|
|
|
||
Poslední úprava: Mareš Jan doc. Ing. Ph.D. (14.06.2018)
|
|
||
Poslední úprava: Pátková Vlasta (20.04.2018)
Studenti budou po absolvování předmětu umět modelovat základní biologické procesy na úrovni jednotlivých buněk, interakcí supin buněk, orgánů a celého organismu. K modelování biologických procesů v prostoru a čase budou schopní zpracovávat 1D, 2D a 3D signály. K testování odezvy organismu na vnější podněty budou schopni připravovat samostatně experimenty na zařízení Vernier (ke snímání teploty, tlaku, EKG, ventilačních parametrů a svalové aktivity) a Walter (ke snímání zrakových a kognitivních evokovaných potenciálů a EEG). |
|
||
Poslední úprava: Mareš Jan doc. Ing. Ph.D. (14.06.2018)
Z: Reddy D.C.: Biomedical Signal Processing � Principles and Techniques, McGraw Hill, 2005,ISBN: 0070583889 D: Weitkunat R.: Digital Biosignal Processing, Elsevier, 1991, ISBN-10: 0444891447, ISBN-13: 978-0444891440 Z: Drongelen W., Signal Processing for Neuroscientists: An Introduction to the Analysis of Physiological Signals, Elsevier, 2007, ISBN-10: 0123708672 ISBN-13: 978-0123708670 D: Izhikevich E. M., Dynamical Systems in Neuroscience: The Geometry of Excitability and Bursting (Computational Neuroscience), The MIT Press, 2007, ISBN 0262090430, 9780262090438 |
|
||
Poslední úprava: Mareš Jan doc. Ing. Ph.D. (26.04.2018)
www.honeywellprocess.com/
www.mathworks.com/
www.ni.com/ |
|
||
Poslední úprava: Mareš Jan doc. Ing. Ph.D. (18.06.2018)
1. Přehled metod modelování biologických signálů, modelování řízení biologických systémů, homeostáza 2. Zobrazování signálů v časové a frekvenční oblasti, fázový portrét, Poincarého řezy, rekurentní zobrazení, typy signálů - deterministické, stochastické, fraktální a chaotické, výpočet základních charakteristik signálů, metody odstraňování rušivých složek 3. Chaos a dynamická analýza biologických signálů. Jednodimenzionální mapy a toky, dvoudimenzionální ekvilibria, chaotický dissipativní tok, Lyapunovovy exponenty, Kaplan-Yorkova dimenze, metody rekonstrukce stavového prostoru 4. Formáty biomedicínských dat: "Univerzální formát dat pro biosignály"(GDF, EDF), DICOM, proprietární formáty, databáze biologických signálů a "Data mining" metody, objektové a relační databáze 5. Analytický a po částech lineární model EKG, odhad parametrů normálního a patologického EKG. Komprese a přenos EKG 6. Modelování elektrické aktivity neuronu. Modelování reakce zástavy a rebound fenoménu, modelování sledování rytmu při fotostimulaci pomocí sítě chaotických neuronových oscilátorů. Modelování samoorganizace chaotických neuronových oscilátorů, modelování změn EEG při demenci 7. Modelování synchronizace v EEG, odhady globální synchronizace, anticipované synchronizace a synchronizace se zpožděním, fázové synchronizace. Diskrétní Hilbertova transformace, odhad okamžité fáze, odhad charakteristické frekvence. 8. Detekce, separace, lokalizace, klasifikace a modelování evokovaných potenciálů a sumačních akčních svalových potenciálů. Pronyho metoda 9. Kódování informace ve zrakovém a sluchovém analyzátoru, modelování komunikace v biomedicínských objektech, Grangerova kauzalita, spektrální Grangerova kauzalita, parciální směrová koherence, směrová přenosová funkce a kortikomuskulární koherence 10. Biostatistika, nejčastější chyby při testování hypotéz v biomedicínských studiích, statistické parametrické mapování a Bonferroniho korekce, metody využívané při epidemiologických studiích, testování hypotéz typu osoba v čase, Kaplan-Meierův estimátor, Weibull model, nelineární statistika, 11. Analýza textur v ultrazvukové diagnostice, segmentace, registrace, vizualizace a simulace, Procrustova metoda registrace, histogram kookurence, Haralickovy texturní příznaky 12. Trojrozměrná segmentace, klasifikace a modelování tkání z dvojrozměrných obrazů magnetické rezonance 13. Výběr příznaků biomedicínských dat, metody klasifikace, rozhodování a expertní systémy v medicíně Cvičení: Automatická identifikace nádorů plic ze snímků počítačové tomografie plic 14. Pokročilé metody modelování v biologii a fyziologii, výhody a nevýhody Simulinku, jazyka Modelica, simulátor QCP, QHP/Hummod, Golem. |
|
||
Poslední úprava: Pátková Vlasta (20.04.2018)
žádné |
|
||
Poslední úprava: Mareš Jan doc. Ing. Ph.D. (26.04.2018)
Vypracování a obhajoba pěti ročníkových projektů: 0 - 25 bodů
Ústní zkouška: 0-75 bodů
Celkové bodové hodnocení: 100-90 A, 89-80 B, 79-70 C, 69-60 D, 59-50 E, méně než 50 F. |
Zátěž studenta | ||||
Činnost | Kredity | Hodiny | ||
Obhajoba individuálního projektu | 1 | 28 | ||
Účast na přednáškách | 1 | 28 | ||
Práce na individuálním projektu | 1 | 28 | ||
Účast na seminářích | 1 | 28 | ||
4 / 4 | 112 / 112 |