PředmětyPředměty(verze: 855)
Předmět, akademický rok 2019/2020
  
Syntetická biologie a geneticky modifikované organismy - M320020
Anglický název: Synthetic biology and genetically modified organisms
Zajišťuje: Ústav biochemie a mikrobiologie (320)
Platnost: od 2019
Semestr: letní
Body: letní s.:4
E-Kredity: letní s.:4
Způsob provedení zkoušky: letní s.:
Rozsah, examinace: letní s.:3/0 Zk [hodiny/týden]
Počet míst: neomezen / neurčen (neurčen)
Minimální obsazenost: neomezen
Jazyk výuky: čeština
Způsob výuky: prezenční
Úroveň:  
Pro druh: navazující magisterské
Poznámka: předmět je možno zapsat mimo plán
povolen pro zápis po webu
Garant: Zdeňková Kamila Ing. Ph.D.
Viktorová Jitka Ing. Ph.D.
Záměnnost : N320062
Termíny zkoušek   Rozvrh   
Anotace -
Poslední úprava: Viktorová Jitka Ing. Ph.D. (24.01.2018)
Předmět je zaměřen na organismy modifikované genetickými metodami s cílem prohloubit znalosti v oblasti genového inženýrství a možnosti jeho využití. Probírány jsou jednotlivé metodiky přípravy, využití a možnosti detekce modifikovaných mikroorganismů, rostlin i živočichů. Pozornost je věnována také nových technikám šlechtění zahrnujícími i epigenetické změny. Probírány jsou rovněž příklady využití metod editace genomu i rozsáhlejších změn organismů (SynBio). Ve výuce je zahrnuta legislativa týkající se nakládání s GMO, práce s databázemi, etika používání a odhad potenciálního rizika modifikovaných organismů.
Výstupy studia předmětu -
Poslední úprava: Zdeňková Kamila Ing. Ph.D. (23.01.2018)

Studenti budou umět:

• orientovat se v možnostech využití geneticky modifikovaných organismů;

• navrhnout strategii přípravy modifikovaného organismu;

• detekovat GMO, případně produkty z GMO;

• znát konkrétní možnosti využití syntetické biologie;

• pracovat se sekvencí DNA v internetových databázích a programech.

Literatura -
Poslední úprava: Zdeňková Kamila Ing. Ph.D. (23.01.2018)

Původní a přehledné články ve vědeckých a odborných periodikách, patentová literatura, monografie, elektronické knihy.

Primrose S.B., Twyman R.M., Old R. W.: Principles of Gene Manipulation and Genomics, Blackwell Publishing, 2006. ISBN-13: 978-1405135443.

Altman A., Haseqawa P. M.: Plant Biotechnology and Agriculture: Prospects for the 21st Century 1st Edition,Elsevier, 2012. ISBN-13: 978-0123814661

Slater A., Scott W., Fowler M.R., Plant Biotechnology, Oxford, 9780199282616

Zhao, Huimin: Synthetic biology: tools and applications. Edited by Huimin Zhao. Amsterdam: Elsevier, 2013, 333. ISBN 9780123944306.

Schmudt M.: Synthetic biology: industrial and environmental applications. Weinheim: Wiley-Blackwell, 2012. 240. ISBN 9783527331833.

Studijní opory -
Poslední úprava: Zdeňková Kamila Ing. Ph.D. (23.01.2018)

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

http://www.mzp.cz/

http://eagri.cz/public/web/mze/

http://www.efsa.europa.eu/

Sylabus -
Poslední úprava: Zdeňková Kamila Ing. Ph.D. (23.01.2018)

1. Význam geneticky modifikovaných organismů, základní pojmy. Současná legislativa a značení produktů jako „GMO free“.

2. Strategie příprav geneticky modifikovaných organismů.

3. Příprava geneticky modifikovaných mikroorganismů.

4. Využití geneticky modifikovaných mikroorganismů.

5. Příprava geneticky modifikovaných rostlin.

6. Využití geneticky modifikovaných rostlin.

7. Příprava a využití geneticky modifikovaných živočichů.

8. Nové techniky šlechtění (NBT), nukleasy rozpoznávající specifickou sekvenci nukleové kyseliny ZFN, TALENy a CRISPR. Oprava zlomů DNA – nehomologní spojení konců a homologní rekombinace. Příklady organismů připravených prostřednictvím NBT a jejich využití.

9. Postup editace rostlinného genomu, editace populací živočichů (gene drive), detekce editace.

10. Epigenetika, metody studia epigenetických jevů, technika RNA dependentní DNA metylace (RdDM).

11. Metody stanovení a kvantifikace transgenních organismů.

12. Definice a stručný přehled historie oboru Syntetická biologie (SynBio). Minimální genom a transplantace syntetického genomu bakterie.

13. Další příklady možného využití SynBio:Analogy nukleových kyselin (angl. Xeno nucleic acid (XNA); DNA bricks; BioBrick (soutež iGEM); metabolické inženýrství a další.

14. Bioinformatika, databáze, návrh primerů. Etika používání a potenciální rizika modifikovaných organismů (biobezpečnost a bioochrana).

Studijní prerekvizity -
Poslední úprava: Zdeňková Kamila Ing. Ph.D. (23.01.2018)

Molekulová genetika

Podmínky zakončení předmětu -
Poslední úprava: Zdeňková Kamila Ing. Ph.D. (26.01.2018)

Vypracování seminární práce, absolvování zápočtového a zkouškového testu.

Zátěž studenta
Činnost Kredity Hodiny
Účast na přednáškách 1 28
Práce na individuálním projektu 1 28
Příprava na zkoušku a její absolvování 2 56
4 / 4 112 / 112
Hodnocení studenta
Forma Váha
Aktivní účast na výuce 25
Zkouškový test 50
Průběžné a zápočtové testy 25

 
VŠCHT Praha