: Návrh primerů, sestavení teplotních programů, výpočty reakčních směsí.

3. den: Příprava reakce a provedení PCR, agarosová ekektroforéza a její vyhodnocení; příprava reakce pro qPCR a její provedení.

4. den: Vyhodnocení výsledků qPCR, určení koncentrace, analýza křivky tání, určení efektivity amplifikace. Příprava reakce pro dPCR a její provedení.

5. den: Vyhodnocení výsledků dPCR, určení počtu kopií a koncentrace.